MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Sulfolobus islandicus M.16.27 chromosome

Total Repeats: 10163

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_012632	TCT	2	6	338514	338519	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1002	NC_012632	TTAT	2	8	338531	338538	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_012632	CT	3	6	338813	338818	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1004	NC_012632	GAA	2	6	338874	338879	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_012632	CCTTC	2	10	338894	338903	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
1006	NC_012632	ACT	2	6	338953	338958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1007	NC_012632	CCA	2	6	339001	339006	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1008	NC_012632	TC	3	6	339063	339068	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1009	NC_012632	TCC	2	6	339088	339093	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1010	NC_012632	AGT	2	6	339106	339111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_012632	TCC	2	6	339203	339208	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1012	NC_012632	TTC	2	6	339213	339218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1013	NC_012632	CCT	2	6	339274	339279	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1014	NC_012632	CTC	2	6	339302	339307	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1015	NC_012632	GTC	2	6	339377	339382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1016	NC_012632	CTT	2	6	339401	339406	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1017	NC_012632	ATA	2	6	339419	339424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_012632	TAT	2	6	340352	340357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_012632	TTTA	2	8	340367	340374	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_012632	TA	3	6	340411	340416	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_012632	AAAG	2	8	340419	340426	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_012632	CTT	2	6	340507	340512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1023	NC_012632	TAA	2	6	340608	340613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_012632	AAAAAT	2	12	340695	340706	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_012632	T	6	6	340761	340766	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_012632	TAA	2	6	340823	340828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_012632	TTTTAA	2	12	340874	340885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_012632	TA	3	6	340903	340908	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_012632	A	6	6	340934	340939	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_012632	TTA	2	6	340945	340950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_012632	TTC	2	6	342357	342362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1032	NC_012632	TAA	2	6	343028	343033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_012632	TTG	2	6	343067	343072	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_012632	AAT	2	6	343088	343093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_012632	TTCA	2	8	343094	343101	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1036	NC_012632	TAT	2	6	343119	343124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_012632	TA	3	6	343166	343171	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_012632	GTT	2	6	343184	343189	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_012632	GTA	2	6	344336	344341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_012632	AAC	2	6	344373	344378	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1041	NC_012632	ATA	2	6	344389	344394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_012632	TA	3	6	344415	344420	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_012632	TTCA	2	8	344421	344428	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1044	NC_012632	TAC	2	6	344824	344829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1045	NC_012632	TAT	2	6	344850	344855	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_012632	TAA	2	6	344870	344875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_012632	AAT	2	6	344882	344887	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_012632	AAT	2	6	344891	344896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_012632	TTG	2	6	344916	344921	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_012632	ATT	2	6	344948	344953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_012632	TAGA	2	8	344955	344962	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_012632	AGGAG	2	10	344988	344997	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_012632	CTG	2	6	345096	345101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1054	NC_012632	A	6	6	345116	345121	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_012632	GGTA	2	8	345125	345132	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_012632	GGT	2	6	345155	345160	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_012632	TC	3	6	345222	345227	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1058	NC_012632	TTA	2	6	345300	345305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_012632	TAA	2	6	345313	345318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_012632	TGAAA	2	10	345343	345352	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_012632	TTG	2	6	345369	345374	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_012632	ATG	2	6	345447	345452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_012632	CTT	2	6	345495	345500	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1064	NC_012632	TTG	2	6	345513	345518	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_012632	TAAAT	2	10	345572	345581	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_012632	ATGGC	2	10	345594	345603	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1067	NC_012632	A	6	6	345618	345623	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_012632	TGAC	2	8	345627	345634	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1069	NC_012632	TTTC	2	8	345665	345672	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1070	NC_012632	GAT	2	6	345678	345683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_012632	TTTC	2	8	345690	345697	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1072	NC_012632	ATG	2	6	345718	345723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_012632	A	6	6	345772	345777	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_012632	A	7	7	345799	345805	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_012632	TTA	2	6	346511	346516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_012632	AT	4	8	346541	346548	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_012632	ATAA	2	8	346553	346560	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_012632	TA	3	6	346634	346639	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_012632	A	7	7	346650	346656	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_012632	CCGTTC	2	12	346675	346686	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
1081	NC_012632	T	6	6	346690	346695	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_012632	GA	3	6	346808	346813	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_012632	T	7	7	346875	346881	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_012632	TACT	2	8	346883	346890	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1085	NC_012632	T	6	6	346890	346895	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_012632	TTG	2	6	346906	346911	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_012632	GTTT	2	8	346915	346922	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_012632	ATTTTT	2	12	346964	346975	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_012632	GAAT	2	8	347041	347048	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_012632	AGA	2	6	347066	347071	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_012632	GA	3	6	347070	347075	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_012632	A	6	6	347078	347083	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_012632	T	6	6	347089	347094	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_012632	TCGG	2	8	347302	347309	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1095	NC_012632	TA	3	6	347315	347320	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_012632	TA	3	6	347341	347346	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_012632	A	6	6	347403	347408	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_012632	A	6	6	347411	347416	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_012632	T	6	6	347429	347434	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_012632	A	6	6	347451	347456	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_012632	GA	3	6	347471	347476	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_012632	ATC	2	6	347738	347743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1103	NC_012632	GAT	2	6	347750	347755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_012632	T	6	6	347766	347771	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_012632	GAA	2	6	347775	347780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_012632	A	7	7	347786	347792	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_012632	A	6	6	348170	348175	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_012632	CT	3	6	348203	348208	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1109	NC_012632	CAA	2	6	348227	348232	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1110	NC_012632	A	6	6	348231	348236	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_012632	ACA	2	6	348241	348246	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1112	NC_012632	CT	3	6	348276	348281	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1113	NC_012632	TAA	2	6	348386	348391	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_012632	GAAGG	2	10	348423	348432	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_012632	T	6	6	351126	351131	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_012632	TACT	2	8	351140	351147	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1117	NC_012632	TTTTA	2	10	351148	351157	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_012632	GTT	2	6	351169	351174	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_012632	ATT	2	6	351177	351182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_012632	ATT	2	6	351187	351192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_012632	TTA	2	6	351215	351220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_012632	T	6	6	351229	351234	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_012632	GA	3	6	351272	351277	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_012632	TC	3	6	351345	351350	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1125	NC_012632	TAAA	2	8	351481	351488	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_012632	TAA	2	6	351491	351496	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_012632	GAA	2	6	351529	351534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_012632	TA	3	6	351550	351555	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_012632	ATT	2	6	351557	351562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_012632	TA	3	6	351567	351572	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_012632	ATA	3	9	351570	351578	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_012632	AT	3	6	351581	351586	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_012632	T	6	6	351615	351620	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_012632	AGT	2	6	351646	351651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_012632	T	6	6	351664	351669	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_012632	CA	3	6	351697	351702	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1137	NC_012632	A	6	6	351702	351707	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1138	NC_012632	CAA	2	6	351710	351715	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1139	NC_012632	T	6	6	351769	351774	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1414	NC_012632	AGG	2	6	412230	412235	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1415	NC_012632	TCA	2	6	412237	412242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1417	NC_012632	TTA	2	6	412351	412356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1451	NC_012632	TCT	2	6	415241	415246	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1452	NC_012632	AGGG	2	8	415317	415324	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1453	NC_012632	AAG	2	6	415326	415331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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