MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Sinorhizobium fredii NGR234 chromosome

Total Repeats: 9844

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_012587	AGA	2	6	2370283	2370288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6002	NC_012587	CG	3	6	2370953	2370958	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6003	NC_012587	CG	3	6	2370966	2370971	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6004	NC_012587	GCC	2	6	2371000	2371005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6005	NC_012587	CGC	2	6	2371031	2371036	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6006	NC_012587	CAA	2	6	2371095	2371100	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6007	NC_012587	TA	3	6	2371117	2371122	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6008	NC_012587	TTA	2	6	2371667	2371672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6009	NC_012587	GCC	2	6	2371712	2371717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6010	NC_012587	GAG	2	6	2371754	2371759	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6011	NC_012587	TGA	2	6	2371767	2371772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6012	NC_012587	TTCGA	2	10	2371783	2371792	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
6013	NC_012587	CGA	2	6	2372613	2372618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6014	NC_012587	CGTT	2	8	2374052	2374059	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6015	NC_012587	CGC	2	6	2374460	2374465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6016	NC_012587	CGG	2	6	2375912	2375917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6017	NC_012587	AC	3	6	2375976	2375981	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6018	NC_012587	CTT	2	6	2376011	2376016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6019	NC_012587	ATC	2	6	2376050	2376055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6020	NC_012587	GAA	2	6	2376118	2376123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6021	NC_012587	TCG	2	6	2376127	2376132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6022	NC_012587	T	6	6	2376183	2376188	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6023	NC_012587	AGC	2	6	2376242	2376247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6024	NC_012587	GTCG	2	8	2376276	2376283	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6025	NC_012587	GCC	3	9	2376318	2376326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6026	NC_012587	GCG	2	6	2376360	2376365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6027	NC_012587	CTT	2	6	2376369	2376374	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6028	NC_012587	CGT	2	6	2378842	2378847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6029	NC_012587	GCC	2	6	2378875	2378880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6030	NC_012587	ATC	2	6	2378913	2378918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6031	NC_012587	CGA	2	6	2378940	2378945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6032	NC_012587	ATA	2	6	2381950	2381955	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6033	NC_012587	GCG	2	6	2381962	2381967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6034	NC_012587	GTC	2	6	2383461	2383466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6035	NC_012587	GCT	2	6	2394119	2394124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6036	NC_012587	CGT	2	6	2394168	2394173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6037	NC_012587	TGT	2	6	2394195	2394200	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6038	NC_012587	TCG	3	9	2397517	2397525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6039	NC_012587	AG	4	8	2401106	2401113	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6040	NC_012587	CCA	2	6	2401123	2401128	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6041	NC_012587	GCA	2	6	2401135	2401140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6042	NC_012587	A	6	6	2401195	2401200	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6043	NC_012587	GAT	2	6	2401245	2401250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6044	NC_012587	GCC	2	6	2401321	2401326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6045	NC_012587	TCCT	2	8	2401775	2401782	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6046	NC_012587	GCA	2	6	2401829	2401834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6047	NC_012587	CG	3	6	2401874	2401879	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6048	NC_012587	GGA	2	6	2401927	2401932	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6049	NC_012587	TCC	2	6	2403516	2403521	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6050	NC_012587	GCA	2	6	2403595	2403600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6051	NC_012587	TGC	2	6	2403652	2403657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6052	NC_012587	GCA	2	6	2403661	2403666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6053	NC_012587	GAG	2	6	2405142	2405147	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6054	NC_012587	CTCC	2	8	2406144	2406151	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
6055	NC_012587	TCC	2	6	2406161	2406166	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6056	NC_012587	GGC	2	6	2406167	2406172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6057	NC_012587	CGG	2	6	2406210	2406215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6058	NC_012587	GCG	2	6	2406235	2406240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6059	NC_012587	TCG	2	6	2406277	2406282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6060	NC_012587	CCGG	2	8	2406288	2406295	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6061	NC_012587	GCC	2	6	2406309	2406314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6062	NC_012587	CCCG	2	8	2406359	2406366	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6063	NC_012587	GTC	2	6	2406375	2406380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6064	NC_012587	CTT	2	6	2407578	2407583	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6065	NC_012587	CTG	2	6	2408342	2408347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6066	NC_012587	T	6	6	2408409	2408414	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6067	NC_012587	CGCA	2	8	2408425	2408432	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6068	NC_012587	TGA	2	6	2408497	2408502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6069	NC_012587	TGC	2	6	2408505	2408510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6070	NC_012587	GC	3	6	2408509	2408514	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6071	NC_012587	GCC	2	6	2408570	2408575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6072	NC_012587	GAC	2	6	2411728	2411733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6073	NC_012587	CCT	2	6	2411765	2411770	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6074	NC_012587	GCA	2	6	2411793	2411798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6075	NC_012587	GAA	2	6	2411821	2411826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6076	NC_012587	GAAG	2	8	2411858	2411865	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6077	NC_012587	TCC	2	6	2412643	2412648	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6078	NC_012587	C	6	6	2412710	2412715	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6079	NC_012587	AAG	2	6	2412762	2412767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6080	NC_012587	TCC	2	6	2412801	2412806	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6081	NC_012587	GTG	2	6	2413065	2413070	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6082	NC_012587	CCCG	2	8	2413071	2413078	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6083	NC_012587	GGC	2	6	2413083	2413088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6084	NC_012587	GCA	2	6	2416270	2416275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6085	NC_012587	AAC	2	6	2416294	2416299	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6086	NC_012587	TGA	2	6	2418028	2418033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6087	NC_012587	GC	3	6	2418060	2418065	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6088	NC_012587	AAGCCG	2	12	2418081	2418092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6089	NC_012587	CTC	2	6	2418130	2418135	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6090	NC_012587	GCG	2	6	2420246	2420251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6091	NC_012587	GCTC	2	8	2420255	2420262	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6092	NC_012587	GGC	2	6	2421012	2421017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6093	NC_012587	CTT	2	6	2421044	2421049	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6094	NC_012587	GCG	2	6	2421301	2421306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6095	NC_012587	CGT	2	6	2421308	2421313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6097	NC_012587	GGC	3	9	2423987	2423995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6098	NC_012587	A	6	6	2424025	2424030	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6099	NC_012587	GTG	2	6	2424047	2424052	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6100	NC_012587	GCC	2	6	2431010	2431015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6101	NC_012587	ACC	2	6	2431098	2431103	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6102	NC_012587	CGGG	2	8	2431170	2431177	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6103	NC_012587	CTG	2	6	2431184	2431189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6104	NC_012587	GC	3	6	2431817	2431822	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6105	NC_012587	GCA	2	6	2431836	2431841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6106	NC_012587	CGT	2	6	2431846	2431851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6107	NC_012587	GCC	2	6	2431929	2431934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6108	NC_012587	CGGCG	2	10	2431976	2431985	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
6109	NC_012587	CG	3	6	2431988	2431993	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6110	NC_012587	CTAT	2	8	2431994	2432001	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6111	NC_012587	GAA	2	6	2432009	2432014	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6112	NC_012587	GC	3	6	2432024	2432029	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6113	NC_012587	T	6	6	2434551	2434556	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6114	NC_012587	CCG	2	6	2434563	2434568	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6115	NC_012587	AAT	2	6	2434569	2434574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6116	NC_012587	GCC	2	6	2434615	2434620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6117	NC_012587	GCC	2	6	2434650	2434655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6118	NC_012587	GC	3	6	2435246	2435251	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6119	NC_012587	CGGAA	2	10	2435278	2435287	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
6120	NC_012587	A	6	6	2435286	2435291	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6121	NC_012587	GAT	2	6	2435374	2435379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6122	NC_012587	CG	3	6	2436831	2436836	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6123	NC_012587	AAATG	2	10	2436870	2436879	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
6124	NC_012587	TCG	2	6	2438709	2438714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6126	NC_012587	CCG	2	6	2438814	2438819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6127	NC_012587	GCC	2	6	2438833	2438838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6128	NC_012587	GAA	3	9	2438880	2438888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6129	NC_012587	GGC	2	6	2439109	2439114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6130	NC_012587	CTC	2	6	2439799	2439804	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6131	NC_012587	TCA	2	6	2439964	2439969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6138	NC_012587	CAT	2	6	2442144	2442149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6172	NC_012587	CGAGG	2	10	2462222	2462231	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
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6257	NC_012587	GCT	2	6	2502049	2502054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6259	NC_012587	AAGC	2	8	2505768	2505775	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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