MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Sinorhizobium fredii NGR234 chromosome

Total Repeats: 9844

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_012587	CG	3	6	1457767	1457772	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3502	NC_012587	TGCGCA	2	12	1458440	1458451	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3503	NC_012587	GCA	2	6	1459601	1459606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3504	NC_012587	TCG	2	6	1459656	1459661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3505	NC_012587	TC	3	6	1459725	1459730	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3506	NC_012587	ATCT	2	8	1460395	1460402	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3507	NC_012587	TTTGA	2	10	1460404	1460413	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
3508	NC_012587	GCTTTT	2	12	1460440	1460451	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3509	NC_012587	A	7	7	1460507	1460513	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3510	NC_012587	CTG	2	6	1460616	1460621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3511	NC_012587	GCC	2	6	1460653	1460658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3512	NC_012587	GGC	2	6	1460672	1460677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3513	NC_012587	TAC	2	6	1460725	1460730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3514	NC_012587	TCA	2	6	1460757	1460762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3515	NC_012587	GGC	2	6	1460771	1460776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3516	NC_012587	CGC	2	6	1461276	1461281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3517	NC_012587	ATCC	2	8	1462423	1462430	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3518	NC_012587	CGT	3	9	1462521	1462529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3519	NC_012587	ATG	2	6	1462650	1462655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3520	NC_012587	GGA	2	6	1462661	1462666	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3521	NC_012587	CTC	2	6	1463411	1463416	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3522	NC_012587	GC	3	6	1463454	1463459	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3523	NC_012587	CCT	2	6	1463506	1463511	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3524	NC_012587	CTT	2	6	1463518	1463523	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3525	NC_012587	CAT	2	6	1464385	1464390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3526	NC_012587	TCC	2	6	1464437	1464442	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3527	NC_012587	GA	3	6	1464989	1464994	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3528	NC_012587	GC	3	6	1465024	1465029	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3529	NC_012587	TGG	2	6	1465033	1465038	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3530	NC_012587	GCGG	2	8	1465056	1465063	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3531	NC_012587	C	6	6	1465070	1465075	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3532	NC_012587	CCT	2	6	1466576	1466581	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3533	NC_012587	GCG	2	6	1466659	1466664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3534	NC_012587	A	7	7	1466665	1466671	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3535	NC_012587	CGG	2	6	1466677	1466682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3536	NC_012587	GCCC	2	8	1466697	1466704	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3537	NC_012587	TC	3	6	1466729	1466734	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3538	NC_012587	TTG	2	6	1468271	1468276	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3539	NC_012587	CCGCG	2	10	1468312	1468321	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
3540	NC_012587	ATTTG	2	10	1468830	1468839	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
3541	NC_012587	TGA	2	6	1468875	1468880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3542	NC_012587	TCA	2	6	1468893	1468898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3543	NC_012587	GCC	2	6	1468984	1468989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3544	NC_012587	GAA	2	6	1469198	1469203	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3545	NC_012587	GGA	2	6	1469205	1469210	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3546	NC_012587	GCT	2	6	1469318	1469323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3547	NC_012587	TGG	2	6	1469341	1469346	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3548	NC_012587	CATTG	2	10	1469367	1469376	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3549	NC_012587	GC	3	6	1469379	1469384	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3550	NC_012587	CG	3	6	1469403	1469408	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3551	NC_012587	TGT	2	6	1471133	1471138	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3552	NC_012587	CGC	3	9	1472573	1472581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3553	NC_012587	GTT	2	6	1472590	1472595	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3554	NC_012587	T	6	6	1472594	1472599	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3555	NC_012587	TGC	2	6	1477690	1477695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3556	NC_012587	CGC	2	6	1478784	1478789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3557	NC_012587	AGGCGC	2	12	1478845	1478856	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
3558	NC_012587	CCG	2	6	1478877	1478882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3559	NC_012587	CCT	2	6	1478904	1478909	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3560	NC_012587	GAC	2	6	1478923	1478928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3561	NC_012587	GGACG	2	10	1478945	1478954	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
3562	NC_012587	GA	3	6	1478970	1478975	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3563	NC_012587	CGGC	2	8	1478980	1478987	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3564	NC_012587	A	7	7	1479030	1479036	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3565	NC_012587	TGCA	2	8	1479081	1479088	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3566	NC_012587	TC	3	6	1480016	1480021	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3567	NC_012587	A	6	6	1482146	1482151	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3568	NC_012587	TGC	2	6	1483486	1483491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3569	NC_012587	CGT	2	6	1483499	1483504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3570	NC_012587	AG	3	6	1483534	1483539	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3571	NC_012587	GCC	2	6	1484477	1484482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3572	NC_012587	TGT	2	6	1484494	1484499	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3573	NC_012587	TGC	2	6	1484547	1484552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3574	NC_012587	CAC	2	6	1484556	1484561	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3575	NC_012587	TGG	2	6	1484646	1484651	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3576	NC_012587	AT	3	6	1485450	1485455	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3577	NC_012587	CGC	2	6	1485486	1485491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3578	NC_012587	T	6	6	1485546	1485551	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3579	NC_012587	GC	3	6	1485557	1485562	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3580	NC_012587	CG	3	6	1485672	1485677	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3581	NC_012587	CAAA	2	8	1486704	1486711	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3582	NC_012587	CAG	2	6	1486763	1486768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3583	NC_012587	CCGGA	2	10	1486769	1486778	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
3584	NC_012587	CGGG	2	8	1488942	1488949	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3585	NC_012587	AAAT	2	8	1489003	1489010	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3586	NC_012587	CGC	2	6	1489035	1489040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3587	NC_012587	CCG	2	6	1489120	1489125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3588	NC_012587	GCG	2	6	1489148	1489153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3589	NC_012587	ACGAA	2	10	1489175	1489184	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
3590	NC_012587	GGC	2	6	1489192	1489197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3591	NC_012587	CCACG	2	10	1495692	1495701	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
3592	NC_012587	AGC	2	6	1495836	1495841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3593	NC_012587	GCA	2	6	1495868	1495873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3594	NC_012587	AGG	2	6	1495874	1495879	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3595	NC_012587	CGCGG	2	10	1496663	1496672	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
3596	NC_012587	CCG	2	6	1496678	1496683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3597	NC_012587	CCT	2	6	1496690	1496695	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3598	NC_012587	CGT	2	6	1496730	1496735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3599	NC_012587	CAG	2	6	1496752	1496757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3600	NC_012587	GAC	2	6	1496771	1496776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3601	NC_012587	CTG	2	6	1498171	1498176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3602	NC_012587	GTT	2	6	1501744	1501749	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3603	NC_012587	GCGG	2	8	1505695	1505702	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3604	NC_012587	AT	3	6	1505765	1505770	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3605	NC_012587	GAA	2	6	1505837	1505842	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3606	NC_012587	GACG	2	8	1507359	1507366	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3607	NC_012587	GC	3	6	1512908	1512913	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3608	NC_012587	GCC	2	6	1512917	1512922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3609	NC_012587	GCA	2	6	1517269	1517274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3610	NC_012587	AGC	2	6	1517327	1517332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3611	NC_012587	CAA	2	6	1519273	1519278	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3612	NC_012587	GCC	2	6	1519304	1519309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3613	NC_012587	ATC	2	6	1519313	1519318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3614	NC_012587	GC	3	6	1519337	1519342	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3615	NC_012587	CGT	2	6	1519361	1519366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3616	NC_012587	A	6	6	1519373	1519378	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3617	NC_012587	CGG	2	6	1519472	1519477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3618	NC_012587	TCGCT	2	10	1520163	1520172	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
3619	NC_012587	CGG	2	6	1520228	1520233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3620	NC_012587	GC	3	6	1520706	1520711	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3621	NC_012587	CTG	2	6	1520733	1520738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3622	NC_012587	TG	3	6	1522245	1522250	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3623	NC_012587	G	6	6	1522299	1522304	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3624	NC_012587	GTCA	2	8	1522315	1522322	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3625	NC_012587	TC	3	6	1522672	1522677	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3626	NC_012587	GAT	2	6	1522751	1522756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3627	NC_012587	CAC	2	6	1522801	1522806	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3628	NC_012587	T	6	6	1522835	1522840	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3629	NC_012587	TCA	2	6	1522849	1522854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3631	NC_012587	ATA	2	6	1522936	1522941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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