MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Streptococcus equi subsp. equi 4047

Total Repeats: 9877

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_012471	A	6	6	324086	324091	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_012471	A	6	6	324100	324105	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_012471	ACA	2	6	326236	326241	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1504	NC_012471	GCA	2	6	326252	326257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1505	NC_012471	AAC	2	6	326336	326341	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1506	NC_012471	T	6	6	326434	326439	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_012471	TA	3	6	326450	326455	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_012471	GTT	2	6	326472	326477	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_012471	TAGG	2	8	326508	326515	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_012471	TAA	3	9	326528	326536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_012471	T	6	6	327609	327614	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_012471	T	7	7	327698	327704	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_012471	AG	3	6	327733	327738	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_012471	CTT	2	6	327754	327759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1515	NC_012471	CTT	2	6	327784	327789	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1516	NC_012471	T	6	6	327901	327906	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_012471	T	6	6	327957	327962	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_012471	T	6	6	327982	327987	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_012471	ATG	2	6	328053	328058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_012471	TAA	2	6	328060	328065	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_012471	ATAA	2	8	328078	328085	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_012471	TAA	2	6	328093	328098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_012471	AGG	2	6	328112	328117	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_012471	TGT	2	6	329008	329013	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_012471	CCTG	2	8	329019	329026	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1526	NC_012471	A	6	6	329163	329168	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_012471	GCT	2	6	330415	330420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1528	NC_012471	CTG	2	6	330534	330539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1529	NC_012471	CTA	2	6	330567	330572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1530	NC_012471	AATG	2	8	330573	330580	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_012471	AACAT	2	10	331336	331345	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
1532	NC_012471	TTA	2	6	331360	331365	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_012471	GAAA	2	8	331789	331796	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_012471	GATT	2	8	331802	331809	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_012471	ACTC	2	8	333167	333174	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1536	NC_012471	TGAG	2	8	333182	333189	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_012471	T	6	6	333190	333195	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_012471	CAG	2	6	333207	333212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1539	NC_012471	TTAT	2	8	333219	333226	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_012471	AAAAT	2	10	333284	333293	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_012471	T	6	6	333321	333326	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_012471	TAATT	2	10	333345	333354	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_012471	AGG	2	6	333376	333381	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_012471	AAT	2	6	335050	335055	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_012471	ATT	2	6	335056	335061	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_012471	GCTA	2	8	335127	335134	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1547	NC_012471	T	6	6	339210	339215	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_012471	TGG	2	6	339277	339282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_012471	TGG	2	6	339285	339290	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_012471	TAAAA	2	10	339372	339381	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_012471	AAC	2	6	339390	339395	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1552	NC_012471	AATG	2	8	339447	339454	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_012471	TGCT	2	8	339512	339519	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1554	NC_012471	AATC	2	8	339546	339553	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1555	NC_012471	CT	3	6	339576	339581	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1556	NC_012471	CAG	2	6	339615	339620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1557	NC_012471	TAG	2	6	339629	339634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_012471	AGCT	2	8	339657	339664	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1559	NC_012471	AGT	2	6	339710	339715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_012471	GTCA	2	8	339735	339742	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1561	NC_012471	TTGACG	2	12	339743	339754	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
1562	NC_012471	CAA	2	6	339755	339760	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1563	NC_012471	A	7	7	339759	339765	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_012471	TGA	2	6	341709	341714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_012471	ATG	2	6	341727	341732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_012471	ATT	2	6	341805	341810	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_012471	ATT	2	6	341892	341897	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_012471	TGA	2	6	341909	341914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_012471	GGCTGT	2	12	341915	341926	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
1570	NC_012471	TTTAT	2	10	341943	341952	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_012471	GAG	2	6	344136	344141	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_012471	TATT	2	8	344154	344161	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_012471	A	6	6	345187	345192	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_012471	TC	3	6	345228	345233	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1575	NC_012471	GAT	2	6	345250	345255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1577	NC_012471	TTG	2	6	345313	345318	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1578	NC_012471	TG	3	6	345317	345322	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1579	NC_012471	TTTGC	2	10	345381	345390	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
1580	NC_012471	GGCT	2	8	345414	345421	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1581	NC_012471	TGA	2	6	345458	345463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_012471	A	7	7	345483	345489	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1583	NC_012471	CTT	2	6	345850	345855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1584	NC_012471	TAA	2	6	345862	345867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_012471	TAT	2	6	345935	345940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1586	NC_012471	TCAA	2	8	345950	345957	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1587	NC_012471	T	6	6	347889	347894	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1588	NC_012471	GAG	2	6	347895	347900	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1589	NC_012471	AGA	2	6	347901	347906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1590	NC_012471	GAAAAA	2	12	348514	348525	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1591	NC_012471	GCTT	2	8	348541	348548	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1592	NC_012471	AGG	2	6	348584	348589	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1593	NC_012471	TAT	2	6	349695	349700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1595	NC_012471	TGA	2	6	349856	349861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1596	NC_012471	TG	3	6	349865	349870	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1597	NC_012471	GTT	2	6	349885	349890	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1598	NC_012471	GGT	2	6	349894	349899	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_012471	A	6	6	349918	349923	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1600	NC_012471	TAA	3	9	349944	349952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1601	NC_012471	AATT	2	8	349959	349966	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_012471	CATAA	2	10	350013	350022	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
1603	NC_012471	AAAG	2	8	350031	350038	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_012471	ACA	2	6	350053	350058	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1605	NC_012471	GAT	2	6	350655	350660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_012471	CGA	2	6	350674	350679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1607	NC_012471	TGAT	2	8	350686	350693	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_012471	ATT	2	6	350711	350716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_012471	GA	3	6	350746	350751	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_012471	T	6	6	350764	350769	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_012471	AGG	2	6	350775	350780	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_012471	ATT	2	6	350799	350804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_012471	GAT	2	6	350809	350814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_012471	ATT	2	6	350824	350829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1615	NC_012471	AACG	2	8	350836	350843	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1616	NC_012471	CAGG	2	8	350854	350861	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1617	NC_012471	ATG	2	6	350947	350952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_012471	ATGG	2	8	350959	350966	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_012471	GAT	2	6	351076	351081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1620	NC_012471	ATCTGA	2	12	351236	351247	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1621	NC_012471	CAA	2	6	351249	351254	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1622	NC_012471	TGT	2	6	351266	351271	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_012471	C	6	6	351338	351343	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1624	NC_012471	G	6	6	351371	351376	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1625	NC_012471	CAGTA	2	10	352753	352762	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1626	NC_012471	GAG	3	9	352766	352774	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_012471	GAT	2	6	352781	352786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1628	NC_012471	CATT	2	8	352807	352814	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1629	NC_012471	ACCA	2	8	352855	352862	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1630	NC_012471	AGCA	2	8	354017	354024	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1631	NC_012471	CAG	2	6	354026	354031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1632	NC_012471	T	6	6	354047	354052	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1633	NC_012471	ACG	2	6	354077	354082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1634	NC_012471	AAAG	2	8	354138	354145	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1635	NC_012471	TGCT	2	8	354152	354159	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1636	NC_012471	CT	3	6	354158	354163	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1637	NC_012471	TAT	2	6	354166	354171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1638	NC_012471	A	7	7	354179	354185	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1910	NC_012471	ACC	2	6	402203	402208	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1911	NC_012471	GCAAGT	2	12	402292	402303	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
1912	NC_012471	TGA	2	6	402319	402324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1913	NC_012471	AGT	2	6	402350	402355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1918	NC_012471	AGC	2	6	402713	402718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1923	NC_012471	TCG	2	6	402902	402907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1932	NC_012471	TTG	2	6	403963	403968	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1944	NC_012471	AAG	2	6	406793	406798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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