MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Streptococcus equi subsp. equi 4047

Total Repeats: 9877

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2502	NC_012471	AGG	2	6	525682	525687	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2503	NC_012471	GTA	2	6	526016	526021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2504	NC_012471	TAT	2	6	526055	526060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2505	NC_012471	TTA	2	6	526061	526066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2506	NC_012471	AT	3	6	526067	526072	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2507	NC_012471	AAT	2	6	530814	530819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2508	NC_012471	GTT	2	6	531748	531753	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2509	NC_012471	TGT	2	6	534072	534077	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2510	NC_012471	TC	3	6	535368	535373	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2511	NC_012471	TCT	2	6	535407	535412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2512	NC_012471	T	14	14	535483	535496	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2513	NC_012471	ATT	2	6	535520	535525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2514	NC_012471	T	6	6	535623	535628	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2515	NC_012471	TTTG	2	8	535633	535640	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
2516	NC_012471	ATT	2	6	535677	535682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2517	NC_012471	AAG	2	6	535703	535708	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2518	NC_012471	AAG	2	6	535717	535722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2519	NC_012471	AG	4	8	535721	535728	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2520	NC_012471	GTTT	2	8	535768	535775	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
2521	NC_012471	GTT	2	6	535827	535832	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2522	NC_012471	TTG	2	6	536065	536070	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2523	NC_012471	T	6	6	536327	536332	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2524	NC_012471	T	6	6	536338	536343	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2525	NC_012471	GTA	2	6	536346	536351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2526	NC_012471	ATA	2	6	536410	536415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2527	NC_012471	TCT	2	6	536432	536437	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2528	NC_012471	ACT	2	6	536486	536491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2530	NC_012471	CAG	2	6	536574	536579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2532	NC_012471	AGT	2	6	536727	536732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2534	NC_012471	TAT	2	6	536850	536855	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2535	NC_012471	T	6	6	536895	536900	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2536	NC_012471	CATA	2	8	536910	536917	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2537	NC_012471	ATGA	2	8	537071	537078	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2538	NC_012471	GTG	2	6	537079	537084	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2539	NC_012471	TGT	2	6	537093	537098	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2540	NC_012471	A	6	6	538218	538223	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2541	NC_012471	GCAAA	2	10	538247	538256	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
2542	NC_012471	AAAG	2	8	538262	538269	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2543	NC_012471	CTTA	2	8	538277	538284	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2544	NC_012471	A	6	6	538304	538309	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2545	NC_012471	AAT	2	6	538312	538317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2546	NC_012471	TGA	2	6	538422	538427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2547	NC_012471	TAG	3	9	538438	538446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2548	NC_012471	TG	3	6	538470	538475	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2549	NC_012471	GCT	2	6	538590	538595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2550	NC_012471	ATT	2	6	538596	538601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2551	NC_012471	CCT	2	6	538604	538609	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2552	NC_012471	TAT	2	6	539301	539306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2553	NC_012471	ATG	2	6	539347	539352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2554	NC_012471	TGAGA	2	10	539373	539382	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
2555	NC_012471	TAGCA	2	10	539443	539452	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
2556	NC_012471	TCA	2	6	539453	539458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2557	NC_012471	TGA	2	6	540157	540162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2558	NC_012471	AGA	2	6	540260	540265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2559	NC_012471	TGT	2	6	540305	540310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2560	NC_012471	G	6	6	540334	540339	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2561	NC_012471	GCA	2	6	540381	540386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2562	NC_012471	T	6	6	540405	540410	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2563	NC_012471	TGT	2	6	540419	540424	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2564	NC_012471	CTT	2	6	540440	540445	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2565	NC_012471	TAA	2	6	540469	540474	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2566	NC_012471	A	7	7	541373	541379	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2567	NC_012471	T	9	9	541399	541407	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2568	NC_012471	TTC	2	6	542272	542277	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2569	NC_012471	A	7	7	542313	542319	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2570	NC_012471	TGA	2	6	542432	542437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2571	NC_012471	A	6	6	542479	542484	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2572	NC_012471	A	6	6	542527	542532	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2573	NC_012471	ATT	2	6	542551	542556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2574	NC_012471	T	6	6	542594	542599	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2575	NC_012471	AGG	2	6	542609	542614	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2578	NC_012471	TGGC	2	8	549399	549406	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2579	NC_012471	GAG	2	6	549494	549499	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2580	NC_012471	GCT	2	6	549502	549507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2582	NC_012471	GCTC	2	8	549542	549549	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2583	NC_012471	GAA	2	6	549557	549562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2585	NC_012471	TAA	2	6	549651	549656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2587	NC_012471	TAAT	2	8	549678	549685	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2588	NC_012471	TTATC	2	10	549697	549706	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
2589	NC_012471	A	6	6	549710	549715	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2590	NC_012471	TAA	2	6	549843	549848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2591	NC_012471	A	7	7	549920	549926	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2592	NC_012471	ACT	2	6	550071	550076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2598	NC_012471	AGCA	2	8	550299	550306	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2599	NC_012471	CTT	2	6	550329	550334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2600	NC_012471	TGGT	2	8	550381	550388	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2601	NC_012471	ATG	2	6	550401	550406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2602	NC_012471	AAACT	2	10	550410	550419	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
2603	NC_012471	TAC	2	6	550585	550590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2605	NC_012471	AAG	2	6	550784	550789	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2606	NC_012471	GAAGA	2	10	550790	550799	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
2607	NC_012471	AAG	2	6	550815	550820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2608	NC_012471	AAG	2	6	550823	550828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2609	NC_012471	TTC	2	6	550859	550864	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2610	NC_012471	GTT	2	6	550904	550909	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2612	NC_012471	TGT	2	6	550937	550942	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2613	NC_012471	GTT	2	6	550991	550996	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2614	NC_012471	AAG	2	6	551010	551015	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2615	NC_012471	TCA	2	6	551016	551021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2616	NC_012471	TGG	2	6	551026	551031	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2617	NC_012471	T	7	7	551040	551046	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2618	NC_012471	CTG	2	6	551058	551063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2619	NC_012471	AGCTT	2	10	551240	551249	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
2620	NC_012471	TCC	2	6	551251	551256	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2621	NC_012471	TAA	2	6	551257	551262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2622	NC_012471	AAGG	2	8	551309	551316	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2623	NC_012471	CTA	2	6	552024	552029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2626	NC_012471	TTGT	2	8	552065	552072	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
2627	NC_012471	TAT	2	6	552080	552085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2628	NC_012471	T	7	7	552119	552125	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2629	NC_012471	GATT	2	8	554285	554292	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2630	NC_012471	CTT	2	6	554343	554348	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2631	NC_012471	AAGA	2	8	554373	554380	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2632	NC_012471	AGC	2	6	554392	554397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2633	NC_012471	CAG	2	6	554412	554417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2634	NC_012471	CAT	2	6	554442	554447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2636	NC_012471	TGC	2	6	554578	554583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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