MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Sulfolobus islandicus M.16.27 chromosome

Total Repeats: 10163

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9501	NC_012632	AAT	2	6	2436680	2436685	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9502	NC_012632	ATGA	2	8	2436694	2436701	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
9503	NC_012632	ATT	2	6	2436773	2436778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9504	NC_012632	GATTA	2	10	2436781	2436790	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
9505	NC_012632	TA	3	6	2436816	2436821	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9506	NC_012632	CTT	2	6	2436855	2436860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9507	NC_012632	TA	4	8	2436867	2436874	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9508	NC_012632	T	7	7	2436892	2436898	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9509	NC_012632	GT	3	6	2436914	2436919	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9510	NC_012632	CAA	2	6	2436921	2436926	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9511	NC_012632	T	6	6	2436933	2436938	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9512	NC_012632	TAG	2	6	2436945	2436950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9513	NC_012632	GGT	2	6	2436951	2436956	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9514	NC_012632	TAT	2	6	2436964	2436969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9515	NC_012632	GAT	2	6	2436981	2436986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9516	NC_012632	TAG	2	6	2436987	2436992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9517	NC_012632	T	6	6	2437034	2437039	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9518	NC_012632	TCC	2	6	2437053	2437058	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9519	NC_012632	TC	3	6	2437113	2437118	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9520	NC_012632	GAG	2	6	2437122	2437127	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9521	NC_012632	GAG	2	6	2437152	2437157	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9522	NC_012632	TAT	2	6	2437168	2437173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9523	NC_012632	GGA	2	6	2437175	2437180	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9524	NC_012632	ACT	2	6	2437190	2437195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9525	NC_012632	CCTCC	2	10	2437196	2437205	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
9526	NC_012632	T	7	7	2438313	2438319	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9527	NC_012632	TTG	2	6	2438325	2438330	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9528	NC_012632	TGT	2	6	2438340	2438345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9529	NC_012632	CAA	2	6	2438364	2438369	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9530	NC_012632	AAC	2	6	2439434	2439439	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9531	NC_012632	TAT	2	6	2439443	2439448	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9532	NC_012632	AT	4	8	2439447	2439454	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9533	NC_012632	A	6	6	2439568	2439573	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9534	NC_012632	T	6	6	2439589	2439594	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9535	NC_012632	TTC	2	6	2440931	2440936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9536	NC_012632	TAA	2	6	2441038	2441043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9537	NC_012632	AACATG	2	12	2441110	2441121	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
9538	NC_012632	TGA	2	6	2441220	2441225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9539	NC_012632	TAG	2	6	2441255	2441260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9540	NC_012632	AAT	2	6	2441265	2441270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9541	NC_012632	A	6	6	2441288	2441293	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9542	NC_012632	ATT	2	6	2441311	2441316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9543	NC_012632	TTTA	2	8	2442012	2442019	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9544	NC_012632	TAA	2	6	2442021	2442026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9545	NC_012632	AAT	2	6	2442032	2442037	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9546	NC_012632	TAT	2	6	2442630	2442635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9547	NC_012632	ATT	2	6	2442656	2442661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9548	NC_012632	TCA	2	6	2442664	2442669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9549	NC_012632	ATTT	2	8	2442831	2442838	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9550	NC_012632	GAA	2	6	2442849	2442854	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9551	NC_012632	AGA	2	6	2442855	2442860	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9552	NC_012632	AATT	2	8	2442915	2442922	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9553	NC_012632	AAT	2	6	2442987	2442992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9554	NC_012632	GAT	2	6	2442996	2443001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9555	NC_012632	CTC	2	6	2443057	2443062	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9556	NC_012632	TC	3	6	2443155	2443160	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9557	NC_012632	TAA	2	6	2443172	2443177	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9558	NC_012632	ACT	2	6	2443182	2443187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9559	NC_012632	CTT	2	6	2443238	2443243	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9560	NC_012632	AT	3	6	2443280	2443285	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9561	NC_012632	ACT	2	6	2443312	2443317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9562	NC_012632	T	6	6	2443346	2443351	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9563	NC_012632	AAAAGA	2	12	2443352	2443363	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9564	NC_012632	TA	3	6	2443406	2443411	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9565	NC_012632	TC	3	6	2443543	2443548	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9566	NC_012632	TTG	2	6	2443680	2443685	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9567	NC_012632	CAG	2	6	2443694	2443699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9568	NC_012632	ATT	2	6	2443735	2443740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9569	NC_012632	CTTCT	2	10	2443754	2443763	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
9570	NC_012632	TAA	2	6	2443851	2443856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9571	NC_012632	ACG	2	6	2443873	2443878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9572	NC_012632	TAC	2	6	2443938	2443943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9573	NC_012632	CTC	2	6	2444015	2444020	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9574	NC_012632	TTA	2	6	2444030	2444035	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9575	NC_012632	CCA	2	6	2444059	2444064	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9576	NC_012632	ACT	2	6	2444143	2444148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9577	NC_012632	CAG	2	6	2444159	2444164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9578	NC_012632	CTG	2	6	2444165	2444170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9579	NC_012632	CAG	2	6	2444180	2444185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9580	NC_012632	CCT	2	6	2445330	2445335	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9581	NC_012632	TA	3	6	2445481	2445486	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9582	NC_012632	GGA	2	6	2445545	2445550	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9583	NC_012632	TAA	2	6	2446921	2446926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9584	NC_012632	TTC	2	6	2446951	2446956	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9585	NC_012632	ATG	2	6	2446968	2446973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9586	NC_012632	AAG	2	6	2446980	2446985	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9587	NC_012632	AT	3	6	2447012	2447017	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9588	NC_012632	ATT	2	6	2448371	2448376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9589	NC_012632	T	6	6	2448375	2448380	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9590	NC_012632	ATA	2	6	2448749	2448754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9591	NC_012632	TTA	2	6	2451315	2451320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9592	NC_012632	ATA	3	9	2451324	2451332	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9593	NC_012632	TAA	2	6	2452943	2452948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9594	NC_012632	TAA	3	9	2456775	2456783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9595	NC_012632	TTA	2	6	2456819	2456824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9596	NC_012632	TAC	2	6	2456901	2456906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9597	NC_012632	TATT	2	8	2456928	2456935	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9598	NC_012632	AAG	2	6	2456964	2456969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9599	NC_012632	AGA	2	6	2456970	2456975	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9600	NC_012632	AAT	2	6	2458993	2458998	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9601	NC_012632	TA	3	6	2460020	2460025	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9602	NC_012632	ATC	2	6	2460044	2460049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9603	NC_012632	A	6	6	2460053	2460058	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9604	NC_012632	A	6	6	2460072	2460077	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9605	NC_012632	ATTTT	2	10	2463671	2463680	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
9606	NC_012632	TTA	2	6	2467431	2467436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9607	NC_012632	T	6	6	2468661	2468666	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9608	NC_012632	TAGT	2	8	2468668	2468675	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
9609	NC_012632	T	6	6	2468675	2468680	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9610	NC_012632	GGT	2	6	2468709	2468714	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9611	NC_012632	GA	3	6	2473003	2473008	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9612	NC_012632	GTG	2	6	2473042	2473047	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9613	NC_012632	TCA	2	6	2473068	2473073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9614	NC_012632	ATAAA	2	10	2473085	2473094	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
9615	NC_012632	TTA	2	6	2473105	2473110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9616	NC_012632	T	6	6	2473174	2473179	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9617	NC_012632	CT	3	6	2473188	2473193	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9618	NC_012632	AGA	2	6	2475495	2475500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9619	NC_012632	TTC	2	6	2475531	2475536	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9620	NC_012632	CT	3	6	2475543	2475548	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9621	NC_012632	T	6	6	2475571	2475576	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9622	NC_012632	AT	3	6	2475622	2475627	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9623	NC_012632	GAA	2	6	2475643	2475648	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9624	NC_012632	TTC	2	6	2475660	2475665	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9625	NC_012632	GGAA	2	8	2475706	2475713	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9626	NC_012632	CAT	2	6	2477703	2477708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9627	NC_012632	TA	4	8	2477715	2477722	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9628	NC_012632	AT	3	6	2479604	2479609	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9629	NC_012632	TA	3	6	2479637	2479642	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9630	NC_012632	TA	3	6	2479653	2479658	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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9944	NC_012632	ATA	2	6	2617027	2617032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9945	NC_012632	AAAT	2	8	2617037	2617044	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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