MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Streptococcus equi subsp. equi 4047

Total Repeats: 9877

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_012471	T	6	6	1110862	1110867	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5002	NC_012471	TAA	2	6	1110919	1110924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5003	NC_012471	A	7	7	1110946	1110952	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5004	NC_012471	GGA	2	6	1110953	1110958	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5005	NC_012471	TAG	2	6	1113135	1113140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_012471	TTG	2	6	1113146	1113151	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5007	NC_012471	A	6	6	1113191	1113196	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5008	NC_012471	T	6	6	1113227	1113232	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5009	NC_012471	GT	3	6	1113266	1113271	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5010	NC_012471	ATA	2	6	1116861	1116866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5011	NC_012471	T	6	6	1116884	1116889	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5012	NC_012471	GAA	2	6	1116911	1116916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5013	NC_012471	AGA	3	9	1116917	1116925	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5014	NC_012471	A	6	6	1117829	1117834	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5015	NC_012471	GGA	2	6	1117845	1117850	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5016	NC_012471	CTT	2	6	1121668	1121673	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5017	NC_012471	T	6	6	1121679	1121684	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5018	NC_012471	TGGTC	2	10	1121689	1121698	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
5019	NC_012471	AAT	2	6	1121701	1121706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5020	NC_012471	TAG	2	6	1121755	1121760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5021	NC_012471	TTA	2	6	1121765	1121770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5022	NC_012471	CAG	2	6	1123343	1123348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5023	NC_012471	AAG	2	6	1123367	1123372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5024	NC_012471	TGA	2	6	1123395	1123400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5025	NC_012471	T	7	7	1123416	1123422	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5026	NC_012471	TTA	2	6	1123426	1123431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5027	NC_012471	TGA	2	6	1123472	1123477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5028	NC_012471	CTG	2	6	1123482	1123487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5029	NC_012471	ATCA	2	8	1123508	1123515	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5030	NC_012471	GCT	2	6	1124158	1124163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5031	NC_012471	A	6	6	1124182	1124187	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5032	NC_012471	TGA	2	6	1124195	1124200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5033	NC_012471	ATC	2	6	1124201	1124206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5034	NC_012471	AAG	2	6	1124245	1124250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5035	NC_012471	AGG	2	6	1124400	1124405	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5036	NC_012471	ATA	2	6	1124426	1124431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5037	NC_012471	A	6	6	1125723	1125728	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5038	NC_012471	TTAT	2	8	1125735	1125742	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5039	NC_012471	TAA	2	6	1125762	1125767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5040	NC_012471	TATC	2	8	1127832	1127839	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5041	NC_012471	AGAT	2	8	1127851	1127858	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_012471	A	6	6	1127962	1127967	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5043	NC_012471	CTTGT	2	10	1128014	1128023	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
5044	NC_012471	AGA	2	6	1128067	1128072	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5045	NC_012471	TG	3	6	1128078	1128083	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5046	NC_012471	TTACA	2	10	1130542	1130551	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
5047	NC_012471	A	7	7	1130614	1130620	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5048	NC_012471	TAA	2	6	1131266	1131271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5049	NC_012471	GA	3	6	1131318	1131323	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5050	NC_012471	TAG	2	6	1134750	1134755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5051	NC_012471	T	6	6	1134790	1134795	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5052	NC_012471	AGGA	2	8	1134805	1134812	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5053	NC_012471	TAA	2	6	1136437	1136442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5054	NC_012471	A	6	6	1136457	1136462	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5055	NC_012471	TAA	2	6	1136505	1136510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5056	NC_012471	ATA	2	6	1136524	1136529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5057	NC_012471	GCT	2	6	1136545	1136550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5058	NC_012471	TTC	2	6	1136569	1136574	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5059	NC_012471	TAA	2	6	1136629	1136634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5060	NC_012471	TGC	2	6	1136664	1136669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5061	NC_012471	T	6	6	1136702	1136707	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5062	NC_012471	GGTC	2	8	1136713	1136720	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5063	NC_012471	TTC	2	6	1136856	1136861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5064	NC_012471	TAT	2	6	1136908	1136913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5065	NC_012471	GAA	2	6	1136923	1136928	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5067	NC_012471	CAT	2	6	1137064	1137069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5068	NC_012471	TGA	2	6	1137205	1137210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5069	NC_012471	TGA	2	6	1137352	1137357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5070	NC_012471	TCT	2	6	1137416	1137421	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5071	NC_012471	GCTG	2	8	1137428	1137435	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5072	NC_012471	ATC	2	6	1137495	1137500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5073	NC_012471	TTCC	2	8	1137529	1137536	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5074	NC_012471	TTG	2	6	1137543	1137548	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5075	NC_012471	TTAT	2	8	1137604	1137611	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5076	NC_012471	TTA	2	6	1137748	1137753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5077	NC_012471	CAG	2	6	1137772	1137777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5078	NC_012471	TGA	2	6	1137778	1137783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5079	NC_012471	CTT	2	6	1137805	1137810	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5080	NC_012471	GGC	2	6	1137822	1137827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5081	NC_012471	TAA	2	6	1137860	1137865	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5082	NC_012471	TGATTG	2	12	1137874	1137885	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5083	NC_012471	GTC	2	6	1137893	1137898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5084	NC_012471	CTTG	2	8	1137902	1137909	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5085	NC_012471	TGC	2	6	1137977	1137982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5086	NC_012471	TTA	2	6	1137987	1137992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5087	NC_012471	TTGAA	2	10	1138141	1138150	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
5088	NC_012471	GATATT	2	12	1138200	1138211	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5089	NC_012471	GCT	2	6	1138296	1138301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5090	NC_012471	AGG	2	6	1138303	1138308	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5091	NC_012471	A	6	6	1138384	1138389	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5092	NC_012471	GAA	2	6	1138427	1138432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5093	NC_012471	AG	3	6	1138479	1138484	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5094	NC_012471	TCAG	2	8	1138568	1138575	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5095	NC_012471	AGC	2	6	1138654	1138659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5096	NC_012471	TGA	2	6	1138687	1138692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5097	NC_012471	GCAA	2	8	1138772	1138779	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5098	NC_012471	AGC	2	6	1138808	1138813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5099	NC_012471	TTTA	2	8	1138906	1138913	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5100	NC_012471	GTCT	2	8	1138925	1138932	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5101	NC_012471	GT	3	6	1138944	1138949	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5102	NC_012471	TG	3	6	1138971	1138976	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5103	NC_012471	TAG	2	6	1138987	1138992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5104	NC_012471	TAAAA	2	10	1139009	1139018	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5105	NC_012471	A	7	7	1139034	1139040	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5106	NC_012471	ATAAA	2	10	1139073	1139082	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5107	NC_012471	TA	3	6	1139149	1139154	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5108	NC_012471	TAG	2	6	1139197	1139202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5109	NC_012471	GA	3	6	1139219	1139224	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5110	NC_012471	AAGC	2	8	1140246	1140253	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5111	NC_012471	TGAT	2	8	1140254	1140261	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5112	NC_012471	TAG	2	6	1140304	1140309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5113	NC_012471	GCA	2	6	1140359	1140364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5114	NC_012471	CTT	2	6	1140986	1140991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5115	NC_012471	TC	3	6	1140993	1140998	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5116	NC_012471	AGAC	2	8	1141180	1141187	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5117	NC_012471	GCT	2	6	1141208	1141213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5118	NC_012471	CAT	2	6	1141228	1141233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5119	NC_012471	GAC	2	6	1141407	1141412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5120	NC_012471	GATAG	2	10	1141477	1141486	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
5121	NC_012471	AAG	2	6	1141501	1141506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5122	NC_012471	TGA	2	6	1141508	1141513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5123	NC_012471	TC	3	6	1141540	1141545	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5124	NC_012471	TAC	2	6	1141561	1141566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5125	NC_012471	T	6	6	1141608	1141613	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5126	NC_012471	CTG	2	6	1141621	1141626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5127	NC_012471	TTG	2	6	1141661	1141666	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5128	NC_012471	AGC	2	6	1141705	1141710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5129	NC_012471	TAA	2	6	1141725	1141730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5131	NC_012471	C	6	6	1143219	1143224	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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5263	NC_012471	GAT	2	6	1174756	1174761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5268	NC_012471	TAA	2	6	1174908	1174913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5284	NC_012471	A	6	6	1175332	1175337	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5378	NC_012471	CAA	2	6	1199734	1199739	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5379	NC_012471	A	6	6	1199738	1199743	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5380	NC_012471	GAA	2	6	1199758	1199763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5381	NC_012471	CT	3	6	1200621	1200626	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5382	NC_012471	A	7	7	1200641	1200647	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5383	NC_012471	A	6	6	1200650	1200655	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5392	NC_012471	TAT	2	6	1202820	1202825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5394	NC_012471	A	6	6	1202895	1202900	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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