MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Sulfolobus islandicus Y.G.57.14 chromosome

Total Repeats: 8927

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_012622	CAT	2	6	343788	343793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1002	NC_012622	ATCAA	2	10	343801	343810	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
1003	NC_012622	T	6	6	343812	343817	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_012622	GA	3	6	343852	343857	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_012622	A	6	6	343877	343882	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_012622	AATT	2	8	344797	344804	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_012622	AACT	2	8	344809	344816	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1008	NC_012622	ATT	2	6	344845	344850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_012622	TTA	2	6	344851	344856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_012622	ATT	2	6	344926	344931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_012622	GTA	2	6	344983	344988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_012622	TA	3	6	345030	345035	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_012622	CCT	2	6	345125	345130	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1014	NC_012622	TAA	2	6	345242	345247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_012622	TCA	2	6	345275	345280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1016	NC_012622	AGT	2	6	345289	345294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_012622	ATC	2	6	345380	345385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1018	NC_012622	CCA	2	6	345390	345395	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1019	NC_012622	TC	3	6	345412	345417	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1020	NC_012622	TGG	2	6	345421	345426	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_012622	CCT	2	6	345450	345455	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1022	NC_012622	A	6	6	345698	345703	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_012622	AGC	2	6	346606	346611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1024	NC_012622	ATTTT	2	10	346622	346631	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_012622	TA	3	6	347471	347476	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_012622	ATA	2	6	347489	347494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_012622	GAT	2	6	347500	347505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_012622	TAT	2	6	347518	347523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_012622	TAA	2	6	347545	347550	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_012622	ATATTT	2	12	347561	347572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_012622	CTTAT	2	10	348637	348646	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1032	NC_012622	AATC	2	8	350539	350546	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1033	NC_012622	CAT	2	6	350558	350563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1034	NC_012622	ATT	2	6	350588	350593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_012622	TAA	2	6	350597	350602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_012622	ATTTAT	2	12	350610	350621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_012622	CTT	2	6	350636	350641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1038	NC_012622	A	6	6	352084	352089	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_012622	TTA	2	6	354351	354356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_012622	CTT	2	6	354431	354436	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1041	NC_012622	CCT	2	6	354513	354518	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1042	NC_012622	AAC	2	6	356092	356097	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1043	NC_012622	CCT	2	6	356149	356154	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1044	NC_012622	AAT	2	6	356273	356278	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_012622	TAA	2	6	356282	356287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_012622	TA	3	6	357123	357128	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_012622	AAC	2	6	360195	360200	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1048	NC_012622	TAAT	2	8	360277	360284	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_012622	ATTT	2	8	360285	360292	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_012622	TAG	2	6	360336	360341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_012622	TCT	2	6	360379	360384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1052	NC_012622	TCA	2	6	360417	360422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1053	NC_012622	TTG	2	6	360558	360563	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_012622	ATG	2	6	360579	360584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_012622	TAC	2	6	360587	360592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1056	NC_012622	CT	3	6	360650	360655	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1057	NC_012622	AAT	2	6	360697	360702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_012622	TA	3	6	360725	360730	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_012622	TCA	2	6	360774	360779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1060	NC_012622	AAATGG	2	12	360784	360795	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_012622	A	6	6	360824	360829	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_012622	CCAA	2	8	360830	360837	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1063	NC_012622	CTG	2	6	360850	360855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1064	NC_012622	TAA	2	6	360937	360942	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_012622	AT	4	8	360952	360959	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_012622	TTA	2	6	361019	361024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_012622	GA	4	8	361033	361040	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_012622	TAA	2	6	361069	361074	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_012622	ATT	2	6	361088	361093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_012622	CTT	2	6	361099	361104	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1071	NC_012622	TTA	2	6	361145	361150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_012622	ATAC	2	8	361154	361161	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1073	NC_012622	GTTAAG	2	12	361165	361176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_012622	GTAAT	2	10	361255	361264	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_012622	TA	3	6	361569	361574	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_012622	TAT	3	9	366003	366011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_012622	A	7	7	366020	366026	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_012622	CTT	2	6	366068	366073	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1079	NC_012622	CTTCTC	2	12	366076	366087	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1080	NC_012622	TCA	2	6	366094	366099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1081	NC_012622	ATC	2	6	366115	366120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1082	NC_012622	CT	3	6	366152	366157	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1083	NC_012622	TTC	2	6	367857	367862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1084	NC_012622	AAAT	2	8	368376	368383	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_012622	TTGT	2	8	370502	370509	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_012622	TAAC	3	12	370510	370521	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1087	NC_012622	GCT	2	6	370537	370542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1088	NC_012622	TAT	2	6	370557	370562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_012622	GATA	2	8	371276	371283	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_012622	ATT	2	6	373116	373121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_012622	T	7	7	373120	373126	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_012622	ATAG	2	8	373138	373145	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_012622	GGTAAA	2	12	373167	373178	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_012622	GAAA	2	8	373960	373967	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_012622	A	6	6	373965	373970	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_012622	T	6	6	373988	373993	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_012622	AAG	2	6	374025	374030	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_012622	TAAT	2	8	374043	374050	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_012622	T	6	6	374050	374055	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_012622	TTAA	2	8	375568	375575	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_012622	GA	3	6	375867	375872	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_012622	AAT	2	6	375887	375892	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_012622	ATT	2	6	375923	375928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_012622	GAA	2	6	375951	375956	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_012622	A	6	6	376578	376583	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_012622	TAA	2	6	376596	376601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_012622	TA	3	6	376605	376610	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_012622	AAG	2	6	376616	376621	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_012622	TTG	2	6	376656	376661	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_012622	T	6	6	376706	376711	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_012622	TAAT	2	8	376714	376721	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_012622	ATTT	2	8	376722	376729	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_012622	TTC	2	6	376735	376740	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1114	NC_012622	TAAA	2	8	376789	376796	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_012622	A	6	6	376841	376846	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_012622	CAG	2	6	376884	376889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1117	NC_012622	TCC	2	6	376905	376910	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1118	NC_012622	CTT	2	6	376927	376932	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1119	NC_012622	C	12	12	376933	376944	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1120	NC_012622	TA	3	6	376961	376966	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_012622	CATGC	2	10	376974	376983	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1122	NC_012622	TA	3	6	376988	376993	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_012622	AT	3	6	376996	377001	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_012622	TAG	2	6	377002	377007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_012622	ATA	2	6	377106	377111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_012622	TAG	2	6	377126	377131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_012622	CTA	2	6	377489	377494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1128	NC_012622	TAA	2	6	377534	377539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_012622	AGAGA	2	10	377574	377583	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_012622	ATA	2	6	377614	377619	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_012622	TAAA	2	8	377628	377635	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_012622	A	6	6	377654	377659	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_012622	AGA	2	6	377688	377693	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_012622	AG	3	6	377711	377716	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_012622	TCA	2	6	377862	377867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1136	NC_012622	AGA	2	6	378239	378244	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1137	NC_012622	AGA	3	9	378247	378255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1258	NC_012622	AAT	2	6	395374	395379	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1266	NC_012622	TTC	2	6	396955	396960	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1404	NC_012622	TAC	2	6	432555	432560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1405	NC_012622	T	6	6	432599	432604	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1406	NC_012622	TATAA	2	10	432779	432788	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1410	NC_012622	ACG	2	6	432861	432866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1411	NC_012622	ATA	2	6	432950	432955	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1412	NC_012622	CT	3	6	433016	433021	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1413	NC_012622	GACT	2	8	433143	433150	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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1420	NC_012622	AG	3	6	434449	434454	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1447	NC_012622	TCT	2	6	438692	438697	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1455	NC_012622	AAT	2	6	439038	439043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1456	NC_012622	ATA	2	6	439081	439086	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1457	NC_012622	TA	3	6	439121	439126	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1458	NC_012622	CAC	2	6	439128	439133	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1500	NC_012622	AATA	2	8	445207	445214	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding

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