MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Sulfolobus islandicus M.14.25 chromosome

Total Repeats: 382

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012588	TCATT	2	10	94	103	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_012588	GTCAC	2	10	356	365	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
3	NC_012588	TTAAA	2	10	5880	5889	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012588	ATGTT	2	10	6109	6118	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012588	AAAAT	2	10	27147	27156	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012588	TGGTG	2	10	39030	39039	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012588	TAATT	2	10	61015	61024	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012588	GTTTT	2	10	72053	72062	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012588	ATATG	2	10	82183	82192	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012588	AATTA	2	10	92930	92939	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012588	TTATC	2	10	100767	100776	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_012588	CATGC	2	10	114902	114911	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
13	NC_012588	AAATT	2	10	120052	120061	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012588	GATTA	2	10	120509	120518	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_012588	AAATA	2	10	134097	134106	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012588	GAGTC	2	10	142136	142145	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
17	NC_012588	TTAAA	2	10	162797	162806	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012588	TCTAT	2	10	172755	172764	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_012588	GGAGA	2	10	173384	173393	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
20	NC_012588	GTGAT	2	10	190744	190753	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
21	NC_012588	ATAAA	2	10	199855	199864	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012588	ATAAA	2	10	252622	252631	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012588	TCTCA	2	10	256992	257001	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
24	NC_012588	TCAAT	2	10	266728	266737	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_012588	TTCGA	2	10	269881	269890	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
26	NC_012588	TGAAA	2	10	271039	271048	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_012588	GTGAA	2	10	285855	285864	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
28	NC_012588	CCTAG	2	10	286962	286971	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
29	NC_012588	TAACT	2	10	288695	288704	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_012588	TAAAT	2	10	289002	289011	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_012588	CTTCT	2	10	292470	292479	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
32	NC_012588	ATCAT	2	10	294086	294095	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_012588	CTAAT	2	10	294383	294392	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_012588	TGACT	2	10	300366	300375	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
35	NC_012588	AAATT	2	10	301891	301900	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_012588	TTTAG	2	10	305062	305071	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_012588	TATAA	2	10	306006	306015	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012588	TTAAA	2	10	309508	309517	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_012588	ATTAG	2	10	310845	310854	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_012588	TAAGA	2	10	315847	315856	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_012588	TTGAA	2	10	316380	316389	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_012588	ATCTA	2	10	316831	316840	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
43	NC_012588	CCTTC	2	10	327937	327946	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
44	NC_012588	ACTAC	2	10	332719	332728	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
45	NC_012588	AGGAG	2	10	336073	336082	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
46	NC_012588	TGAAA	2	10	336428	336437	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_012588	TAAAT	2	10	336657	336666	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_012588	ATGGC	2	10	336679	336688	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
49	NC_012588	TTTCT	2	10	338431	338440	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
50	NC_012588	CTTAT	2	10	342476	342485	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
51	NC_012588	TTTTC	2	10	348652	348661	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
52	NC_012588	AGAGG	2	10	349357	349366	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
53	NC_012588	TATAA	2	10	349863	349872	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_012588	ATTAT	2	10	351104	351113	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_012588	TATAA	2	10	360860	360869	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_012588	TTAAT	2	10	385899	385908	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_012588	ATTTT	2	10	388635	388644	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_012588	TGTAT	2	10	390745	390754	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_012588	TTAAA	2	10	390844	390853	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_012588	TTATT	2	10	392425	392434	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_012588	TACTC	2	10	397471	397480	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
62	NC_012588	TGAAA	2	10	400124	400133	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_012588	AGATA	2	10	400148	400157	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_012588	ATATT	2	10	407302	407311	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_012588	AAAGA	2	10	407693	407702	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_012588	GAGAA	2	10	417260	417269	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
67	NC_012588	TAGTT	2	10	426199	426208	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_012588	TTACA	2	10	427043	427052	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
69	NC_012588	GCCTC	2	10	432414	432423	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
70	NC_012588	TCGTT	2	10	435715	435724	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
71	NC_012588	TACTT	2	10	435941	435950	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
72	NC_012588	CCGTA	2	10	436655	436664	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
73	NC_012588	GCCTC	2	10	441571	441580	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
74	NC_012588	ATATT	2	10	441956	441965	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_012588	AGAGA	2	10	442335	442344	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
76	NC_012588	AAAGA	2	10	448730	448739	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_012588	GTACT	2	10	449535	449544	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
78	NC_012588	GTTTT	2	10	449978	449987	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
79	NC_012588	GTGGG	2	10	452674	452683	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
80	NC_012588	TTAAA	2	10	452705	452714	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_012588	TTTAA	2	10	452969	452978	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_012588	TCTCT	2	10	466451	466460	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
83	NC_012588	AAACT	2	10	467720	467729	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_012588	ATTTA	2	10	473562	473571	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_012588	CTTCA	2	10	487337	487346	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
86	NC_012588	TCTTT	2	10	491734	491743	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
87	NC_012588	CATAA	2	10	492298	492307	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
88	NC_012588	CCACT	2	10	493311	493320	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
89	NC_012588	GTTTA	2	10	497948	497957	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_012588	TTACA	2	10	510535	510544	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
91	NC_012588	AGGTT	2	10	526682	526691	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
92	NC_012588	ACCCT	2	10	532673	532682	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
93	NC_012588	GGAGT	2	10	537093	537102	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
94	NC_012588	ATTCT	2	10	546731	546740	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
95	NC_012588	ATATT	2	10	563569	563578	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_012588	AACAT	2	10	571506	571515	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
97	NC_012588	AACTT	2	10	572117	572126	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
98	NC_012588	TTTTA	2	10	579986	579995	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_012588	TTTCA	2	10	588167	588176	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
100	NC_012588	CAAAG	2	10	588861	588870	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
101	NC_012588	TGATA	2	10	593569	593578	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_012588	TAAAA	2	10	606161	606170	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_012588	AAGTT	2	10	614174	614183	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_012588	AGAGT	2	10	619782	619791	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
105	NC_012588	CCGGT	2	10	623004	623013	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
106	NC_012588	TTAGA	2	10	623051	623060	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
107	NC_012588	TGAAA	2	10	628893	628902	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NC_012588	TAATT	2	10	629026	629035	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_012588	TGAAA	2	10	644156	644165	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_012588	TATAA	2	10	644285	644294	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_012588	TAAAT	2	10	648704	648713	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_012588	GCGTT	2	10	648755	648764	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
113	NC_012588	ATTGA	2	10	649016	649025	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
114	NC_012588	TATCT	2	10	651967	651976	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
115	NC_012588	GATTA	2	10	655764	655773	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_012588	ATTAC	2	10	667019	667028	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
117	NC_012588	ATCAC	2	10	671123	671132	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
118	NC_012588	TTGTT	2	10	674810	674819	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_012588	AAAAT	2	10	674852	674861	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_012588	TTTTA	2	10	683417	683426	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_012588	TATAA	2	10	683802	683811	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_012588	TAAAA	2	10	690224	690233	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_012588	TTATA	2	10	694583	694592	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_012588	CTCTT	2	10	698313	698322	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
125	NC_012588	AAGAA	2	10	700041	700050	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
126	NC_012588	TACTT	2	10	700537	700546	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
127	NC_012588	TATAA	2	10	713195	713204	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_012588	GGCAT	2	10	713399	713408	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
129	NC_012588	TGAAA	2	10	716359	716368	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
130	NC_012588	ATTCT	2	10	721418	721427	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
131	NC_012588	ATATT	2	10	724243	724252	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_012588	TATGA	2	10	728787	728796	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
133	NC_012588	CAAAT	2	10	729376	729385	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
134	NC_012588	TATTT	2	10	730202	730211	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_012588	ATAGT	2	10	736638	736647	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
136	NC_012588	AAATA	2	10	748040	748049	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_012588	TCTAT	2	10	756570	756579	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
138	NC_012588	TATAA	2	10	757870	757879	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_012588	TAAAA	2	10	761683	761692	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_012588	CTTTT	2	10	769636	769645	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
141	NC_012588	ATCTT	2	10	778591	778600	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
142	NC_012588	TATAA	2	10	778654	778663	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_012588	TCCTT	2	10	778750	778759	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
144	NC_012588	ATACA	2	10	779236	779245	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
145	NC_012588	TTTAA	2	10	788676	788685	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_012588	CCGAA	2	10	789423	789432	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
147	NC_012588	GAAGA	2	10	790325	790334	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
148	NC_012588	TATTC	2	10	792079	792088	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
149	NC_012588	TACTT	2	10	796870	796879	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
150	NC_012588	TTTTA	2	10	811707	811716	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_012588	TAACG	2	10	811802	811811	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
152	NC_012588	CTTGA	2	10	821915	821924	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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157	NC_012588	AGGTT	2	10	842146	842155	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
158	NC_012588	GCTGT	2	10	842559	842568	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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162	NC_012588	TTTTA	2	10	847647	847656	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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165	NC_012588	TAATA	2	10	851469	851478	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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183	NC_012588	AGTTT	2	10	912902	912911	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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189	NC_012588	TATAT	2	10	932590	932599	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
190	NC_012588	TACTC	2	10	940974	940983	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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193	NC_012588	GCTAT	2	10	951307	951316	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
194	NC_012588	TACCT	2	10	952078	952087	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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196	NC_012588	TATTT	2	10	963350	963359	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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273	NC_012588	CGAAA	2	10	1719249	1719258	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.