MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Sulfolobus islandicus Y.N.15.51 chromosome

Total Repeats: 11746

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_012623	AGG	2	6	166751	166756	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
502	NC_012623	A	6	6	166801	166806	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_012623	TAG	2	6	166813	166818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
504	NC_012623	ATA	2	6	166820	166825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_012623	GAA	2	6	166876	166881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
506	NC_012623	CAA	2	6	166961	166966	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
507	NC_012623	ACGTA	2	10	167989	167998	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
508	NC_012623	G	6	6	168001	168006	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
509	NC_012623	GCA	2	6	168108	168113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
510	NC_012623	GCT	2	6	168114	168119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
511	NC_012623	AGT	2	6	168131	168136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
512	NC_012623	GTG	2	6	168214	168219	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
513	NC_012623	TAA	2	6	168244	168249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_012623	AGG	3	9	168257	168265	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
515	NC_012623	GTTT	2	8	168304	168311	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
516	NC_012623	GTA	2	6	168336	168341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
517	NC_012623	ATT	2	6	168422	168427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_012623	AGG	2	6	168463	168468	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
519	NC_012623	GCT	2	6	168507	168512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
520	NC_012623	AAG	2	6	168515	168520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
521	NC_012623	AAT	2	6	168539	168544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_012623	GCT	2	6	168579	168584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
523	NC_012623	GAG	2	6	168651	168656	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
524	NC_012623	AT	3	6	168867	168872	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_012623	TTCTTT	2	12	168915	168926	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
526	NC_012623	A	6	6	168928	168933	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_012623	TAG	2	6	168961	168966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
528	NC_012623	ATG	2	6	169610	169615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
529	NC_012623	TAATT	2	10	169621	169630	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_012623	TAA	2	6	169643	169648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_012623	ATT	2	6	170243	170248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_012623	TAA	2	6	170258	170263	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_012623	TA	3	6	170293	170298	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_012623	AAT	2	6	170964	170969	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
535	NC_012623	TAT	2	6	170994	170999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_012623	TAT	2	6	171009	171014	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_012623	ACT	2	6	171019	171024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
538	NC_012623	ATC	2	6	171054	171059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
539	NC_012623	ACA	2	6	171154	171159	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
540	NC_012623	TTA	2	6	171236	171241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_012623	C	6	6	171261	171266	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
542	NC_012623	AGA	2	6	171343	171348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
543	NC_012623	A	6	6	172686	172691	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_012623	T	6	6	172707	172712	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_012623	TAA	2	6	172902	172907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_012623	A	6	6	174814	174819	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_012623	A	6	6	175097	175102	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_012623	A	6	6	175108	175113	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_012623	A	6	6	176042	176047	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_012623	CTAA	2	8	176427	176434	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
551	NC_012623	T	6	6	176448	176453	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_012623	TGT	2	6	176539	176544	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
553	NC_012623	ATAA	2	8	176631	176638	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_012623	CCG	2	6	176649	176654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
555	NC_012623	TAT	2	6	176661	176666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_012623	GAA	2	6	176702	176707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
557	NC_012623	T	6	6	176716	176721	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_012623	TCG	2	6	176756	176761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
559	NC_012623	ATA	2	6	176820	176825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_012623	AAC	2	6	176847	176852	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
561	NC_012623	CGA	2	6	176866	176871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
562	NC_012623	GAAA	2	8	176885	176892	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
563	NC_012623	TAT	2	6	176900	176905	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_012623	AGG	2	6	177079	177084	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
565	NC_012623	CGT	2	6	177090	177095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
566	NC_012623	GAA	2	6	177176	177181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
567	NC_012623	TTTA	2	8	177214	177221	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_012623	GAA	2	6	177230	177235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
569	NC_012623	AAT	2	6	177246	177251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_012623	TAA	2	6	177304	177309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_012623	TATCG	2	10	177447	177456	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
572	NC_012623	TTA	2	6	177539	177544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_012623	TGGCA	2	10	177550	177559	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
574	NC_012623	TCG	2	6	177688	177693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
575	NC_012623	TACTC	2	10	179573	179582	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
576	NC_012623	GAT	2	6	179598	179603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
577	NC_012623	AGA	2	6	179618	179623	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
578	NC_012623	GAA	2	6	179626	179631	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
579	NC_012623	TACT	2	8	179657	179664	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
580	NC_012623	TAAT	2	8	179751	179758	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
581	NC_012623	AAT	2	6	179760	179765	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
582	NC_012623	ACC	2	6	180627	180632	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
583	NC_012623	GAG	3	9	180751	180759	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
584	NC_012623	AGT	2	6	180829	180834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
585	NC_012623	ATA	2	6	180865	180870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
586	NC_012623	TA	3	6	180880	180885	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
587	NC_012623	TA	4	8	180889	180896	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
588	NC_012623	AT	3	6	180907	180912	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_012623	A	6	6	180970	180975	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
590	NC_012623	ATCT	2	8	181237	181244	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
591	NC_012623	TAT	2	6	181258	181263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_012623	TAA	2	6	181323	181328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_012623	TAC	2	6	181350	181355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
594	NC_012623	TA	3	6	181359	181364	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_012623	TCA	2	6	181382	181387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
596	NC_012623	CTT	2	6	181451	181456	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
597	NC_012623	TAATT	2	10	181537	181546	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_012623	ATCT	2	8	181567	181574	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
599	NC_012623	TTA	2	6	181575	181580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
600	NC_012623	TAA	2	6	181586	181591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
601	NC_012623	AG	3	6	181651	181656	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
602	NC_012623	TAG	2	6	182434	182439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
603	NC_012623	TTA	2	6	182479	182484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_012623	AAT	2	6	182511	182516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
605	NC_012623	AAT	2	6	182550	182555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
606	NC_012623	ATT	2	6	182619	182624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
607	NC_012623	TAG	2	6	182635	182640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
608	NC_012623	CCT	2	6	182683	182688	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
609	NC_012623	TGC	2	6	182690	182695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
610	NC_012623	CCAA	2	8	182770	182777	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
611	NC_012623	TTCC	2	8	182836	182843	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
612	NC_012623	CT	3	6	182892	182897	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
613	NC_012623	GAA	2	6	182924	182929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
614	NC_012623	GAAC	2	8	183035	183042	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
615	NC_012623	TCA	2	6	183081	183086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
616	NC_012623	ACC	2	6	183093	183098	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
617	NC_012623	T	7	7	183104	183110	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
618	NC_012623	AAT	2	6	183246	183251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
619	NC_012623	TA	3	6	183324	183329	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
620	NC_012623	TA	3	6	183344	183349	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
621	NC_012623	A	6	6	183751	183756	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_012623	ATA	2	6	183941	183946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_012623	TA	3	6	183973	183978	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
624	NC_012623	TA	5	10	183988	183997	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
625	NC_012623	TGAT	2	8	184428	184435	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
626	NC_012623	GTT	2	6	184520	184525	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
627	NC_012623	AAT	2	6	184814	184819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
628	NC_012623	TAC	2	6	184823	184828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
629	NC_012623	ATCT	2	8	184840	184847	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
630	NC_012623	TCTA	2	8	184865	184872	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
631	NC_012623	CTCTAT	2	12	184875	184886	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
632	NC_012623	T	6	6	185140	185145	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_012623	A	6	6	185166	185171	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
634	NC_012623	AAT	2	6	185588	185593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
635	NC_012623	ATT	2	6	185624	185629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
636	NC_012623	GTA	2	6	185714	185719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
637	NC_012623	TAC	2	6	185747	185752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
638	NC_012623	TC	3	6	185845	185850	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
639	NC_012623	TG	3	6	185887	185892	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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920	NC_012623	TGT	2	6	217990	217995	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1000	NC_012623	A	6	6	230008	230013	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

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