MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Sulfolobus islandicus M.16.4 chromosome

Total Repeats: 8135

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_012726	ATT	2	6	268965	268970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_012726	AATA	2	8	268983	268990	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_012726	AAG	2	6	269055	269060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
504	NC_012726	TAG	2	6	269092	269097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
505	NC_012726	TCTCA	2	10	269134	269143	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
506	NC_012726	TTG	2	6	269161	269166	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
507	NC_012726	TAG	2	6	269180	269185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
508	NC_012726	CTA	2	6	269376	269381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
509	NC_012726	TTA	2	6	269412	269417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_012726	ATT	2	6	269436	269441	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_012726	ATA	2	6	269442	269447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_012726	ATT	2	6	269490	269495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_012726	A	7	7	269541	269547	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_012726	TTC	2	6	269551	269556	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
515	NC_012726	TAA	2	6	271077	271082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_012726	TA	3	6	271114	271119	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_012726	A	6	6	271156	271161	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_012726	ACTG	2	8	271176	271183	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
519	NC_012726	ATA	2	6	271204	271209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_012726	TTAT	2	8	271211	271218	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_012726	TAT	2	6	271231	271236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_012726	TA	3	6	271264	271269	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_012726	CTT	2	6	272372	272377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
524	NC_012726	TAT	2	6	272384	272389	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_012726	T	6	6	272413	272418	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_012726	AGT	2	6	272423	272428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
527	NC_012726	T	6	6	273952	273957	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_012726	A	6	6	273970	273975	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_012726	AGG	2	6	275685	275690	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
530	NC_012726	TAA	2	6	276830	276835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_012726	A	6	6	276834	276839	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_012726	TCAAT	2	10	278869	278878	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
533	NC_012726	AATA	2	8	279929	279936	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_012726	ATAA	2	8	279938	279945	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
535	NC_012726	AAG	2	6	279947	279952	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
536	NC_012726	AT	4	8	280015	280022	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_012726	ATT	2	6	281535	281540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_012726	TA	3	6	281594	281599	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
539	NC_012726	ATTGAT	2	12	281618	281629	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
540	NC_012726	TA	3	6	281780	281785	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_012726	AT	3	6	281836	281841	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_012726	GAT	2	6	281848	281853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
543	NC_012726	TTC	2	6	281873	281878	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
544	NC_012726	TGG	2	6	281886	281891	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
545	NC_012726	TCC	2	6	282244	282249	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
546	NC_012726	ACT	2	6	282255	282260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
547	NC_012726	GAT	2	6	282489	282494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
548	NC_012726	GAG	2	6	282495	282500	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
549	NC_012726	GATAAG	2	12	282574	282585	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
550	NC_012726	GTT	2	6	282639	282644	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
551	NC_012726	AAGC	2	8	282724	282731	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
552	NC_012726	TTG	2	6	282740	282745	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
553	NC_012726	TTG	2	6	282751	282756	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
554	NC_012726	AGA	2	6	282762	282767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
555	NC_012726	ATA	2	6	282781	282786	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_012726	AGG	2	6	282799	282804	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
557	NC_012726	GGA	2	6	282871	282876	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
558	NC_012726	TTAA	2	8	282884	282891	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_012726	GGA	2	6	282970	282975	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
560	NC_012726	AGGA	2	8	282986	282993	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
561	NC_012726	TTTCC	2	10	283014	283023	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
562	NC_012726	TTTGA	2	10	283109	283118	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
563	NC_012726	TGAT	2	8	283143	283150	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
564	NC_012726	GTG	2	6	283155	283160	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
565	NC_012726	CTATTA	2	12	283164	283175	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
566	NC_012726	CT	3	6	283248	283253	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
567	NC_012726	TGT	2	6	283294	283299	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
568	NC_012726	GAA	2	6	283321	283326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
569	NC_012726	GAG	2	6	283339	283344	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
570	NC_012726	TTA	2	6	283404	283409	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_012726	GTTA	2	8	283438	283445	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
572	NC_012726	TAC	2	6	283456	283461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
573	NC_012726	A	7	7	283492	283498	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_012726	CTTA	2	8	283524	283531	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
575	NC_012726	AAC	2	6	284752	284757	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
576	NC_012726	ATA	2	6	285685	285690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_012726	TA	3	6	285689	285694	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NC_012726	T	6	6	285700	285705	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
579	NC_012726	AG	3	6	285720	285725	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
580	NC_012726	TAA	2	6	287608	287613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
581	NC_012726	AAAT	2	8	287627	287634	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
582	NC_012726	ATA	2	6	288582	288587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
583	NC_012726	ATA	2	6	288602	288607	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_012726	TTA	2	6	288633	288638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
585	NC_012726	TA	3	6	288642	288647	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
586	NC_012726	T	7	7	290363	290369	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
587	NC_012726	GAA	2	6	290378	290383	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
588	NC_012726	ATTA	2	8	290385	290392	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_012726	AT	3	6	292202	292207	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
590	NC_012726	T	6	6	292223	292228	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
591	NC_012726	AAT	2	6	292316	292321	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_012726	CAA	2	6	293188	293193	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
593	NC_012726	AAT	2	6	293204	293209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_012726	AT	3	6	293208	293213	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_012726	TAG	2	6	293861	293866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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597	NC_012726	CTA	2	6	293880	293885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
598	NC_012726	TTG	2	6	293901	293906	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
599	NC_012726	ATT	2	6	293947	293952	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
600	NC_012726	TAAA	2	8	293956	293963	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
601	NC_012726	TAA	2	6	296271	296276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NC_012726	TAA	2	6	296337	296342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_012726	TA	3	6	296431	296436	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_012726	A	6	6	296505	296510	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
605	NC_012726	TTA	2	6	296520	296525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
606	NC_012726	AAAG	2	8	296545	296552	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
607	NC_012726	GGTT	2	8	296577	296584	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
608	NC_012726	TTC	2	6	296596	296601	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
609	NC_012726	ATGAT	2	10	296885	296894	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
610	NC_012726	ATTT	2	8	296921	296928	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_012726	TAG	2	6	297199	297204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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613	NC_012726	ACA	2	6	297225	297230	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
614	NC_012726	CAT	2	6	297262	297267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
615	NC_012726	CTT	2	6	297288	297293	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
616	NC_012726	TCC	2	6	297446	297451	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
617	NC_012726	TTGT	2	8	297453	297460	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
618	NC_012726	ATGTT	2	10	297508	297517	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
619	NC_012726	AAT	2	6	297547	297552	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
620	NC_012726	TTG	2	6	297559	297564	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
621	NC_012726	GAT	2	6	297566	297571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
622	NC_012726	GGA	2	6	297631	297636	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
623	NC_012726	TCG	2	6	297766	297771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
624	NC_012726	TACT	2	8	297793	297800	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
625	NC_012726	ATT	2	6	297827	297832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_012726	TTA	2	6	298470	298475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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628	NC_012726	ATA	2	6	298628	298633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_012726	ATTC	2	8	298652	298659	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
630	NC_012726	CT	3	6	298663	298668	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
631	NC_012726	GTC	2	6	298705	298710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
632	NC_012726	CTT	2	6	298737	298742	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
633	NC_012726	CTT	2	6	298803	298808	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
634	NC_012726	GGC	2	6	298840	298845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
635	NC_012726	AGT	2	6	298878	298883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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637	NC_012726	TTA	2	6	299193	299198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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639	NC_012726	GAG	2	6	299260	299265	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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