MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Sulfolobus islandicus M.16.27 chromosome

Total Repeats: 10163

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_012632	AGA	2	6	1071380	1071385	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6002	NC_012632	GAG	2	6	1071411	1071416	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6003	NC_012632	TA	3	6	1071418	1071423	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6004	NC_012632	AG	3	6	1071432	1071437	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6005	NC_012632	TA	3	6	1071541	1071546	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6006	NC_012632	A	6	6	1071595	1071600	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6007	NC_012632	GGA	2	6	1071677	1071682	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6008	NC_012632	GAGG	2	8	1071684	1071691	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
6009	NC_012632	GTT	2	6	1071730	1071735	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6010	NC_012632	GA	3	6	1071739	1071744	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6011	NC_012632	TGAG	2	8	1071794	1071801	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6012	NC_012632	AGGG	2	8	1071810	1071817	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
6013	NC_012632	AC	3	6	1071823	1071828	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6014	NC_012632	TCA	2	6	1071861	1071866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6015	NC_012632	AGA	2	6	1071893	1071898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6016	NC_012632	GA	4	8	1071915	1071922	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6017	NC_012632	GAT	2	6	1071927	1071932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6018	NC_012632	GGA	2	6	1071978	1071983	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6019	NC_012632	GTT	2	6	1072009	1072014	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6020	NC_012632	CCG	2	6	1072131	1072136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6021	NC_012632	GCATG	2	10	1072170	1072179	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
6022	NC_012632	TTC	2	6	1072206	1072211	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6023	NC_012632	GGA	2	6	1072242	1072247	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6024	NC_012632	AGG	2	6	1072324	1072329	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6025	NC_012632	CCA	2	6	1072353	1072358	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6026	NC_012632	GA	3	6	1072362	1072367	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6027	NC_012632	TGG	2	6	1072384	1072389	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6028	NC_012632	GGA	2	6	1072436	1072441	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6029	NC_012632	TAA	2	6	1073242	1073247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6030	NC_012632	ATT	2	6	1073340	1073345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6031	NC_012632	TTA	3	9	1073360	1073368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6032	NC_012632	CTTA	2	8	1073551	1073558	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6033	NC_012632	CTT	2	6	1073573	1073578	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6034	NC_012632	CAA	2	6	1073645	1073650	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6035	NC_012632	AAT	3	9	1073655	1073663	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6036	NC_012632	TAA	2	6	1073697	1073702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6037	NC_012632	ATC	2	6	1073731	1073736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6038	NC_012632	CT	3	6	1073745	1073750	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6039	NC_012632	AAAT	3	12	1073890	1073901	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6040	NC_012632	GGCT	2	8	1073957	1073964	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6041	NC_012632	AC	3	6	1074019	1074024	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6042	NC_012632	T	7	7	1074044	1074050	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6043	NC_012632	AAG	2	6	1074078	1074083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6044	NC_012632	GTA	2	6	1074089	1074094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6045	NC_012632	TCCT	2	8	1076941	1076948	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6046	NC_012632	AG	3	6	1076963	1076968	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6047	NC_012632	T	6	6	1076975	1076980	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6048	NC_012632	GAA	2	6	1077005	1077010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6049	NC_012632	ATA	2	6	1077055	1077060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6050	NC_012632	TC	3	6	1077124	1077129	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6051	NC_012632	A	6	6	1077156	1077161	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6052	NC_012632	AAT	2	6	1078759	1078764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6053	NC_012632	TA	3	6	1078765	1078770	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6054	NC_012632	T	6	6	1078771	1078776	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6055	NC_012632	AT	3	6	1078784	1078789	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6056	NC_012632	TAA	2	6	1078791	1078796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6057	NC_012632	AATT	2	8	1078814	1078821	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6058	NC_012632	TAT	2	6	1078831	1078836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6059	NC_012632	GTA	2	6	1078912	1078917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6060	NC_012632	TC	3	6	1079005	1079010	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6061	NC_012632	CCT	2	6	1079053	1079058	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6062	NC_012632	AAG	2	6	1079094	1079099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6063	NC_012632	TACC	2	8	1079100	1079107	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6064	NC_012632	CAA	2	6	1079138	1079143	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6065	NC_012632	ATG	2	6	1079155	1079160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6066	NC_012632	CTAA	2	8	1079192	1079199	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6067	NC_012632	ACTT	2	8	1079347	1079354	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6068	NC_012632	TGA	2	6	1079390	1079395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6069	NC_012632	CAA	2	6	1079424	1079429	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6070	NC_012632	CT	3	6	1079515	1079520	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6071	NC_012632	T	6	6	1079634	1079639	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6072	NC_012632	TCC	2	6	1079652	1079657	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6073	NC_012632	CCT	2	6	1079683	1079688	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6074	NC_012632	TAC	2	6	1079699	1079704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6075	NC_012632	TTA	2	6	1079719	1079724	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6076	NC_012632	TAC	2	6	1079731	1079736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6077	NC_012632	TTA	2	6	1079823	1079828	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6078	NC_012632	TTA	3	9	1079883	1079891	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6079	NC_012632	TCT	2	6	1080061	1080066	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6080	NC_012632	AGC	2	6	1080076	1080081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6081	NC_012632	ACTT	2	8	1080157	1080164	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6082	NC_012632	TC	3	6	1080179	1080184	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6083	NC_012632	TATTT	2	10	1080264	1080273	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
6084	NC_012632	TCC	2	6	1080485	1080490	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6085	NC_012632	ACT	2	6	1080501	1080506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6086	NC_012632	CTT	2	6	1080529	1080534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6087	NC_012632	CTC	2	6	1080553	1080558	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6088	NC_012632	TCT	2	6	1080589	1080594	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6089	NC_012632	TACTT	2	10	1080614	1080623	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
6090	NC_012632	ATT	3	9	1080631	1080639	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6091	NC_012632	T	7	7	1080638	1080644	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6092	NC_012632	CCT	2	6	1080645	1080650	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6093	NC_012632	AAGT	2	8	1080686	1080693	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6094	NC_012632	TA	3	6	1080728	1080733	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6095	NC_012632	TAA	2	6	1080767	1080772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6096	NC_012632	TTA	2	6	1081537	1081542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6097	NC_012632	TTG	2	6	1081564	1081569	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6098	NC_012632	TCA	2	6	1081598	1081603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6099	NC_012632	AAGT	2	8	1081639	1081646	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6100	NC_012632	GAA	2	6	1081699	1081704	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6101	NC_012632	AAT	2	6	1082226	1082231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6102	NC_012632	T	6	6	1082253	1082258	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6103	NC_012632	TTTTA	2	10	1084451	1084460	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
6104	NC_012632	ATT	2	6	1084462	1084467	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6105	NC_012632	TAT	2	6	1084507	1084512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6106	NC_012632	AT	3	6	1084567	1084572	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6107	NC_012632	TCA	2	6	1086002	1086007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6108	NC_012632	T	6	6	1086017	1086022	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6109	NC_012632	AT	3	6	1086038	1086043	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6110	NC_012632	ATT	2	6	1086090	1086095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6111	NC_012632	TTA	3	9	1086130	1086138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6112	NC_012632	TA	3	6	1086169	1086174	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6113	NC_012632	A	6	6	1086186	1086191	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6114	NC_012632	TAA	2	6	1086248	1086253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6115	NC_012632	AAT	2	6	1086264	1086269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6116	NC_012632	AAAT	2	8	1087077	1087084	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6117	NC_012632	AGT	2	6	1087090	1087095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6118	NC_012632	ATC	2	6	1087117	1087122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6119	NC_012632	TTAT	2	8	1087129	1087136	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6120	NC_012632	CA	3	6	1087168	1087173	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6121	NC_012632	TA	3	6	1087186	1087191	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6122	NC_012632	CCT	2	6	1087248	1087253	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6123	NC_012632	AAT	2	6	1087321	1087326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6124	NC_012632	ATA	2	6	1087336	1087341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6125	NC_012632	TC	3	6	1088058	1088063	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6126	NC_012632	TAG	2	6	1088088	1088093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6127	NC_012632	GTC	2	6	1088241	1088246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6128	NC_012632	ACG	2	6	1089017	1089022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6129	NC_012632	ACA	2	6	1089038	1089043	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6130	NC_012632	ATT	2	6	1089064	1089069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6131	NC_012632	ATT	2	6	1089073	1089078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6132	NC_012632	TTA	2	6	1089085	1089090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6133	NC_012632	ATA	2	6	1089105	1089110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6134	NC_012632	TTG	2	6	1089864	1089869	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6136	NC_012632	ATA	2	6	1091154	1091159	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6139	NC_012632	TA	3	6	1091263	1091268	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6142	NC_012632	T	6	6	1092742	1092747	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6245	NC_012632	CAATT	2	10	1123698	1123707	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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6248	NC_012632	AGGA	2	8	1123756	1123763	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6249	NC_012632	AT	3	6	1123770	1123775	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6250	NC_012632	ACAA	2	8	1123784	1123791	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6251	NC_012632	AGA	2	6	1123806	1123811	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6252	NC_012632	TAA	2	6	1123852	1123857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6253	NC_012632	TGA	2	6	1123858	1123863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6254	NC_012632	GTT	2	6	1123882	1123887	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6256	NC_012632	ACTG	2	8	1123948	1123955	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6257	NC_012632	AAT	3	9	1124011	1124019	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6259	NC_012632	GAAGTT	2	12	1124051	1124062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6260	NC_012632	GTT	2	6	1124068	1124073	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6261	NC_012632	TTTC	2	8	1124134	1124141	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6262	NC_012632	GGA	2	6	1124222	1124227	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6263	NC_012632	GA	3	6	1124226	1124231	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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6265	NC_012632	TTC	2	6	1124279	1124284	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6401	NC_012632	GCC	2	6	1191734	1191739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6402	NC_012632	TCA	2	6	1191746	1191751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6404	NC_012632	CCGG	2	8	1191762	1191769	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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6434	NC_012632	TAC	2	6	1209066	1209071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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