MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Sinorhizobium fredii NGR234 chromosome

Total Repeats: 9844

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_012587	TGA	2	6	1662400	1662405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4002	NC_012587	GAC	2	6	1662454	1662459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4003	NC_012587	CG	3	6	1662485	1662490	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4004	NC_012587	GCG	2	6	1662503	1662508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4005	NC_012587	GC	3	6	1662550	1662555	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4006	NC_012587	GCC	2	6	1662560	1662565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4007	NC_012587	GGC	2	6	1662577	1662582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4008	NC_012587	TCG	2	6	1662627	1662632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4009	NC_012587	GCA	2	6	1662658	1662663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4010	NC_012587	CG	3	6	1662680	1662685	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4011	NC_012587	CGC	2	6	1662714	1662719	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4012	NC_012587	GAG	2	6	1664349	1664354	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_012587	GCC	2	6	1664363	1664368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4014	NC_012587	CCG	2	6	1664683	1664688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4015	NC_012587	CTGC	2	8	1664690	1664697	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4016	NC_012587	GA	3	6	1664721	1664726	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4017	NC_012587	GCT	2	6	1664809	1664814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4018	NC_012587	CT	3	6	1664827	1664832	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4019	NC_012587	ACA	2	6	1664834	1664839	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4020	NC_012587	GAC	2	6	1664841	1664846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4021	NC_012587	GAA	2	6	1664857	1664862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4022	NC_012587	CGC	2	6	1666100	1666105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4023	NC_012587	CAA	2	6	1666659	1666664	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4024	NC_012587	CAAGG	2	10	1667824	1667833	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
4025	NC_012587	GCT	2	6	1668524	1668529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4026	NC_012587	GGC	2	6	1668534	1668539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4027	NC_012587	GCC	2	6	1668561	1668566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4028	NC_012587	TTC	2	6	1668989	1668994	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4029	NC_012587	TCC	2	6	1669310	1669315	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4030	NC_012587	CGG	2	6	1669381	1669386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4031	NC_012587	TC	3	6	1669462	1669467	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4032	NC_012587	CGG	2	6	1669517	1669522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4033	NC_012587	GGC	2	6	1669611	1669616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4034	NC_012587	GCTC	2	8	1669694	1669701	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4035	NC_012587	GCG	2	6	1669703	1669708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4036	NC_012587	TGA	2	6	1669765	1669770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4037	NC_012587	TAA	2	6	1669776	1669781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4038	NC_012587	GAC	2	6	1671249	1671254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4039	NC_012587	CGA	2	6	1671266	1671271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4040	NC_012587	GTT	2	6	1671281	1671286	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_012587	TGC	2	6	1671291	1671296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4042	NC_012587	CGC	2	6	1671991	1671996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4043	NC_012587	AAG	2	6	1672012	1672017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_012587	GC	3	6	1672079	1672084	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4045	NC_012587	GC	3	6	1674687	1674692	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4046	NC_012587	GGT	2	6	1674953	1674958	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4047	NC_012587	TGG	2	6	1675000	1675005	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4048	NC_012587	CATG	2	8	1675019	1675026	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4049	NC_012587	AGGA	2	8	1675070	1675077	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4050	NC_012587	T	6	6	1675466	1675471	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4051	NC_012587	GAA	2	6	1675718	1675723	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4052	NC_012587	TGC	2	6	1675726	1675731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4053	NC_012587	GGC	2	6	1675746	1675751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4054	NC_012587	GCT	2	6	1675765	1675770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4055	NC_012587	ACG	2	6	1677055	1677060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4056	NC_012587	TCC	2	6	1677071	1677076	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4057	NC_012587	GCCC	2	8	1678423	1678430	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4058	NC_012587	CGGG	2	8	1678438	1678445	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4059	NC_012587	TGA	2	6	1678457	1678462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4060	NC_012587	AAG	2	6	1680319	1680324	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4061	NC_012587	TCC	3	9	1680352	1680360	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4062	NC_012587	CTC	2	6	1681319	1681324	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4063	NC_012587	GGC	2	6	1681346	1681351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4064	NC_012587	GTTC	2	8	1681382	1681389	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4065	NC_012587	A	7	7	1681404	1681410	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4066	NC_012587	CTC	2	6	1682135	1682140	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4067	NC_012587	TGC	2	6	1682227	1682232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4068	NC_012587	GGC	2	6	1682243	1682248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4069	NC_012587	AT	3	6	1682849	1682854	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4070	NC_012587	ATA	2	6	1682877	1682882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4071	NC_012587	TCT	2	6	1682883	1682888	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4072	NC_012587	ATGT	2	8	1683318	1683325	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4073	NC_012587	GGA	2	6	1683332	1683337	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4074	NC_012587	GATT	2	8	1684892	1684899	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4075	NC_012587	CCG	2	6	1684906	1684911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4076	NC_012587	CG	3	6	1685029	1685034	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4077	NC_012587	CAG	2	6	1685085	1685090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4078	NC_012587	CAAG	2	8	1687019	1687026	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4079	NC_012587	ACG	2	6	1688352	1688357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4080	NC_012587	CTG	2	6	1689324	1689329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4081	NC_012587	TTC	2	6	1691117	1691122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4082	NC_012587	GCC	2	6	1693894	1693899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4083	NC_012587	CGC	2	6	1693910	1693915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4084	NC_012587	GCA	2	6	1693964	1693969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4085	NC_012587	GCC	2	6	1695171	1695176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4086	NC_012587	GCT	2	6	1695320	1695325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4087	NC_012587	GGC	2	6	1696317	1696322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4088	NC_012587	ATC	2	6	1696367	1696372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4089	NC_012587	CTG	2	6	1700006	1700011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4090	NC_012587	GTC	2	6	1700017	1700022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4091	NC_012587	CGC	2	6	1700023	1700028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4092	NC_012587	GCCGC	2	10	1700051	1700060	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
4093	NC_012587	GCC	2	6	1700082	1700087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4094	NC_012587	TCG	2	6	1700201	1700206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4095	NC_012587	ATC	2	6	1700214	1700219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4096	NC_012587	CAG	2	6	1700238	1700243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4097	NC_012587	A	6	6	1700312	1700317	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4098	NC_012587	CTG	2	6	1701375	1701380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4099	NC_012587	GAA	2	6	1701893	1701898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4100	NC_012587	GCG	2	6	1701908	1701913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4101	NC_012587	CGC	2	6	1702812	1702817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4102	NC_012587	CATC	2	8	1702841	1702848	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4103	NC_012587	CG	3	6	1702914	1702919	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4104	NC_012587	TCA	2	6	1702922	1702927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4105	NC_012587	TGC	2	6	1702954	1702959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4106	NC_012587	AGG	2	6	1703002	1703007	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4107	NC_012587	CAA	2	6	1703034	1703039	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4108	NC_012587	GAT	2	6	1704550	1704555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4109	NC_012587	CCG	2	6	1704578	1704583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4110	NC_012587	GC	4	8	1704618	1704625	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4111	NC_012587	CCG	2	6	1704640	1704645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4112	NC_012587	GATC	2	8	1705710	1705717	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4113	NC_012587	CG	3	6	1706295	1706300	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4114	NC_012587	CGC	2	6	1706322	1706327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4115	NC_012587	TGC	2	6	1706342	1706347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4116	NC_012587	CGG	2	6	1708675	1708680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4117	NC_012587	TCG	2	6	1708706	1708711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4118	NC_012587	TGC	2	6	1709518	1709523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4119	NC_012587	CAT	2	6	1709663	1709668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4120	NC_012587	ATTT	2	8	1709714	1709721	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4121	NC_012587	GCA	2	6	1709850	1709855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4122	NC_012587	CTCC	2	8	1709860	1709867	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
4123	NC_012587	CCT	2	6	1709888	1709893	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4124	NC_012587	CTCG	2	8	1709897	1709904	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4125	NC_012587	T	8	8	1709925	1709932	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4126	NC_012587	GGA	3	9	1709952	1709960	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4127	NC_012587	CTG	2	6	1709962	1709967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4128	NC_012587	GGC	2	6	1710980	1710985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4129	NC_012587	CAA	2	6	1712180	1712185	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4130	NC_012587	GCA	2	6	1712254	1712259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4262	NC_012587	GCA	2	6	1762950	1762955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4367	NC_012587	CGC	2	6	1804552	1804557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4368	NC_012587	GC	4	8	1804581	1804588	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4369	NC_012587	CGC	2	6	1804630	1804635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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4388	NC_012587	TCG	2	6	1808608	1808613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4389	NC_012587	GGC	2	6	1808641	1808646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4390	NC_012587	GCCG	2	8	1808699	1808706	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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