MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Streptococcus equi subsp. equi 4047

Total Repeats: 9877

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_012471	A	6	6	998494	998499	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4502	NC_012471	TCG	2	6	998520	998525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4503	NC_012471	CAGT	2	8	998547	998554	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4504	NC_012471	TGA	2	6	998748	998753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4505	NC_012471	GTC	2	6	998828	998833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4506	NC_012471	CCT	2	6	998907	998912	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4507	NC_012471	AGAT	2	8	998921	998928	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4508	NC_012471	ACT	2	6	998996	999001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4509	NC_012471	ACA	2	6	999115	999120	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4510	NC_012471	AAAT	2	8	999124	999131	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4511	NC_012471	TAA	2	6	999270	999275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4512	NC_012471	ATTA	2	8	999285	999292	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4513	NC_012471	TAAG	2	8	1000324	1000331	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4514	NC_012471	A	6	6	1000357	1000362	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4515	NC_012471	ATA	2	6	1000375	1000380	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4516	NC_012471	T	7	7	1001962	1001968	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4517	NC_012471	GCT	2	6	1002579	1002584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4518	NC_012471	TTG	2	6	1002622	1002627	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4519	NC_012471	TA	3	6	1002646	1002651	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4520	NC_012471	AAAG	2	8	1002710	1002717	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4521	NC_012471	AGCT	2	8	1002723	1002730	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4522	NC_012471	GCA	2	6	1004581	1004586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4523	NC_012471	ATG	2	6	1004619	1004624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4524	NC_012471	T	6	6	1004639	1004644	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4525	NC_012471	AAG	2	6	1004723	1004728	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4526	NC_012471	GCAA	2	8	1007322	1007329	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4527	NC_012471	AGCA	2	8	1010173	1010180	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4528	NC_012471	A	6	6	1010182	1010187	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4529	NC_012471	TCT	2	6	1010224	1010229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4530	NC_012471	GA	3	6	1010242	1010247	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4531	NC_012471	CTTGC	2	10	1010257	1010266	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
4532	NC_012471	TC	3	6	1010286	1010291	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4533	NC_012471	CGTC	2	8	1010300	1010307	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4534	NC_012471	TTC	2	6	1010365	1010370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4535	NC_012471	CAT	2	6	1010381	1010386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4536	NC_012471	TTA	2	6	1010392	1010397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4537	NC_012471	CAA	2	6	1010434	1010439	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4538	NC_012471	CAT	2	6	1010479	1010484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4539	NC_012471	T	6	6	1010492	1010497	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4540	NC_012471	TAA	2	6	1010531	1010536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4541	NC_012471	TTA	2	6	1010544	1010549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4542	NC_012471	GAG	2	6	1010558	1010563	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4543	NC_012471	AAGAA	2	10	1012935	1012944	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
4544	NC_012471	GA	3	6	1013002	1013007	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4545	NC_012471	T	7	7	1013016	1013022	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4546	NC_012471	A	7	7	1013029	1013035	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4547	NC_012471	A	6	6	1013040	1013045	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4548	NC_012471	TAAAT	2	10	1013103	1013112	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4549	NC_012471	GTT	2	6	1013137	1013142	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4550	NC_012471	A	7	7	1013185	1013191	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4551	NC_012471	ATTTA	2	10	1013208	1013217	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4552	NC_012471	AGT	2	6	1013243	1013248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4553	NC_012471	ACA	2	6	1015634	1015639	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4554	NC_012471	TGA	2	6	1015677	1015682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4555	NC_012471	A	7	7	1016432	1016438	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4556	NC_012471	GCT	2	6	1016445	1016450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4557	NC_012471	GGTGAT	2	12	1016455	1016466	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
4558	NC_012471	CAA	2	6	1017111	1017116	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4559	NC_012471	TGC	2	6	1017118	1017123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4560	NC_012471	TA	3	6	1017155	1017160	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4561	NC_012471	CAA	2	6	1017179	1017184	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4562	NC_012471	AGG	2	6	1017198	1017203	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4563	NC_012471	TAA	2	6	1020593	1020598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4564	NC_012471	TGCT	2	8	1022216	1022223	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4565	NC_012471	T	6	6	1022261	1022266	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4566	NC_012471	T	6	6	1022332	1022337	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4567	NC_012471	TTG	2	6	1022359	1022364	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4568	NC_012471	TA	3	6	1022373	1022378	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4569	NC_012471	TAA	2	6	1022384	1022389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4570	NC_012471	T	7	7	1024216	1024222	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4571	NC_012471	TCAG	2	8	1025521	1025528	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4572	NC_012471	TTG	2	6	1025546	1025551	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4573	NC_012471	ATAG	2	8	1025581	1025588	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4574	NC_012471	AGA	2	6	1026504	1026509	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4575	NC_012471	TAA	2	6	1027459	1027464	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4576	NC_012471	TAAA	2	8	1030298	1030305	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4577	NC_012471	CTT	2	6	1030307	1030312	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4578	NC_012471	TTC	2	6	1030361	1030366	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4579	NC_012471	GAATAG	2	12	1030388	1030399	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4580	NC_012471	GA	3	6	1033101	1033106	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4581	NC_012471	TTGT	2	8	1034692	1034699	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4582	NC_012471	ATA	2	6	1034725	1034730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4583	NC_012471	AGAA	2	8	1034742	1034749	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4584	NC_012471	A	6	6	1034748	1034753	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4585	NC_012471	TAT	2	6	1035458	1035463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4586	NC_012471	AGCTG	2	10	1035496	1035505	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
4587	NC_012471	GTC	2	6	1035555	1035560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4588	NC_012471	GATT	2	8	1035579	1035586	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4589	NC_012471	CTA	2	6	1038234	1038239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4590	NC_012471	GAG	2	6	1038312	1038317	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4591	NC_012471	TCAGAG	2	12	1038368	1038379	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
4592	NC_012471	TGTC	2	8	1038412	1038419	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4593	NC_012471	AAGCTT	2	12	1038490	1038501	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4594	NC_012471	TTAGA	2	10	1038514	1038523	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4595	NC_012471	ACT	2	6	1038553	1038558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4596	NC_012471	A	7	7	1039277	1039283	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4597	NC_012471	AAG	2	6	1040629	1040634	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4598	NC_012471	T	7	7	1040644	1040650	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4599	NC_012471	TCT	2	6	1040655	1040660	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4600	NC_012471	ATAG	2	8	1040698	1040705	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4601	NC_012471	ATT	2	6	1040724	1040729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4602	NC_012471	CAGG	2	8	1040742	1040749	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4603	NC_012471	CAAA	2	8	1040753	1040760	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4604	NC_012471	A	6	6	1040781	1040786	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4605	NC_012471	A	6	6	1040810	1040815	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4606	NC_012471	CAA	2	6	1040820	1040825	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4607	NC_012471	ATT	2	6	1040843	1040848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4608	NC_012471	ATA	2	6	1040874	1040879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4609	NC_012471	A	6	6	1040916	1040921	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4610	NC_012471	AAG	2	6	1042972	1042977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4611	NC_012471	AGGA	2	8	1043266	1043273	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4612	NC_012471	AGC	2	6	1043324	1043329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4613	NC_012471	A	6	6	1043426	1043431	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4614	NC_012471	TA	3	6	1043729	1043734	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4615	NC_012471	CTA	2	6	1044692	1044697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4616	NC_012471	A	7	7	1044729	1044735	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4617	NC_012471	A	7	7	1044763	1044769	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4618	NC_012471	AT	3	6	1044848	1044853	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4619	NC_012471	AAAC	2	8	1044879	1044886	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4620	NC_012471	TTG	2	6	1045639	1045644	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4621	NC_012471	AGG	2	6	1048049	1048054	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4622	NC_012471	TCG	2	6	1049138	1049143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4623	NC_012471	TGGC	2	8	1049196	1049203	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4624	NC_012471	TCA	2	6	1051868	1051873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4625	NC_012471	TGG	2	6	1051912	1051917	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4626	NC_012471	G	8	8	1051975	1051982	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4627	NC_012471	TGG	2	6	1052051	1052056	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4628	NC_012471	GAG	2	6	1052057	1052062	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4629	NC_012471	TTG	2	6	1052063	1052068	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4630	NC_012471	CTG	2	6	1052149	1052154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4631	NC_012471	ATA	2	6	1052210	1052215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4632	NC_012471	TC	3	6	1052250	1052255	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4633	NC_012471	AT	3	6	1052276	1052281	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4634	NC_012471	TTTC	2	8	1052324	1052331	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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