MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Sulfolobus islandicus Y.G.57.14 chromosome

Total Repeats: 148

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012622	TACAAA	2	12	5739	5750	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_012622	TGGTAT	2	12	17804	17815	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012622	TAATAC	2	12	27111	27122	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_012622	CTTTTC	2	12	32721	32732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_012622	TATTTA	2	12	38249	38260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012622	TCTAGT	2	12	48118	48129	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_012622	TAGGGA	2	12	65022	65033	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012622	AAGGAG	2	12	65218	65229	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012622	AATAAA	2	12	73369	73380	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012622	AGTTAA	2	12	92133	92144	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012622	TTATCA	2	12	115554	115565	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_012622	GTATGA	2	12	115609	115620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012622	AAAATA	2	12	129459	129470	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012622	AATATT	2	12	174217	174228	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_012622	GTAAGC	2	12	224768	224779	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_012622	TTACAT	2	12	226942	226953	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_012622	CTCATT	2	12	311037	311048	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_012622	ATAAAT	2	12	314480	314491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012622	AAAAGA	2	12	330487	330498	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_012622	AAAAAT	2	12	336895	336906	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_012622	TTTTAA	2	12	337075	337086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012622	ATATTT	2	12	347561	347572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012622	ATTTAT	2	12	350610	350621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_012622	AAATGG	2	12	360784	360795	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_012622	GTTAAG	2	12	361165	361176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_012622	CTTCTC	2	12	366076	366087	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_012622	GGTAAA	2	12	373167	373178	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_012622	ATATTT	2	12	383958	383969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012622	CAATAA	2	12	408620	408631	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_012622	AAATAA	2	12	412641	412652	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_012622	TAGGGA	2	12	428428	428439	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012622	CTACAT	2	12	431994	432005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_012622	TAAAGC	2	12	437654	437665	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_012622	TACCCC	2	12	440319	440330	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_012622	CACACT	2	12	539567	539578	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_012622	AATTTT	2	12	540085	540096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_012622	ATATTT	2	12	555650	555661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012622	TTGGAA	2	12	558076	558087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_012622	AATTTT	2	12	563668	563679	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_012622	GATTAG	2	12	569720	569731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_012622	ATGGGC	2	12	571615	571626	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_012622	TATTTT	2	12	583808	583819	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_012622	TTAACT	2	12	598244	598255	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_012622	GATAAG	2	12	611515	611526	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_012622	ATTTTA	2	12	630604	630615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_012622	TAATTT	2	12	634701	634712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_012622	TATTTT	2	12	662836	662847	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_012622	GATAAG	2	12	678633	678644	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_012622	AAGTTA	2	12	678937	678948	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_012622	TAGGAG	2	12	679400	679411	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_012622	ATTGGA	2	12	700980	700991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_012622	TTCATC	2	12	704518	704529	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_012622	TAGAGT	2	12	708660	708671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_012622	CTATAA	2	12	728859	728870	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_012622	TTTGGA	2	12	732084	732095	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_012622	AATTTT	2	12	736566	736577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_012622	GAAAAG	2	12	738315	738326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_012622	TTATTT	2	12	766653	766664	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_012622	TAATTA	2	12	786237	786248	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_012622	CGAAGA	2	12	788850	788861	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_012622	CTAATT	2	12	789268	789279	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_012622	ATTTTC	2	12	821838	821849	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_012622	TATTTT	2	12	836814	836825	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_012622	ATATAA	2	12	839204	839215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_012622	TTATCT	2	12	860297	860308	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_012622	GATGTA	2	12	872223	872234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_012622	GAAATA	2	12	883870	883881	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_012622	AATATT	2	12	894486	894497	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_012622	AATATT	2	12	894581	894592	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_012622	TAATAC	2	12	991643	991654	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_012622	AAAACA	2	12	1016367	1016378	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_012622	CGAAAC	2	12	1018963	1018974	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_012622	AAAGTA	2	12	1092228	1092239	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_012622	TAGCTT	2	12	1123849	1123860	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_012622	TGGGGT	2	12	1149907	1149918	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_012622	TAAAGA	2	12	1150285	1150296	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_012622	ACTCTT	2	12	1160829	1160840	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_012622	ACAGTA	2	12	1335941	1335952	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_012622	ACATTC	2	12	1336126	1336137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_012622	TAGGGA	2	12	1337139	1337150	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_012622	CTTCAT	2	12	1339152	1339163	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_012622	TCATAA	2	12	1348071	1348082	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_012622	ATGAAA	2	12	1457010	1457021	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_012622	TAGAGC	2	12	1457153	1457164	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_012622	ACTCCT	2	12	1457534	1457545	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_012622	CTTTAA	2	12	1457995	1458006	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_012622	TAATAG	2	12	1476993	1477004	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_012622	CTATAT	2	12	1481227	1481238	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_012622	TATTTA	2	12	1505637	1505648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_012622	GATAAG	2	12	1507026	1507037	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_012622	TAGGAG	2	12	1507793	1507804	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_012622	TTCTAC	2	12	1517527	1517538	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_012622	ATGAGG	2	12	1518184	1518195	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_012622	GTATAA	2	12	1518402	1518413	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_012622	TACAAA	2	12	1552370	1552381	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_012622	TAAAAA	2	12	1577503	1577514	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_012622	TATAAA	2	12	1795405	1795416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_012622	AAACAA	2	12	1817342	1817353	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_012622	TTCTTA	2	12	1817905	1817916	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_012622	TAACAA	2	12	1821084	1821095	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_012622	TTAGTA	2	12	1833549	1833560	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_012622	AATTTT	2	12	1879501	1879512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_012622	AATATA	2	12	1935120	1935131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_012622	ATTTAT	2	12	1935135	1935146	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_012622	ACTATC	2	12	1958984	1958995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_012622	ATCTTC	2	12	1960203	1960214	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_012622	GATAAA	2	12	2062200	2062211	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_012622	TTAGCT	2	12	2062280	2062291	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_012622	AAATAT	2	12	2078620	2078631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_012622	TAACAT	2	12	2098532	2098543	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_012622	TAGGAG	2	12	2102096	2102107	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_012622	TTAATT	2	12	2118048	2118059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_012622	GATGTA	2	12	2118112	2118123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_012622	TCCTTT	2	12	2152167	2152178	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_012622	TTTATG	2	12	2175297	2175308	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_012622	GTAAAA	2	12	2213653	2213664	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_012622	TATTTG	2	12	2216837	2216848	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_012622	GAGGGA	2	12	2218894	2218905	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_012622	TATTTT	2	12	2226041	2226052	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_012622	CCTCTT	2	12	2233090	2233101	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_012622	TTCCTT	2	12	2271496	2271507	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_012622	ATCATA	2	12	2278134	2278145	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_012622	TTATTT	2	12	2282033	2282044	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_012622	AAAAAG	2	12	2293131	2293142	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_012622	GTGCTG	2	12	2308417	2308428	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_012622	TAATTA	2	12	2311325	2311336	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_012622	TTTATC	2	12	2322890	2322901	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_012622	TAAAAT	2	12	2363098	2363109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_012622	AATTTT	2	12	2381549	2381560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_012622	AAAAAG	2	12	2387059	2387070	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_012622	AGTTTA	2	12	2397156	2397167	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_012622	TTTTAA	2	12	2401621	2401632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_012622	TATCGC	2	12	2436118	2436129	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_012622	CACCCT	2	12	2438751	2438762	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_012622	TCTATC	2	12	2441184	2441195	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_012622	TTTTAT	2	12	2441876	2441887	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_012622	AACATG	2	12	2442637	2442648	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
138	NC_012622	AAAAGA	2	12	2444880	2444891	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
139	NC_012622	ATAAAA	2	12	2513522	2513533	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_012622	TAATAT	2	12	2515724	2515735	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_012622	TAAAAA	2	12	2544008	2544019	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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144	NC_012622	GCAGAT	2	12	2631825	2631836	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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146	NC_012622	TCTTTT	2	12	2635677	2635688	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.