MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Streptococcus equi subsp. equi 4047

Total Repeats: 9877

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_012471	A	6	6	852922	852927	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4002	NC_012471	CCT	2	6	853028	853033	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4003	NC_012471	CG	3	6	853059	853064	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4004	NC_012471	T	7	7	853125	853131	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_012471	A	7	7	854047	854053	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_012471	TAA	2	6	854062	854067	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_012471	ATT	2	6	854069	854074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_012471	AGC	2	6	854262	854267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4009	NC_012471	ACA	2	6	854319	854324	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4010	NC_012471	TGA	2	6	854326	854331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4011	NC_012471	T	6	6	854364	854369	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4012	NC_012471	ATT	2	6	854443	854448	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_012471	GAAA	2	8	854490	854497	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4014	NC_012471	A	6	6	854495	854500	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4015	NC_012471	ATAACA	2	12	854513	854524	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4016	NC_012471	TTG	2	6	854560	854565	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4017	NC_012471	TTA	2	6	854608	854613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_012471	A	6	6	855651	855656	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_012471	TAT	2	6	856944	856949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4020	NC_012471	ACT	2	6	856971	856976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4021	NC_012471	AGG	2	6	858023	858028	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4022	NC_012471	A	6	6	860594	860599	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4023	NC_012471	ATTT	2	8	860619	860626	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4024	NC_012471	TG	4	8	860651	860658	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4025	NC_012471	CT	3	6	860685	860690	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4026	NC_012471	ATC	2	6	860773	860778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4027	NC_012471	ACA	2	6	860794	860799	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4028	NC_012471	T	6	6	860829	860834	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4029	NC_012471	A	6	6	860862	860867	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4030	NC_012471	GAG	2	6	862960	862965	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4031	NC_012471	T	6	6	862983	862988	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_012471	GCTT	2	8	863022	863029	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4033	NC_012471	AGT	2	6	863035	863040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4034	NC_012471	TTG	2	6	863089	863094	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4035	NC_012471	A	6	6	863104	863109	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4036	NC_012471	AAT	2	6	863117	863122	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4037	NC_012471	A	6	6	863142	863147	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4038	NC_012471	A	6	6	864579	864584	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4039	NC_012471	AGCT	2	8	864655	864662	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4040	NC_012471	AAG	2	6	864667	864672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_012471	A	6	6	864729	864734	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_012471	CAGC	2	8	864786	864793	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4043	NC_012471	GCT	2	6	864819	864824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4044	NC_012471	CTT	2	6	865010	865015	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4045	NC_012471	CTT	2	6	865017	865022	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4046	NC_012471	GCTT	2	8	865090	865097	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4047	NC_012471	TGA	2	6	865131	865136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4048	NC_012471	GGT	2	6	865142	865147	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4049	NC_012471	CTT	2	6	865166	865171	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4050	NC_012471	T	7	7	865170	865176	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4051	NC_012471	T	6	6	866493	866498	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4052	NC_012471	AT	3	6	869067	869072	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4053	NC_012471	ATA	2	6	869126	869131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4054	NC_012471	TAA	2	6	869132	869137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4055	NC_012471	GTT	2	6	869154	869159	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4056	NC_012471	ATA	2	6	869194	869199	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4057	NC_012471	CCT	2	6	871033	871038	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4058	NC_012471	CAGT	2	8	871068	871075	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4059	NC_012471	TAA	2	6	871129	871134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4060	NC_012471	A	16	16	871159	871174	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4061	NC_012471	GGA	2	6	871184	871189	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_012471	ATCA	2	8	871216	871223	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4063	NC_012471	ACTG	2	8	871258	871265	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4064	NC_012471	GAT	2	6	871742	871747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_012471	GAA	2	6	872322	872327	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4066	NC_012471	CT	3	6	872360	872365	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4067	NC_012471	TAT	2	6	872413	872418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4068	NC_012471	TAT	2	6	872452	872457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4069	NC_012471	TTTTAG	2	12	873833	873844	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4070	NC_012471	GAG	2	6	873886	873891	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4071	NC_012471	AGT	2	6	874110	874115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4072	NC_012471	ATG	2	6	874121	874126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4073	NC_012471	ATG	2	6	874152	874157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4074	NC_012471	AAT	2	6	874855	874860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4075	NC_012471	GAA	2	6	874909	874914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4076	NC_012471	TAT	2	6	874940	874945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4077	NC_012471	CTG	2	6	875165	875170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4078	NC_012471	T	6	6	875189	875194	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4079	NC_012471	GTT	2	6	875269	875274	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4080	NC_012471	TGAT	2	8	875289	875296	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4081	NC_012471	A	7	7	875311	875317	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4082	NC_012471	GCA	2	6	876139	876144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4083	NC_012471	ATG	2	6	876201	876206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4084	NC_012471	AGT	2	6	876217	876222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4085	NC_012471	ATT	2	6	876238	876243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4086	NC_012471	TGA	2	6	876270	876275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4087	NC_012471	TCT	2	6	876319	876324	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4088	NC_012471	T	6	6	876328	876333	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4089	NC_012471	CTTG	2	8	876368	876375	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4090	NC_012471	TGA	2	6	876396	876401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4091	NC_012471	T	7	7	876440	876446	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4092	NC_012471	A	7	7	876475	876481	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4093	NC_012471	ATTT	2	8	876489	876496	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4094	NC_012471	CAG	2	6	879357	879362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4095	NC_012471	CTG	2	6	879385	879390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4096	NC_012471	TA	3	6	879395	879400	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4097	NC_012471	GGT	2	6	879401	879406	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4098	NC_012471	AGCG	2	8	879410	879417	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4099	NC_012471	AG	3	6	879419	879424	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4100	NC_012471	A	7	7	879560	879566	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4101	NC_012471	GTT	2	6	879666	879671	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4102	NC_012471	A	6	6	879723	879728	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4103	NC_012471	TCG	2	6	879732	879737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4104	NC_012471	T	6	6	879761	879766	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4105	NC_012471	GTAA	2	8	879807	879814	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4106	NC_012471	CAC	2	6	879909	879914	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4107	NC_012471	GGC	2	6	880006	880011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4108	NC_012471	GCT	2	6	880096	880101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4109	NC_012471	TCT	2	6	880806	880811	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4110	NC_012471	TAA	2	6	882822	882827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4111	NC_012471	TGTT	2	8	886184	886191	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4112	NC_012471	AGA	2	6	886292	886297	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4113	NC_012471	GATGG	2	10	886301	886310	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
4114	NC_012471	AGGA	2	8	886542	886549	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_012471	GGT	2	6	886580	886585	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4116	NC_012471	TTG	2	6	886590	886595	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4117	NC_012471	A	6	6	886596	886601	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4118	NC_012471	A	6	6	886670	886675	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4119	NC_012471	ATGG	2	8	886690	886697	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_012471	A	6	6	886766	886771	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4121	NC_012471	AGA	2	6	886810	886815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_012471	TTG	2	6	886965	886970	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4123	NC_012471	TAA	2	6	886984	886989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4124	NC_012471	TGAT	2	8	887001	887008	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4125	NC_012471	ATG	2	6	887034	887039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4126	NC_012471	T	6	6	887174	887179	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4127	NC_012471	TTC	2	6	887309	887314	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4128	NC_012471	TGATG	2	10	887349	887358	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
4129	NC_012471	AGG	2	6	887369	887374	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4130	NC_012471	ATGA	2	8	887452	887459	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4131	NC_012471	TTA	2	6	887487	887492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4132	NC_012471	GTT	2	6	887578	887583	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4133	NC_012471	A	7	7	887590	887596	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4134	NC_012471	G	6	6	887615	887620	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4135	NC_012471	CAAT	2	8	887628	887635	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4136	NC_012471	AAG	2	6	887683	887688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4137	NC_012471	TGGAA	2	10	887723	887732	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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4272	NC_012471	TGA	2	6	927752	927757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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