MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Streptococcus equi subsp. zooepidemicus

Total Repeats: 8531

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_012470	CAC	2	6	932922	932927	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4002	NC_012470	A	6	6	932928	932933	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_012470	GGT	2	6	932934	932939	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_012470	CAT	2	6	932947	932952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4005	NC_012470	GCT	2	6	932968	932973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4006	NC_012470	AGT	2	6	932992	932997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_012470	ATC	2	6	933027	933032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4008	NC_012470	TTA	2	6	933063	933068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_012470	T	6	6	933079	933084	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4010	NC_012470	ATT	2	6	933789	933794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4011	NC_012470	TTG	2	6	933808	933813	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4012	NC_012470	TAT	2	6	935677	935682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_012470	AT	3	6	935686	935691	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4014	NC_012470	ACA	2	6	935700	935705	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4015	NC_012470	A	6	6	935708	935713	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_012470	A	6	6	935728	935733	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4017	NC_012470	ATT	2	6	935814	935819	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_012470	TTG	2	6	935833	935838	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_012470	CTG	2	6	935918	935923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4020	NC_012470	TTC	2	6	935933	935938	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4021	NC_012470	TCA	2	6	937419	937424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4022	NC_012470	AGG	2	6	937435	937440	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4023	NC_012470	ATA	2	6	938436	938441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4024	NC_012470	T	6	6	938470	938475	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4025	NC_012470	TTA	2	6	938545	938550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_012470	GACA	2	8	938579	938586	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4027	NC_012470	A	6	6	938599	938604	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4028	NC_012470	CTT	2	6	938637	938642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4029	NC_012470	TAA	2	6	938793	938798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4030	NC_012470	GCT	2	6	939782	939787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4031	NC_012470	GTG	2	6	939788	939793	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_012470	TTG	2	6	939798	939803	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_012470	GCT	2	6	939823	939828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4034	NC_012470	GCTG	2	8	939912	939919	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4035	NC_012470	TTG	2	6	939920	939925	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4036	NC_012470	T	6	6	939927	939932	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4037	NC_012470	ATT	2	6	942042	942047	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4038	NC_012470	ATACAA	2	12	942062	942073	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4039	NC_012470	GGA	2	6	942106	942111	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4040	NC_012470	TGA	2	6	942116	942121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_012470	TAG	2	6	942125	942130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_012470	TA	3	6	942157	942162	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_012470	ATT	2	6	942169	942174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_012470	T	6	6	942173	942178	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4045	NC_012470	AAAAT	2	10	942221	942230	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4046	NC_012470	A	6	6	942279	942284	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4047	NC_012470	TG	3	6	942304	942309	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4048	NC_012470	T	6	6	942343	942348	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4049	NC_012470	T	6	6	942356	942361	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4050	NC_012470	GAG	2	6	942362	942367	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4051	NC_012470	TGT	2	6	944180	944185	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4052	NC_012470	ATC	2	6	944194	944199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4053	NC_012470	ATT	2	6	944205	944210	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4054	NC_012470	A	6	6	946298	946303	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4055	NC_012470	AAT	2	6	946367	946372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4056	NC_012470	TCT	2	6	946415	946420	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4058	NC_012470	AAT	2	6	946551	946556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4059	NC_012470	TTATT	2	10	946651	946660	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4060	NC_012470	TGA	2	6	949872	949877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4061	NC_012470	GA	3	6	949885	949890	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_012470	AAAC	2	8	949898	949905	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4063	NC_012470	AATG	2	8	949956	949963	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4064	NC_012470	TAA	2	6	949972	949977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_012470	ATG	2	6	950077	950082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4066	NC_012470	TTA	2	6	950094	950099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4067	NC_012470	CAT	2	6	950136	950141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4070	NC_012470	GTCT	2	8	954113	954120	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4071	NC_012470	AGC	2	6	954239	954244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4072	NC_012470	ATC	2	6	954302	954307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4074	NC_012470	AAAGT	2	10	954351	954360	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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4080	NC_012470	A	7	7	955782	955788	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4081	NC_012470	CAT	2	6	955872	955877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4082	NC_012470	T	7	7	955886	955892	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4083	NC_012470	CTA	2	6	955921	955926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4084	NC_012470	GTT	2	6	955962	955967	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4085	NC_012470	ATG	2	6	959454	959459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4086	NC_012470	ATA	2	6	959506	959511	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4088	NC_012470	TGA	2	6	959562	959567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4089	NC_012470	CT	3	6	959570	959575	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4090	NC_012470	TCG	2	6	959609	959614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4091	NC_012470	GAT	2	6	959629	959634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4093	NC_012470	ATG	2	6	959685	959690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4094	NC_012470	ATT	2	6	959771	959776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4095	NC_012470	TCT	2	6	959799	959804	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4096	NC_012470	TTG	2	6	959846	959851	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4098	NC_012470	G	6	6	959930	959935	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4099	NC_012470	CAG	2	6	961325	961330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4101	NC_012470	TGT	2	6	961370	961375	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4102	NC_012470	TTCA	2	8	961387	961394	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4103	NC_012470	GCAAG	2	10	961410	961419	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
4104	NC_012470	ATG	2	6	961422	961427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4105	NC_012470	TTG	2	6	961430	961435	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4106	NC_012470	GCT	2	6	961488	961493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4107	NC_012470	T	6	6	961510	961515	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4108	NC_012470	GAT	3	9	961588	961596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4110	NC_012470	GAT	2	6	961651	961656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4111	NC_012470	TGG	2	6	963900	963905	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4112	NC_012470	ATTA	2	8	963940	963947	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4113	NC_012470	AG	3	6	964017	964022	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4114	NC_012470	CT	3	6	966095	966100	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4115	NC_012470	TTG	2	6	966110	966115	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4116	NC_012470	TAA	2	6	966241	966246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4117	NC_012470	A	6	6	966245	966250	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4118	NC_012470	TTGAAT	2	12	966335	966346	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4119	NC_012470	GTA	2	6	966383	966388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_012470	GGT	2	6	966420	966425	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4121	NC_012470	TCT	2	6	970056	970061	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4122	NC_012470	TAA	2	6	970088	970093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4123	NC_012470	TGTT	2	8	970145	970152	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4124	NC_012470	TAG	2	6	970155	970160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4125	NC_012470	TGA	2	6	970161	970166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4126	NC_012470	AT	3	6	970181	970186	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4127	NC_012470	AG	3	6	970187	970192	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4128	NC_012470	AATC	2	8	970193	970200	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4129	NC_012470	AGT	2	6	970217	970222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4130	NC_012470	A	6	6	970272	970277	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4131	NC_012470	AT	3	6	970282	970287	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4132	NC_012470	CTT	2	6	970388	970393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4133	NC_012470	TGT	2	6	970420	970425	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4134	NC_012470	GCT	2	6	970427	970432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4136	NC_012470	TCA	2	6	971183	971188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4267	NC_012470	A	7	7	1006175	1006181	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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