MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Sulfolobus islandicus M.16.4 chromosome

Total Repeats: 4587

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012726	CAT	2	6	24	29	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_012726	TAT	2	6	30	35	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012726	ATT	2	6	291	296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012726	ATT	2	6	384	389	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012726	TAA	2	6	435	440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012726	TAT	2	6	4874	4879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012726	TAT	2	6	5840	5845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012726	AAG	2	6	5878	5883	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012726	ACA	2	6	5897	5902	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_012726	ATT	2	6	6053	6058	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012726	GAA	2	6	6095	6100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012726	ATC	2	6	6189	6194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_012726	TCA	2	6	6212	6217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_012726	GTA	2	6	9070	9075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_012726	ATT	2	6	16340	16345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012726	TAA	2	6	17845	17850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_012726	TAT	2	6	17907	17912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012726	CAT	2	6	17933	17938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_012726	ATT	2	6	17979	17984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_012726	TAT	2	6	17994	17999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_012726	GAT	2	6	24563	24568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012726	TGA	2	6	24592	24597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012726	GAT	2	6	24616	24621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_012726	ATA	2	6	24664	24669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_012726	TAA	2	6	27070	27075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_012726	TAG	2	6	27089	27094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_012726	TTA	2	6	31433	31438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_012726	AGA	2	6	31465	31470	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012726	ATC	2	6	32780	32785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_012726	ACA	2	6	32790	32795	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_012726	TAA	2	6	34216	34221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012726	TAC	2	6	34252	34257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_012726	GGT	2	6	34267	34272	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_012726	ACT	2	6	36979	36984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_012726	GAT	2	6	38617	38622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_012726	CTG	2	6	38658	38663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_012726	ATT	2	6	38689	38694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012726	TTC	2	6	38715	38720	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_012726	GGT	2	6	38730	38735	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_012726	TAA	2	6	38781	38786	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_012726	TAA	2	6	38875	38880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_012726	ATT	2	6	38988	38993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_012726	GTT	2	6	44736	44741	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_012726	TTA	2	6	44755	44760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_012726	ATC	2	6	44775	44780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_012726	TAA	2	6	45874	45879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_012726	GTT	2	6	45887	45892	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_012726	TGA	2	6	45944	45949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_012726	TCT	2	6	45977	45982	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_012726	TTA	2	6	48221	48226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_012726	AGA	2	6	48233	48238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_012726	TAT	2	6	48257	48262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_012726	TAT	2	6	49685	49690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_012726	ATA	2	6	49691	49696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_012726	TTC	2	6	50873	50878	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_012726	TTG	2	6	50915	50920	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_012726	CAA	2	6	51030	51035	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_012726	AGA	2	6	58215	58220	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_012726	TAA	2	6	58899	58904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_012726	AAG	2	6	58936	58941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_012726	TCC	2	6	58966	58971	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_012726	TGA	2	6	58987	58992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_012726	ATG	2	6	59012	59017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_012726	CTT	2	6	61071	61076	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_012726	TAT	2	6	65390	65395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_012726	ATT	2	6	65474	65479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_012726	TTG	2	6	68098	68103	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_012726	TAA	2	6	68144	68149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_012726	ACT	2	6	68859	68864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_012726	TTC	2	6	68932	68937	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_012726	TAA	2	6	68976	68981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_012726	TAA	2	6	69024	69029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_012726	TAT	2	6	69030	69035	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_012726	TTC	2	6	69620	69625	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_012726	CAT	3	9	69646	69654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_012726	TAT	2	6	71595	71600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_012726	AAC	2	6	72031	72036	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_012726	GAT	2	6	72951	72956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_012726	AAT	2	6	72978	72983	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_012726	ATA	2	6	74410	74415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_012726	AAG	2	6	74449	74454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_012726	ATA	2	6	80771	80776	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_012726	CTT	2	6	82144	82149	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_012726	ATA	2	6	82179	82184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_012726	TAA	2	6	87585	87590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_012726	TCT	2	6	88376	88381	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_012726	TAT	2	6	90822	90827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_012726	ATT	2	6	90856	90861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_012726	GTT	2	6	90875	90880	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_012726	TTA	2	6	90906	90911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_012726	TTA	2	6	90998	91003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_012726	TTA	2	6	92133	92138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_012726	CAA	2	6	92333	92338	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_012726	TAC	2	6	93067	93072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_012726	TAT	2	6	93092	93097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_012726	ATA	2	6	93116	93121	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_012726	TCA	2	6	94562	94567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_012726	TTG	2	6	101160	101165	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_012726	TCA	2	6	101194	101199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_012726	ATA	2	6	101284	101289	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_012726	ATA	2	6	101324	101329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_012726	TAA	2	6	101392	101397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_012726	GTT	2	6	101478	101483	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_012726	TTA	2	6	101516	101521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_012726	AAT	2	6	101527	101532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_012726	ATA	2	6	101577	101582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_012726	TGA	2	6	101644	101649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_012726	TCA	2	6	101686	101691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_012726	ATC	2	6	101718	101723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_012726	CTA	2	6	101785	101790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_012726	TAG	2	6	101797	101802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_012726	ATT	2	6	101803	101808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_012726	CTA	4	12	101985	101996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_012726	TGC	2	6	104010	104015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_012726	TTA	2	6	104174	104179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_012726	TTA	2	6	109652	109657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_012726	ATA	2	6	113122	113127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_012726	TAA	2	6	113171	113176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_012726	ATT	2	6	114690	114695	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_012726	ATT	3	9	114807	114815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_012726	CAT	2	6	115169	115174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_012726	ATT	2	6	115202	115207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_012726	AGG	2	6	115260	115265	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_012726	CTT	2	6	115297	115302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_012726	TCA	2	6	115310	115315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_012726	TGT	2	6	115316	115321	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_012726	TAA	2	6	115370	115375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_012726	TAC	2	6	115391	115396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_012726	TTA	2	6	115593	115598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_012726	GTT	2	6	115604	115609	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_012726	TAT	2	6	115712	115717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_012726	AAT	2	6	115725	115730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_012726	TGA	2	6	115762	115767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_012726	TTA	2	6	115818	115823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_012726	GTT	2	6	115891	115896	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_012726	TGG	2	6	115944	115949	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
137	NC_012726	TGA	2	6	115958	115963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_012726	ACT	3	9	115969	115977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_012726	AGT	2	6	115997	116002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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