MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Sinorhizobium fredii NGR234 chromosome

Total Repeats: 9844

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_012587	ACGC	2	8	1237838	1237845	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3002	NC_012587	TGC	2	6	1237857	1237862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3003	NC_012587	CG	3	6	1237871	1237876	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3004	NC_012587	TTG	2	6	1237897	1237902	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3005	NC_012587	CCG	2	6	1237962	1237967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3006	NC_012587	AAG	2	6	1238435	1238440	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3007	NC_012587	GA	3	6	1238443	1238448	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3008	NC_012587	AAG	2	6	1242366	1242371	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3009	NC_012587	AAGG	2	8	1242785	1242792	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3010	NC_012587	CG	3	6	1246776	1246781	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3011	NC_012587	CCG	2	6	1247702	1247707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3012	NC_012587	AAC	2	6	1247842	1247847	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3013	NC_012587	AAG	2	6	1247848	1247853	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3014	NC_012587	AAG	2	6	1249127	1249132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3015	NC_012587	ACAG	2	8	1249884	1249891	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3016	NC_012587	GAAAA	2	10	1250914	1250923	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
3017	NC_012587	AAGA	2	8	1251524	1251531	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3018	NC_012587	AAG	2	6	1251539	1251544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3019	NC_012587	CCG	2	6	1251577	1251582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3020	NC_012587	CAA	2	6	1251622	1251627	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3021	NC_012587	CGT	2	6	1251703	1251708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3022	NC_012587	CGA	2	6	1251709	1251714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3023	NC_012587	TGA	2	6	1252215	1252220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3024	NC_012587	ACG	2	6	1252370	1252375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3025	NC_012587	GTC	2	6	1254365	1254370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3026	NC_012587	TCC	2	6	1254415	1254420	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3027	NC_012587	TCAA	2	8	1254514	1254521	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3028	NC_012587	GGC	2	6	1254524	1254529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3029	NC_012587	GAC	2	6	1255122	1255127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3030	NC_012587	CGG	2	6	1255160	1255165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3031	NC_012587	TGG	2	6	1255656	1255661	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3032	NC_012587	AACG	2	8	1255663	1255670	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3033	NC_012587	GCGG	2	8	1256706	1256713	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3034	NC_012587	GGA	2	6	1258882	1258887	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3035	NC_012587	GCGCG	2	10	1258902	1258911	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
3036	NC_012587	GCC	2	6	1258936	1258941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3037	NC_012587	CGA	2	6	1258951	1258956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3038	NC_012587	T	6	6	1259030	1259035	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3039	NC_012587	CG	3	6	1259066	1259071	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3040	NC_012587	GTA	2	6	1259097	1259102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3041	NC_012587	TGC	2	6	1259111	1259116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3042	NC_012587	CGG	2	6	1261915	1261920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3043	NC_012587	TGC	2	6	1261928	1261933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3044	NC_012587	GCC	2	6	1261938	1261943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3045	NC_012587	ATG	2	6	1261960	1261965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3046	NC_012587	TTC	2	6	1264841	1264846	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3047	NC_012587	GC	3	6	1264926	1264931	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3048	NC_012587	AGCC	2	8	1264955	1264962	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3049	NC_012587	GCC	2	6	1264973	1264978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3050	NC_012587	ACG	2	6	1265184	1265189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3051	NC_012587	TA	3	6	1265249	1265254	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3052	NC_012587	AGGC	2	8	1265590	1265597	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3053	NC_012587	CGC	2	6	1267110	1267115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3054	NC_012587	GTT	2	6	1267123	1267128	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3055	NC_012587	TTC	2	6	1268774	1268779	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3056	NC_012587	CG	3	6	1268841	1268846	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3057	NC_012587	GCTC	2	8	1269263	1269270	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3058	NC_012587	ATC	2	6	1269596	1269601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3059	NC_012587	TGA	2	6	1271200	1271205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3060	NC_012587	CG	4	8	1271230	1271237	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3061	NC_012587	GTC	2	6	1271308	1271313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3062	NC_012587	CCG	2	6	1271354	1271359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3063	NC_012587	TCT	2	6	1271451	1271456	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3064	NC_012587	TTTA	2	8	1271511	1271518	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3065	NC_012587	GTC	2	6	1271563	1271568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3066	NC_012587	CT	4	8	1271573	1271580	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3067	NC_012587	C	7	7	1271601	1271607	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3068	NC_012587	AG	3	6	1271617	1271622	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3069	NC_012587	GGCTA	2	10	1271628	1271637	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
3070	NC_012587	ACA	2	6	1271660	1271665	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3071	NC_012587	A	9	9	1271694	1271702	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3072	NC_012587	CGA	2	6	1271785	1271790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3073	NC_012587	TGA	2	6	1271818	1271823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3074	NC_012587	CGAT	2	8	1271829	1271836	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3075	NC_012587	GTC	2	6	1271860	1271865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3076	NC_012587	GCT	3	9	1271870	1271878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3077	NC_012587	AAG	2	6	1271904	1271909	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3078	NC_012587	GCA	2	6	1273969	1273974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3079	NC_012587	CG	3	6	1276920	1276925	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3080	NC_012587	GC	3	6	1276935	1276940	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3081	NC_012587	GCG	3	9	1277401	1277409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3082	NC_012587	TGC	2	6	1277504	1277509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3083	NC_012587	AGG	2	6	1277713	1277718	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3084	NC_012587	TC	3	6	1278365	1278370	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3085	NC_012587	T	6	6	1278429	1278434	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3086	NC_012587	TCG	2	6	1280470	1280475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3087	NC_012587	CG	3	6	1280485	1280490	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3088	NC_012587	T	6	6	1280496	1280501	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3089	NC_012587	GAT	2	6	1282064	1282069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3090	NC_012587	GTCG	3	12	1282893	1282904	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3091	NC_012587	GATC	2	8	1282908	1282915	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3092	NC_012587	TA	3	6	1282943	1282948	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3093	NC_012587	CGGG	2	8	1283020	1283027	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3094	NC_012587	GGCA	2	8	1283047	1283054	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3095	NC_012587	TGACCG	2	12	1284500	1284511	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3096	NC_012587	GCG	2	6	1284983	1284988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3097	NC_012587	AGCCG	2	10	1285013	1285022	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
3098	NC_012587	GTC	2	6	1286885	1286890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3099	NC_012587	ATG	2	6	1286954	1286959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3100	NC_012587	GCAG	2	8	1287022	1287029	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3101	NC_012587	CCA	2	6	1287033	1287038	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3102	NC_012587	CCGT	2	8	1287792	1287799	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3103	NC_012587	GCACA	2	10	1287838	1287847	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
3104	NC_012587	CGG	2	6	1287860	1287865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3105	NC_012587	CGCT	2	8	1287880	1287887	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3106	NC_012587	CGCC	2	8	1287921	1287928	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3107	NC_012587	TAGAA	2	10	1288759	1288768	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
3108	NC_012587	GAATAA	2	12	1288777	1288788	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3109	NC_012587	GCG	2	6	1288893	1288898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3110	NC_012587	GCG	2	6	1288901	1288906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3111	NC_012587	TGG	2	6	1288941	1288946	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3112	NC_012587	GCG	2	6	1288962	1288967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3113	NC_012587	GC	3	6	1289088	1289093	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3114	NC_012587	GTC	2	6	1289229	1289234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3115	NC_012587	AGA	2	6	1289238	1289243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3116	NC_012587	CCG	2	6	1289250	1289255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3117	NC_012587	AG	3	6	1290953	1290958	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3118	NC_012587	CG	3	6	1291725	1291730	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3119	NC_012587	TTA	2	6	1291733	1291738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3120	NC_012587	GC	3	6	1291740	1291745	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3121	NC_012587	GGAT	2	8	1291827	1291834	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3122	NC_012587	CAA	2	6	1291840	1291845	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3123	NC_012587	TC	3	6	1291868	1291873	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3124	NC_012587	GCGCC	2	10	1291887	1291896	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
3125	NC_012587	CGG	2	6	1292033	1292038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3126	NC_012587	GCA	2	6	1292077	1292082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3127	NC_012587	CGC	2	6	1292590	1292595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3128	NC_012587	CGAGC	2	10	1292607	1292616	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
3129	NC_012587	GAT	2	6	1292686	1292691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3130	NC_012587	GCGG	2	8	1292752	1292759	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3131	NC_012587	CA	3	6	1292767	1292772	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3132	NC_012587	CCG	2	6	1293768	1293773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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