MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Sulfolobus islandicus M.16.4 chromosome

Total Repeats: 8135

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_012726	AGG	2	6	1261933	1261938	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5002	NC_012726	TA	3	6	1262279	1262284	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5003	NC_012726	AGA	2	6	1263820	1263825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5004	NC_012726	A	6	6	1263845	1263850	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5005	NC_012726	GA	3	6	1263869	1263874	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_012726	TA	3	6	1263883	1263888	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5007	NC_012726	TAA	2	6	1265977	1265982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5008	NC_012726	CTTC	2	8	1266027	1266034	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5009	NC_012726	ATTA	2	8	1266088	1266095	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5010	NC_012726	GAA	2	6	1266146	1266151	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5011	NC_012726	GT	3	6	1266212	1266217	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5012	NC_012726	ATA	2	6	1269114	1269119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5013	NC_012726	TA	3	6	1269144	1269149	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5014	NC_012726	TAA	2	6	1269188	1269193	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5015	NC_012726	TAT	2	6	1269488	1269493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5016	NC_012726	CGA	2	6	1269550	1269555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5017	NC_012726	AGA	2	6	1269562	1269567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5018	NC_012726	A	6	6	1269591	1269596	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5019	NC_012726	TGC	2	6	1269614	1269619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5020	NC_012726	CTT	2	6	1272341	1272346	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5021	NC_012726	ACC	2	6	1272512	1272517	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5022	NC_012726	CAC	2	6	1272817	1272822	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5023	NC_012726	C	6	6	1272858	1272863	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5024	NC_012726	A	6	6	1272870	1272875	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5025	NC_012726	T	6	6	1272879	1272884	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5026	NC_012726	GAATT	2	10	1272902	1272911	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
5027	NC_012726	TA	3	6	1272984	1272989	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5028	NC_012726	A	6	6	1273212	1273217	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5029	NC_012726	CTT	2	6	1273218	1273223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5030	NC_012726	T	6	6	1273222	1273227	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5031	NC_012726	TC	4	8	1273230	1273237	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5032	NC_012726	TCT	3	9	1273244	1273252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5035	NC_012726	T	7	7	1273603	1273609	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5036	NC_012726	TA	3	6	1273618	1273623	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5037	NC_012726	TTC	2	6	1273666	1273671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5038	NC_012726	TAAT	2	8	1273716	1273723	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5039	NC_012726	TTTC	2	8	1273736	1273743	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5040	NC_012726	AAT	2	6	1273747	1273752	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5041	NC_012726	AAG	2	6	1273758	1273763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_012726	TAT	3	9	1273788	1273796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5043	NC_012726	AT	3	6	1273795	1273800	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5044	NC_012726	ATA	2	6	1273809	1273814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5045	NC_012726	T	6	6	1274098	1274103	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5048	NC_012726	TC	4	8	1275244	1275251	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5049	NC_012726	GGT	2	6	1275270	1275275	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5054	NC_012726	ATT	2	6	1275490	1275495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5055	NC_012726	ATT	2	6	1275528	1275533	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5056	NC_012726	ATTC	2	8	1275547	1275554	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5057	NC_012726	AT	3	6	1275556	1275561	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5058	NC_012726	CAG	2	6	1275648	1275653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5059	NC_012726	TAAAA	2	10	1275702	1275711	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5060	NC_012726	A	6	6	1275722	1275727	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5061	NC_012726	ATT	2	6	1276042	1276047	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5062	NC_012726	TTTA	2	8	1278563	1278570	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5063	NC_012726	GAT	2	6	1279944	1279949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5065	NC_012726	ATGA	2	8	1287486	1287493	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5066	NC_012726	AT	3	6	1287949	1287954	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5069	NC_012726	AGG	2	6	1288017	1288022	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5073	NC_012726	TAA	2	6	1290001	1290006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5078	NC_012726	GATA	2	8	1290075	1290082	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5079	NC_012726	T	6	6	1290086	1290091	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5081	NC_012726	GGT	2	6	1292294	1292299	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5082	NC_012726	TATT	2	8	1292453	1292460	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5083	NC_012726	TTA	3	9	1292465	1292473	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5084	NC_012726	ATA	2	6	1292510	1292515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5085	NC_012726	TTAA	2	8	1292520	1292527	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5086	NC_012726	AGT	2	6	1292549	1292554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5088	NC_012726	ATT	2	6	1292633	1292638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5089	NC_012726	ATT	2	6	1292641	1292646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5093	NC_012726	CAAGA	2	10	1296499	1296508	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
5094	NC_012726	TAA	2	6	1296519	1296524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5098	NC_012726	A	6	6	1296632	1296637	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5099	NC_012726	CCG	2	6	1296709	1296714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5100	NC_012726	GGT	2	6	1296765	1296770	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5101	NC_012726	CGG	2	6	1296789	1296794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5102	NC_012726	CTT	2	6	1296797	1296802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5103	NC_012726	AAT	2	6	1296808	1296813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5104	NC_012726	GAT	2	6	1296831	1296836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5106	NC_012726	AT	4	8	1298208	1298215	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5107	NC_012726	CT	3	6	1298292	1298297	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5108	NC_012726	ATA	2	6	1298357	1298362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5109	NC_012726	CTAA	2	8	1298367	1298374	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5110	NC_012726	TCTT	2	8	1298438	1298445	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5111	NC_012726	ATA	2	6	1298521	1298526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5112	NC_012726	TAA	2	6	1298539	1298544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5113	NC_012726	AGCTA	2	10	1298740	1298749	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
5114	NC_012726	G	6	6	1300137	1300142	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5115	NC_012726	TAA	2	6	1300245	1300250	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5123	NC_012726	A	6	6	1300525	1300530	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5124	NC_012726	ATT	2	6	1300620	1300625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5125	NC_012726	CAG	3	9	1300656	1300664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5127	NC_012726	TAT	2	6	1300689	1300694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5128	NC_012726	TTA	2	6	1300797	1300802	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5129	NC_012726	GTT	2	6	1301000	1301005	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5130	NC_012726	TAC	2	6	1301037	1301042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5131	NC_012726	TTGA	2	8	1301070	1301077	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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5133	NC_012726	GGA	2	6	1302204	1302209	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5134	NC_012726	GTT	2	6	1302327	1302332	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5135	NC_012726	AGT	2	6	1302335	1302340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5136	NC_012726	TCT	2	6	1302375	1302380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5138	NC_012726	GAT	2	6	1302393	1302398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5142	NC_012726	AG	3	6	1302467	1302472	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5143	NC_012726	TAC	2	6	1302488	1302493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5163	NC_012726	GTAA	2	8	1324132	1324139	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5164	NC_012726	AAG	2	6	1324140	1324145	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5190	NC_012726	AAAG	2	8	1345540	1345547	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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5211	NC_012726	AT	3	6	1346643	1346648	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5249	NC_012726	ACATTC	2	12	1348519	1348530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5251	NC_012726	CTT	2	6	1348567	1348572	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5252	NC_012726	CAA	2	6	1348594	1348599	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5253	NC_012726	ATA	2	6	1348631	1348636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5254	NC_012726	TAA	2	6	1348641	1348646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5255	NC_012726	AAG	2	6	1348678	1348683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5256	NC_012726	TA	3	6	1349976	1349981	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5257	NC_012726	TGA	3	9	1350021	1350029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5258	NC_012726	TGA	2	6	1350045	1350050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5259	NC_012726	CGG	2	6	1350186	1350191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5260	NC_012726	T	6	6	1350203	1350208	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5261	NC_012726	ACT	2	6	1350217	1350222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5262	NC_012726	TAT	2	6	1350269	1350274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5264	NC_012726	T	7	7	1350298	1350304	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5393	NC_012726	A	6	6	1465891	1465896	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5394	NC_012726	CAA	2	6	1466331	1466336	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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