MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Sinorhizobium fredii NGR234 chromosome

Total Repeats: 9844

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_012587	GC	3	6	189393	189398	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
502	NC_012587	CGGT	2	8	189403	189410	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
503	NC_012587	A	6	6	189461	189466	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_012587	TCGCA	2	10	189469	189478	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
505	NC_012587	A	6	6	189478	189483	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_012587	GGC	2	6	189493	189498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
507	NC_012587	TGAA	2	8	189521	189528	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
508	NC_012587	A	6	6	189560	189565	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_012587	GTT	2	6	189582	189587	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
510	NC_012587	GTT	2	6	189647	189652	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
511	NC_012587	GGCTG	2	10	189670	189679	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
512	NC_012587	CGA	2	6	189727	189732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
513	NC_012587	CCCG	2	8	193578	193585	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
514	NC_012587	CGGT	2	8	193634	193641	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
515	NC_012587	GTG	2	6	193658	193663	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
516	NC_012587	GAA	2	6	193679	193684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
517	NC_012587	AAT	2	6	193717	193722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_012587	TGCAGT	2	12	193767	193778	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
519	NC_012587	GTT	2	6	193800	193805	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
520	NC_012587	TG	3	6	195607	195612	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
521	NC_012587	AG	3	6	195624	195629	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
522	NC_012587	GCG	2	6	195673	195678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
523	NC_012587	C	6	6	196726	196731	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
524	NC_012587	G	6	6	196760	196765	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
525	NC_012587	TCG	2	6	196803	196808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_012587	CG	3	6	196839	196844	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
527	NC_012587	C	6	6	196860	196865	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
528	NC_012587	G	6	6	196894	196899	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
529	NC_012587	CCCG	2	8	196914	196921	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
530	NC_012587	TC	4	8	196934	196941	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
531	NC_012587	CCA	2	6	200260	200265	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
532	NC_012587	CTG	2	6	200267	200272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
533	NC_012587	GCGTT	2	10	200333	200342	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
534	NC_012587	GGGTT	2	10	201291	201300	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
535	NC_012587	GACG	2	8	201303	201310	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
536	NC_012587	CG	3	6	201363	201368	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
537	NC_012587	GGA	2	6	205131	205136	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
538	NC_012587	GC	3	6	205596	205601	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
539	NC_012587	GGA	2	6	205602	205607	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
540	NC_012587	TGC	2	6	205644	205649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
541	NC_012587	GGGA	2	8	205663	205670	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
542	NC_012587	AAC	2	6	206332	206337	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
543	NC_012587	CTG	2	6	206361	206366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
544	NC_012587	TCT	2	6	206373	206378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
545	NC_012587	GCC	2	6	206453	206458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
546	NC_012587	GCG	2	6	206479	206484	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
547	NC_012587	CTC	2	6	210065	210070	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
548	NC_012587	GC	5	10	210160	210169	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
549	NC_012587	CGC	2	6	210172	210177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
550	NC_012587	ACC	2	6	210232	210237	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
551	NC_012587	GA	3	6	210288	210293	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
552	NC_012587	GAT	2	6	210731	210736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
553	NC_012587	GCGG	2	8	210797	210804	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
554	NC_012587	CA	3	6	210812	210817	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
555	NC_012587	TCA	2	6	210849	210854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
556	NC_012587	AT	3	6	210864	210869	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_012587	CGGG	2	8	210894	210901	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
558	NC_012587	GCG	2	6	210915	210920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
559	NC_012587	CGTG	2	8	210935	210942	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
560	NC_012587	TGC	2	6	210979	210984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
561	NC_012587	CGAT	2	8	212226	212233	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
562	NC_012587	GGC	2	6	212254	212259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
563	NC_012587	GCG	2	6	212295	212300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
564	NC_012587	AGC	2	6	212372	212377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
565	NC_012587	CCG	2	6	213819	213824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
566	NC_012587	CGG	2	6	213844	213849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
567	NC_012587	CTG	2	6	213876	213881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
568	NC_012587	AC	4	8	213882	213889	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
569	NC_012587	TGC	2	6	213941	213946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
570	NC_012587	GC	3	6	214029	214034	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
571	NC_012587	G	6	6	214099	214104	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
572	NC_012587	TGCC	2	8	214137	214144	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
573	NC_012587	GCA	2	6	214166	214171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
574	NC_012587	CCG	2	6	214195	214200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
575	NC_012587	GCCA	2	8	214249	214256	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
576	NC_012587	CGA	2	6	214262	214267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
577	NC_012587	CAG	2	6	216727	216732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
578	NC_012587	TCG	2	6	216768	216773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
579	NC_012587	GCC	2	6	216844	216849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
580	NC_012587	CGG	2	6	216897	216902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
581	NC_012587	CCG	2	6	219771	219776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
582	NC_012587	T	6	6	220577	220582	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
583	NC_012587	GTT	2	6	220584	220589	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
584	NC_012587	ATCGG	2	10	225192	225201	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
585	NC_012587	GA	3	6	225237	225242	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
586	NC_012587	CGG	2	6	225685	225690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
587	NC_012587	T	6	6	228363	228368	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
588	NC_012587	TGC	2	6	228378	228383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
589	NC_012587	TCG	2	6	228395	228400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
590	NC_012587	ATT	2	6	228497	228502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
591	NC_012587	TCT	3	9	228505	228513	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
592	NC_012587	ATT	2	6	228541	228546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_012587	GGA	2	6	228797	228802	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
594	NC_012587	GCC	2	6	229042	229047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
595	NC_012587	TGA	2	6	229121	229126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
596	NC_012587	GGCC	2	8	229127	229134	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
597	NC_012587	GCC	2	6	229148	229153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
598	NC_012587	CGC	2	6	229220	229225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
599	NC_012587	A	7	7	229247	229253	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
600	NC_012587	GC	3	6	229279	229284	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
601	NC_012587	GGC	2	6	229298	229303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
602	NC_012587	GCA	2	6	233306	233311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
603	NC_012587	GC	4	8	233351	233358	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
604	NC_012587	CCTG	2	8	234187	234194	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
605	NC_012587	CCG	2	6	234195	234200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
606	NC_012587	GAT	2	6	234232	234237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
607	NC_012587	GCGG	2	8	234296	234303	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
608	NC_012587	CA	3	6	234312	234317	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
609	NC_012587	GGT	2	6	243338	243343	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
610	NC_012587	T	6	6	243351	243356	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_012587	C	6	6	243359	243364	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
612	NC_012587	TGC	2	6	243365	243370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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614	NC_012587	CGG	2	6	243531	243536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
615	NC_012587	TTG	2	6	243542	243547	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
616	NC_012587	CGG	2	6	243576	243581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
617	NC_012587	GCG	2	6	243600	243605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
618	NC_012587	CGC	2	6	244904	244909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
619	NC_012587	GC	3	6	244908	244913	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
620	NC_012587	ATCG	2	8	244926	244933	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
621	NC_012587	CCGG	2	8	244971	244978	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
622	NC_012587	GCC	2	6	244990	244995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
623	NC_012587	CG	3	6	244997	245002	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
624	NC_012587	TGAT	2	8	245008	245015	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
625	NC_012587	GCCG	2	8	245037	245044	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
626	NC_012587	CGG	2	6	245057	245062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
627	NC_012587	GAG	2	6	245067	245072	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
628	NC_012587	ATCG	2	8	245695	245702	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
629	NC_012587	A	7	7	247071	247077	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
630	NC_012587	CCGG	2	8	247082	247089	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
631	NC_012587	GAAA	2	8	247098	247105	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
632	NC_012587	CCA	2	6	247122	247127	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
633	NC_012587	A	6	6	247208	247213	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
634	NC_012587	ATG	2	6	247288	247293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
635	NC_012587	CGGC	2	8	247624	247631	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
636	NC_012587	TCC	2	6	247816	247821	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
637	NC_012587	CTG	2	6	247844	247849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
638	NC_012587	GGC	2	6	247878	247883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
639	NC_012587	TAT	2	6	247910	247915	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
640	NC_012587	TAA	2	6	247919	247924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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793	NC_012587	GCG	2	6	307937	307942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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795	NC_012587	CGGC	2	8	307977	307984	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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803	NC_012587	AAG	2	6	313438	313443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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861	NC_012587	TC	3	6	344892	344897	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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903	NC_012587	CGG	2	6	366735	366740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
904	NC_012587	CAT	2	6	366776	366781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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906	NC_012587	TACA	2	8	366842	366849	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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908	NC_012587	CGGC	2	8	367778	367785	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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