MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Streptococcus equi subsp. zooepidemicus

Total Repeats: 8531

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_012470	T	6	6	1393489	1393494	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5502	NC_012470	TGC	2	6	1393566	1393571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5503	NC_012470	TG	3	6	1393722	1393727	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5504	NC_012470	T	7	7	1393737	1393743	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5505	NC_012470	A	6	6	1394390	1394395	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5506	NC_012470	TAC	3	9	1394419	1394427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5507	NC_012470	T	7	7	1394438	1394444	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5508	NC_012470	T	6	6	1396041	1396046	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5509	NC_012470	TTA	2	6	1396057	1396062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5510	NC_012470	A	6	6	1396139	1396144	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5511	NC_012470	TGA	2	6	1396243	1396248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5512	NC_012470	TAG	2	6	1396249	1396254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5513	NC_012470	GTA	2	6	1396287	1396292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5514	NC_012470	TTTCT	2	10	1396351	1396360	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
5515	NC_012470	T	7	7	1396424	1396430	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5516	NC_012470	CTT	2	6	1396472	1396477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5517	NC_012470	CTT	2	6	1396504	1396509	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5518	NC_012470	CT	3	6	1396514	1396519	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5519	NC_012470	CTA	2	6	1396546	1396551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5520	NC_012470	GTTAAT	2	12	1396559	1396570	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5521	NC_012470	T	7	7	1396573	1396579	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5522	NC_012470	T	6	6	1396597	1396602	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5523	NC_012470	A	6	6	1396620	1396625	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5524	NC_012470	CTA	2	6	1396657	1396662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5525	NC_012470	TTTTAT	2	12	1396663	1396674	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5526	NC_012470	TAT	2	6	1396696	1396701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5527	NC_012470	TCC	2	6	1396707	1396712	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5528	NC_012470	A	6	6	1396724	1396729	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5529	NC_012470	T	6	6	1396739	1396744	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5530	NC_012470	CT	3	6	1398027	1398032	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5531	NC_012470	ATTAT	2	10	1398042	1398051	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5532	NC_012470	AT	3	6	1398063	1398068	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5533	NC_012470	AT	3	6	1398099	1398104	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5534	NC_012470	A	6	6	1398171	1398176	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5535	NC_012470	ATA	2	6	1398220	1398225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5536	NC_012470	AAT	2	6	1399070	1399075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5537	NC_012470	TTC	2	6	1399092	1399097	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5538	NC_012470	CTTT	2	8	1400276	1400283	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5539	NC_012470	ATT	2	6	1400284	1400289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5540	NC_012470	AT	3	6	1400309	1400314	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5541	NC_012470	TATT	2	8	1400328	1400335	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5542	NC_012470	CA	3	6	1400345	1400350	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5543	NC_012470	T	6	6	1400360	1400365	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5544	NC_012470	T	6	6	1400371	1400376	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5545	NC_012470	TCT	2	6	1400408	1400413	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5546	NC_012470	ATAG	2	8	1400447	1400454	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5547	NC_012470	TAT	2	6	1400485	1400490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5548	NC_012470	TCTT	2	8	1400491	1400498	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5549	NC_012470	TAA	2	6	1400557	1400562	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5550	NC_012470	TC	3	6	1400582	1400587	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5551	NC_012470	AATC	2	8	1400742	1400749	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5552	NC_012470	ATT	2	6	1400830	1400835	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5553	NC_012470	TA	3	6	1400854	1400859	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5554	NC_012470	TATTTC	2	12	1400868	1400879	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5555	NC_012470	TA	3	6	1400891	1400896	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5556	NC_012470	ATC	2	6	1400908	1400913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5557	NC_012470	ATT	2	6	1400914	1400919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5558	NC_012470	TA	3	6	1400947	1400952	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5559	NC_012470	TGA	2	6	1400961	1400966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5560	NC_012470	AT	3	6	1401002	1401007	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5561	NC_012470	T	6	6	1401024	1401029	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5562	NC_012470	TTA	2	6	1401036	1401041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5563	NC_012470	TA	3	6	1401067	1401072	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5564	NC_012470	TAT	2	6	1401118	1401123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5565	NC_012470	CCA	2	6	1401136	1401141	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5566	NC_012470	TAT	2	6	1401400	1401405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5567	NC_012470	AAC	2	6	1401419	1401424	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5568	NC_012470	A	6	6	1401439	1401444	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5573	NC_012470	CAT	2	6	1402538	1402543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5574	NC_012470	CT	3	6	1402570	1402575	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5575	NC_012470	ATC	2	6	1402590	1402595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5579	NC_012470	TCT	2	6	1402780	1402785	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5580	NC_012470	TTC	2	6	1402809	1402814	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5581	NC_012470	TCA	2	6	1402876	1402881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5584	NC_012470	TTC	2	6	1402950	1402955	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5585	NC_012470	GCA	2	6	1403050	1403055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5594	NC_012470	TTC	2	6	1403651	1403656	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5601	NC_012470	GATT	2	8	1404047	1404054	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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5604	NC_012470	CAT	2	6	1404140	1404145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5609	NC_012470	AATGG	2	10	1404372	1404381	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
5610	NC_012470	AAAGAA	2	12	1404414	1404425	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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5620	NC_012470	TAT	2	6	1404796	1404801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5621	NC_012470	TTTCT	2	10	1404843	1404852	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
5622	NC_012470	ATC	2	6	1404854	1404859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5626	NC_012470	TTC	2	6	1404893	1404898	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5627	NC_012470	TTA	2	6	1404906	1404911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5629	NC_012470	CTT	2	6	1404937	1404942	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5630	NC_012470	T	6	6	1404964	1404969	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5632	NC_012470	TCA	2	6	1405161	1405166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5634	NC_012470	CTAT	2	8	1405191	1405198	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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