MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Streptococcus equi subsp. equi 4047

Total Repeats: 9877

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_012471	CGG	2	6	91676	91681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
502	NC_012471	GA	3	6	91774	91779	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
503	NC_012471	TAGG	2	8	91892	91899	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
504	NC_012471	TAC	2	6	91946	91951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
505	NC_012471	CCT	2	6	92034	92039	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
506	NC_012471	TTGG	2	8	92075	92082	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
507	NC_012471	AATC	2	8	92084	92091	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
508	NC_012471	GGT	2	6	92170	92175	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
509	NC_012471	TCG	2	6	92285	92290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
510	NC_012471	CGT	2	6	92365	92370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
511	NC_012471	AGGGA	2	10	92503	92512	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
512	NC_012471	CTC	2	6	92543	92548	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
513	NC_012471	GA	3	6	92589	92594	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
514	NC_012471	GTG	2	6	92625	92630	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
515	NC_012471	ACTAAT	2	12	92644	92655	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
516	NC_012471	TAAGT	2	10	92755	92764	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
517	NC_012471	AGT	2	6	92806	92811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
518	NC_012471	AGT	2	6	92831	92836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
519	NC_012471	GCTTA	2	10	92868	92877	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
520	NC_012471	TGT	2	6	93006	93011	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
521	NC_012471	GGT	2	6	93081	93086	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
522	NC_012471	GGT	2	6	93116	93121	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
523	NC_012471	ATG	2	6	93148	93153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
524	NC_012471	CGG	2	6	93190	93195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
525	NC_012471	GGA	2	6	93235	93240	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
526	NC_012471	GCGT	2	8	93294	93301	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
527	NC_012471	TCC	2	6	93318	93323	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
528	NC_012471	TCG	2	6	93360	93365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
529	NC_012471	TA	3	6	93411	93416	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_012471	AT	3	6	93421	93426	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_012471	CGG	2	6	93481	93486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
532	NC_012471	CGG	2	6	93551	93556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
533	NC_012471	TTCGGG	2	12	93573	93584	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
534	NC_012471	CT	3	6	93596	93601	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
535	NC_012471	GTG	2	6	93701	93706	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
536	NC_012471	AGTTT	2	10	93846	93855	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
537	NC_012471	GCC	2	6	93940	93945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
538	NC_012471	A	6	6	93966	93971	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
539	NC_012471	T	7	7	93990	93996	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_012471	CT	3	6	94032	94037	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
541	NC_012471	TG	3	6	94168	94173	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
542	NC_012471	TAT	2	6	95460	95465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_012471	GAT	2	6	95473	95478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
544	NC_012471	A	6	6	95479	95484	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_012471	AAG	2	6	95670	95675	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
546	NC_012471	TGA	2	6	95786	95791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
547	NC_012471	A	13	13	95858	95870	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_012471	GA	3	6	95881	95886	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
549	NC_012471	TAA	2	6	95890	95895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_012471	TCT	2	6	95931	95936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
551	NC_012471	A	7	7	95953	95959	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_012471	GA	3	6	95979	95984	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
553	NC_012471	CTA	2	6	97203	97208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
554	NC_012471	GATT	2	8	97233	97240	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
555	NC_012471	AG	3	6	97265	97270	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
556	NC_012471	GCA	2	6	97296	97301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
557	NC_012471	T	6	6	97370	97375	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_012471	ATG	2	6	97385	97390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
559	NC_012471	TG	3	6	97403	97408	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
560	NC_012471	GTG	2	6	97468	97473	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
561	NC_012471	A	6	6	97552	97557	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_012471	TTG	2	6	97578	97583	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
563	NC_012471	GTT	2	6	97599	97604	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
564	NC_012471	AGG	2	6	97660	97665	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
565	NC_012471	CTG	3	9	98203	98211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
566	NC_012471	TGCT	2	8	98221	98228	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
567	NC_012471	TAG	2	6	98233	98238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
568	NC_012471	T	6	6	98245	98250	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_012471	GCT	2	6	98252	98257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
570	NC_012471	TAG	2	6	98278	98283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
571	NC_012471	CAT	2	6	98326	98331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
572	NC_012471	TATT	2	8	98345	98352	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_012471	GAG	2	6	99320	99325	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
574	NC_012471	CTGT	2	8	101327	101334	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
575	NC_012471	ATA	2	6	105023	105028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
576	NC_012471	GTC	2	6	105042	105047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
577	NC_012471	AGAA	2	8	105074	105081	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
578	NC_012471	CAG	2	6	105082	105087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
579	NC_012471	GCT	2	6	105116	105121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
580	NC_012471	AAAAAG	2	12	105237	105248	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
581	NC_012471	GACTA	2	10	108854	108863	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
582	NC_012471	GCT	2	6	108879	108884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
583	NC_012471	TCA	2	6	108891	108896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
584	NC_012471	TAG	2	6	112627	112632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
585	NC_012471	GAG	2	6	112654	112659	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
586	NC_012471	GTC	2	6	112666	112671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
587	NC_012471	AGCA	2	8	112692	112699	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
588	NC_012471	TGTA	2	8	112838	112845	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
589	NC_012471	ATT	2	6	112908	112913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
590	NC_012471	TTA	2	6	112914	112919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
591	NC_012471	A	7	7	112921	112927	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_012471	AATTT	2	10	112936	112945	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_012471	T	7	7	112955	112961	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_012471	AT	3	6	112988	112993	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_012471	GGT	2	6	113020	113025	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
596	NC_012471	TAG	2	6	113053	113058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
597	NC_012471	TTGT	2	8	113084	113091	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
598	NC_012471	AATT	2	8	113709	113716	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
599	NC_012471	ATT	2	6	113721	113726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
600	NC_012471	TTG	2	6	113732	113737	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
601	NC_012471	ATT	2	6	113742	113747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NC_012471	ATA	2	6	113753	113758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_012471	T	6	6	113762	113767	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_012471	T	7	7	113774	113780	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
605	NC_012471	T	7	7	113810	113816	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
606	NC_012471	CAGG	2	8	113832	113839	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
607	NC_012471	ATTA	2	8	113873	113880	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_012471	ATT	2	6	113902	113907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_012471	GAAA	2	8	113969	113976	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
610	NC_012471	GTGG	2	8	114022	114029	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
611	NC_012471	GAG	2	6	114047	114052	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
612	NC_012471	GA	3	6	114172	114177	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
613	NC_012471	T	6	6	115295	115300	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_012471	TCTT	2	8	115308	115315	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
615	NC_012471	TAT	2	6	115739	115744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
616	NC_012471	AG	3	6	115773	115778	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
617	NC_012471	TGT	2	6	115797	115802	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
618	NC_012471	ACA	2	6	115848	115853	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
619	NC_012471	T	7	7	115902	115908	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
620	NC_012471	TAC	2	6	116120	116125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
621	NC_012471	GT	4	8	116194	116201	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
622	NC_012471	TTA	2	6	116202	116207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_012471	GA	3	6	116214	116219	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
624	NC_012471	TAAGG	2	10	116232	116241	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
625	NC_012471	TCA	2	6	118943	118948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
626	NC_012471	A	6	6	119018	119023	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NC_012471	T	8	8	119044	119051	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
628	NC_012471	GAG	2	6	119072	119077	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
629	NC_012471	C	6	6	122743	122748	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
630	NC_012471	G	6	6	122776	122781	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
631	NC_012471	TAT	3	9	123362	123370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
632	NC_012471	AAG	2	6	123390	123395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
633	NC_012471	ATG	2	6	123435	123440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
634	NC_012471	CAT	2	6	123443	123448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
635	NC_012471	TCG	2	6	123463	123468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
636	NC_012471	A	6	6	123512	123517	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
637	NC_012471	TGA	2	6	123528	123533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
638	NC_012471	CGT	2	6	123560	123565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
639	NC_012471	TTC	2	6	123577	123582	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
640	NC_012471	TACCT	2	10	123682	123691	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
641	NC_012471	CTAT	2	8	123703	123710	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
642	NC_012471	ATT	2	6	123740	123745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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