MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Streptococcus equi subsp. equi 4047

Total Repeats: 9877

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_012471	GAG	2	6	646178	646183	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3002	NC_012471	A	6	6	646291	646296	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3003	NC_012471	GTG	2	6	646306	646311	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3004	NC_012471	C	6	6	647693	647698	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3005	NC_012471	G	6	6	647726	647731	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3006	NC_012471	TCA	2	6	647757	647762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3007	NC_012471	A	6	6	647771	647776	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3008	NC_012471	TCG	2	6	647797	647802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3009	NC_012471	CAGT	2	8	647824	647831	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3010	NC_012471	TGA	2	6	648025	648030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3011	NC_012471	GTC	2	6	648105	648110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3012	NC_012471	CCT	2	6	648184	648189	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3013	NC_012471	AGAT	2	8	648198	648205	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3014	NC_012471	ACT	2	6	648273	648278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3015	NC_012471	ACA	2	6	648392	648397	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3016	NC_012471	AAAT	2	8	648401	648408	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3017	NC_012471	TATAA	2	10	648510	648519	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3018	NC_012471	A	6	6	649957	649962	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3019	NC_012471	ATTAAG	2	12	649986	649997	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3020	NC_012471	A	6	6	650006	650011	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3021	NC_012471	TAA	2	6	650754	650759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3022	NC_012471	GCT	2	6	650764	650769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3023	NC_012471	AGC	2	6	650772	650777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3024	NC_012471	TATCA	2	10	650784	650793	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
3025	NC_012471	A	6	6	650885	650890	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3026	NC_012471	CTG	2	6	652479	652484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3027	NC_012471	AGGC	2	8	652493	652500	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3028	NC_012471	CGA	2	6	652627	652632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3029	NC_012471	ATTA	2	8	652757	652764	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3030	NC_012471	GTT	2	6	652780	652785	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3031	NC_012471	AG	3	6	654477	654482	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3032	NC_012471	TGA	2	6	654484	654489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3033	NC_012471	CT	3	6	654497	654502	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3034	NC_012471	AGG	2	6	654581	654586	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3035	NC_012471	C	6	6	657986	657991	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3036	NC_012471	G	6	6	658019	658024	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3037	NC_012471	GTTTT	2	10	658047	658056	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
3038	NC_012471	GCT	2	6	658057	658062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3039	NC_012471	T	6	6	658062	658067	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3040	NC_012471	GGTCTT	2	12	658068	658079	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
3041	NC_012471	TAG	2	6	658080	658085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3042	NC_012471	GTCT	2	8	658118	658125	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3043	NC_012471	TGT	2	6	658130	658135	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3044	NC_012471	GTG	2	6	658150	658155	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3045	NC_012471	AGG	2	6	658170	658175	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3046	NC_012471	A	6	6	658472	658477	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3047	NC_012471	AGA	2	6	658489	658494	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3048	NC_012471	ATT	2	6	659271	659276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3049	NC_012471	AAT	2	6	659285	659290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3050	NC_012471	GC	3	6	660152	660157	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3051	NC_012471	CTACT	2	10	660177	660186	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
3052	NC_012471	AGGT	2	8	660302	660309	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3053	NC_012471	TGTAG	2	10	660316	660325	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
3054	NC_012471	TGA	2	6	660341	660346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3055	NC_012471	T	7	7	660376	660382	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3056	NC_012471	AAT	2	6	660423	660428	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3057	NC_012471	AT	3	6	660427	660432	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3058	NC_012471	ATT	2	6	661009	661014	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3059	NC_012471	AGA	2	6	661050	661055	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3060	NC_012471	AT	3	6	663366	663371	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3061	NC_012471	TAA	2	6	663452	663457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3062	NC_012471	ATCA	2	8	664526	664533	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3063	NC_012471	T	6	6	664553	664558	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3064	NC_012471	T	6	6	665241	665246	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3065	NC_012471	TAA	2	6	665255	665260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3066	NC_012471	ACT	2	6	665261	665266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3067	NC_012471	TGG	2	6	665272	665277	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3068	NC_012471	TC	3	6	665383	665388	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3069	NC_012471	AG	3	6	665406	665411	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3070	NC_012471	T	6	6	665424	665429	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3071	NC_012471	CTT	2	6	667725	667730	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3072	NC_012471	TAT	2	6	667780	667785	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3073	NC_012471	GAT	2	6	667835	667840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3074	NC_012471	TTA	2	6	667858	667863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3075	NC_012471	CTT	2	6	667871	667876	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3076	NC_012471	GAC	2	6	667881	667886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3077	NC_012471	AAT	2	6	667912	667917	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3078	NC_012471	TA	3	6	667921	667926	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3079	NC_012471	ATA	2	6	667931	667936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3080	NC_012471	A	6	6	668775	668780	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3081	NC_012471	TTA	2	6	668790	668795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3082	NC_012471	T	6	6	668815	668820	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3083	NC_012471	TGAC	2	8	669590	669597	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3084	NC_012471	AT	3	6	669621	669626	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3085	NC_012471	AG	3	6	669632	669637	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3086	NC_012471	AAC	2	6	669644	669649	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3087	NC_012471	GCAA	2	8	669725	669732	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3088	NC_012471	GCT	2	6	669757	669762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3089	NC_012471	A	6	6	669772	669777	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3090	NC_012471	GAA	2	6	669779	669784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3091	NC_012471	CTGA	2	8	669832	669839	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3092	NC_012471	CAG	2	6	669905	669910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3093	NC_012471	CCTG	2	8	669924	669931	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3094	NC_012471	TAA	2	6	669960	669965	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3095	NC_012471	GAA	2	6	670070	670075	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3096	NC_012471	ACC	2	6	670172	670177	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3097	NC_012471	C	6	6	670202	670207	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3098	NC_012471	G	6	6	670235	670240	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3099	NC_012471	AT	3	6	671623	671628	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3100	NC_012471	ATTT	2	8	671640	671647	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3101	NC_012471	GAT	3	9	671684	671692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3102	NC_012471	TTG	2	6	671693	671698	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3103	NC_012471	AAG	2	6	671823	671828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3104	NC_012471	TTA	2	6	671875	671880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3105	NC_012471	TTGC	2	8	671898	671905	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3106	NC_012471	AGC	2	6	671977	671982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3107	NC_012471	T	6	6	672003	672008	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3108	NC_012471	AGG	2	6	672049	672054	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3109	NC_012471	AGC	2	6	673903	673908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3110	NC_012471	GTA	2	6	673958	673963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3111	NC_012471	ATG	2	6	674003	674008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3112	NC_012471	ATA	2	6	674041	674046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3113	NC_012471	CTGA	2	8	675257	675264	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3114	NC_012471	AGG	2	6	675278	675283	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3115	NC_012471	T	7	7	675990	675996	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3116	NC_012471	ATATA	2	10	676739	676748	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3117	NC_012471	A	6	6	677803	677808	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3118	NC_012471	TGC	2	6	677899	677904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3119	NC_012471	GGT	2	6	677960	677965	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3120	NC_012471	TTGTT	2	10	677996	678005	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
3121	NC_012471	A	6	6	678031	678036	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3122	NC_012471	TC	3	6	678109	678114	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3123	NC_012471	TCA	2	6	680822	680827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3124	NC_012471	CA	3	6	680826	680831	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3125	NC_012471	A	7	7	680831	680837	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3126	NC_012471	TCC	2	6	682050	682055	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3127	NC_012471	TTTA	2	8	682056	682063	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3128	NC_012471	TAAA	2	8	682093	682100	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3129	NC_012471	AT	3	6	682137	682142	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3130	NC_012471	AAT	2	6	682246	682251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3131	NC_012471	T	6	6	682359	682364	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3132	NC_012471	A	6	6	682382	682387	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3133	NC_012471	T	7	7	682404	682410	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3134	NC_012471	ATTT	2	8	682411	682418	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3135	NC_012471	GGA	2	6	682453	682458	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3136	NC_012471	CTA	2	6	683843	683848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3138	NC_012471	GTG	2	6	683863	683868	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3265	NC_012471	TCT	2	6	713205	713210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3267	NC_012471	TTA	2	6	713284	713289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3270	NC_012471	TTTGC	2	10	717115	717124	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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