MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Sulfolobus islandicus Y.G.57.14 chromosome

Total Repeats: 378

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012622	GTCAC	2	10	357	366	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
2	NC_012622	TTAAA	2	10	5880	5889	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012622	ATGTT	2	10	6109	6118	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012622	TGTGA	2	10	6143	6152	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012622	AAAAT	2	10	27148	27157	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012622	TGGTG	2	10	39029	39038	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012622	TAATT	2	10	61013	61022	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012622	CAAGT	2	10	64769	64778	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
9	NC_012622	GTTTT	2	10	73385	73394	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012622	ATATG	2	10	83517	83526	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012622	AATTA	2	10	94263	94272	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012622	CATGC	2	10	115380	115389	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
13	NC_012622	AAATT	2	10	120531	120540	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012622	GATTA	2	10	120989	120998	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_012622	AAATA	2	10	134574	134583	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012622	GAGTC	2	10	142614	142623	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
17	NC_012622	TTAAA	2	10	163272	163281	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012622	GGAGA	2	10	173872	173881	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012622	GTGAT	2	10	191232	191241	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
20	NC_012622	ATAAA	2	10	200346	200355	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_012622	ATAAA	2	10	254350	254359	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012622	TCTCA	2	10	259856	259865	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
23	NC_012622	TCAAT	2	10	269590	269599	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_012622	ATGAT	2	10	285226	285235	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_012622	ACCGA	2	10	289784	289793	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
26	NC_012622	TAACT	2	10	292331	292340	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_012622	TAAAT	2	10	292638	292647	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_012622	TATAT	2	10	293351	293360	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012622	ATCAT	2	10	297578	297587	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_012622	CTAAT	2	10	297876	297885	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_012622	ATTCA	2	10	300812	300821	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_012622	TCTTA	2	10	301347	301356	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_012622	CTTTA	2	10	305979	305988	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_012622	ATTGC	2	10	308786	308795	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
35	NC_012622	TTAAA	2	10	311061	311070	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_012622	ATTAG	2	10	312406	312415	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_012622	CCTTC	2	10	316292	316301	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
38	NC_012622	AATTT	2	10	316517	316526	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_012622	AGTCA	2	10	318043	318052	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
40	NC_012622	AAGAA	2	10	321565	321574	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_012622	ATCTA	2	10	323067	323076	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_012622	CCTTC	2	10	335092	335101	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
43	NC_012622	AGGTA	2	10	336919	336928	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
44	NC_012622	GTAAG	2	10	337008	337017	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
45	NC_012622	ATTTT	2	10	339937	339946	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_012622	ATATA	2	10	339980	339989	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_012622	ATCAA	2	10	343801	343810	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
48	NC_012622	ATTTT	2	10	346622	346631	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_012622	CTTAT	2	10	348637	348646	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
50	NC_012622	GTAAT	2	10	361255	361264	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_012622	CATGC	2	10	376974	376983	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
52	NC_012622	AGAGA	2	10	377574	377583	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
53	NC_012622	GAGGG	2	10	384075	384084	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
54	NC_012622	ATACA	2	10	384249	384258	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_012622	AAAAT	2	10	386354	386363	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_012622	CAAAG	2	10	387802	387811	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
57	NC_012622	AAAAT	2	10	387981	387990	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_012622	TGCCA	2	10	388211	388220	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
59	NC_012622	AAAAT	2	10	388752	388761	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_012622	AAAAG	2	10	411949	411958	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_012622	TTTAG	2	10	418462	418471	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_012622	AAATG	2	10	420022	420031	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_012622	CCTTA	2	10	427595	427604	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
64	NC_012622	GCCTC	2	10	427637	427646	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
65	NC_012622	CAAGT	2	10	428175	428184	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
66	NC_012622	ATAGC	2	10	430295	430304	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
67	NC_012622	TATAA	2	10	432779	432788	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_012622	ATACG	2	10	435348	435357	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
69	NC_012622	TCGTT	2	10	437615	437624	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
70	NC_012622	GGTAG	2	10	437693	437702	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
71	NC_012622	TTTAG	2	10	438781	438790	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_012622	GGCAT	2	10	440372	440381	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
73	NC_012622	GCCTC	2	10	443629	443638	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
74	NC_012622	TCTCT	2	10	454872	454881	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
75	NC_012622	AAACT	2	10	456141	456150	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
76	NC_012622	ATTTA	2	10	461983	461992	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_012622	CTTCA	2	10	475770	475779	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
78	NC_012622	TCTTT	2	10	478937	478946	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
79	NC_012622	TTATG	2	10	486838	486847	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_012622	TTTTA	2	10	504878	504887	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_012622	GTACT	2	10	508024	508033	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
82	NC_012622	TAAAT	2	10	508287	508296	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_012622	TCTTT	2	10	511951	511960	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_012622	TTAAA	2	10	520376	520385	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_012622	ATTAC	2	10	521706	521715	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
86	NC_012622	GAATA	2	10	534122	534131	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_012622	ATTCT	2	10	534772	534781	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
88	NC_012622	TAAAA	2	10	540221	540230	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_012622	CCTAG	2	10	546622	546631	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
90	NC_012622	AAGTT	2	10	552013	552022	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_012622	TAATG	2	10	554005	554014	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_012622	TTAGA	2	10	558005	558014	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_012622	TTTAG	2	10	570610	570619	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_012622	TAATA	2	10	580358	580367	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_012622	CCTTG	2	10	580629	580638	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
96	NC_012622	AAAGG	2	10	584397	584406	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
97	NC_012622	ATGAT	2	10	587316	587325	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_012622	TATAT	2	10	591988	591997	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_012622	CTTAT	2	10	608091	608100	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
100	NC_012622	CTTTA	2	10	611259	611268	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
101	NC_012622	CATTC	2	10	611293	611302	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
102	NC_012622	GGTAA	2	10	611497	611506	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
103	NC_012622	TTTCA	2	10	617863	617872	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
104	NC_012622	CTAAC	2	10	623007	623016	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
105	NC_012622	GTATT	2	10	633298	633307	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
106	NC_012622	ATTTT	2	10	634649	634658	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_012622	AATAT	2	10	635891	635900	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_012622	TCATC	2	10	636444	636453	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
109	NC_012622	GTTGG	2	10	637056	637065	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
110	NC_012622	ACTTT	2	10	641268	641277	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
111	NC_012622	GGTTG	2	10	645938	645947	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
112	NC_012622	TACTC	2	10	646213	646222	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
113	NC_012622	CTTCT	2	10	654437	654446	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
114	NC_012622	TGAGT	2	10	661406	661415	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
115	NC_012622	TAAGT	2	10	664342	664351	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_012622	TAGTT	2	10	675966	675975	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_012622	AATTT	2	10	676957	676966	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_012622	CTTTA	2	10	678377	678386	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
119	NC_012622	GGTAA	2	10	678615	678624	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
120	NC_012622	GTCAT	2	10	680389	680398	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
121	NC_012622	CTTCT	2	10	686305	686314	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
122	NC_012622	TAATA	2	10	706652	706661	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_012622	ACTTC	2	10	707173	707182	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
124	NC_012622	TCCTT	2	10	707988	707997	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
125	NC_012622	CTAAT	2	10	708024	708033	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
126	NC_012622	CGCCT	2	10	708753	708762	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
127	NC_012622	ACACT	2	10	731706	731715	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
128	NC_012622	AAATA	2	10	731756	731765	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_012622	ATATA	2	10	738239	738248	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_012622	TCTAT	2	10	752082	752091	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
131	NC_012622	AAGTA	2	10	754398	754407	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
132	NC_012622	AAAAG	2	10	762192	762201	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
133	NC_012622	TTTTA	2	10	771479	771488	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_012622	CCTAG	2	10	782865	782874	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
135	NC_012622	GAGTA	2	10	786705	786714	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
136	NC_012622	TGAAA	2	10	787052	787061	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
137	NC_012622	CTTGA	2	10	787175	787184	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
138	NC_012622	TAGTC	2	10	799727	799736	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
139	NC_012622	CCTTT	2	10	809707	809716	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
140	NC_012622	ATTTT	2	10	811532	811541	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_012622	TAATT	2	10	816305	816314	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_012622	AATTA	2	10	816809	816818	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_012622	AGAAT	2	10	821564	821573	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
144	NC_012622	TCTTA	2	10	821752	821761	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
145	NC_012622	TTTCA	2	10	828531	828540	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
146	NC_012622	TTTAA	2	10	845127	845136	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_012622	TAAAA	2	10	847956	847965	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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149	NC_012622	TAAAA	2	10	848821	848830	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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288	NC_012622	ATCTA	2	10	2072522	2072531	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
289	NC_012622	TTTCT	2	10	2074113	2074122	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
290	NC_012622	TTGAT	2	10	2078691	2078700	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
291	NC_012622	TAACT	2	10	2079056	2079065	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
292	NC_012622	GTTAG	2	10	2079193	2079202	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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294	NC_012622	TACTT	2	10	2098873	2098882	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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374	NC_012622	TTTTA	2	10	2563424	2563433	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
375	NC_012622	TTAAC	2	10	2563723	2563732	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
376	NC_012622	ATATT	2	10	2584278	2584287	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
377	NC_012622	TTTAG	2	10	2626515	2626524	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
378	NC_012622	TTTAT	2	10	2649597	2649606	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.