MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae Taiwan19F-14 chromosome

Total Repeats: 164

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012469	TAAGGA	2	12	37175	37186	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012469	GAAGTG	2	12	40263	40274	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012469	ACTAAT	2	12	40293	40304	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_012469	TCTTGT	2	12	40949	40960	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_012469	AGTTGA	2	12	41613	41624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012469	TAAAAA	2	12	59415	59426	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012469	AAAAAT	2	12	75564	75575	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012469	TTCTAT	2	12	83144	83155	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_012469	TCCCAT	2	12	88993	89004	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_012469	TAAAAT	2	12	91370	91381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012469	TAAAAA	2	12	108077	108088	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012469	TTATGT	2	12	115237	115248	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012469	AAGCAG	2	12	116028	116039	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_012469	ATAAAA	2	12	144806	144817	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_012469	TTTGCT	2	12	154005	154016	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_012469	ATAAAA	2	12	154396	154407	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_012469	ATAAAT	2	12	159308	159319	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012469	GAAGCA	2	12	165648	165659	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_012469	CACTAA	2	12	202807	202818	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_012469	GTATTT	2	12	208568	208579	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_012469	ATTTTG	2	12	209638	209649	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012469	TAAAAA	2	12	217232	217243	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012469	TTTTAC	2	12	219232	219243	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_012469	GTAAAG	2	12	240310	240321	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_012469	AGATAA	2	12	245787	245798	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_012469	CATAAT	2	12	247854	247865	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_012469	TCTTAA	2	12	264362	264373	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_012469	GGTTGC	2	12	281170	281181	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_012469	TCCCAT	2	12	313120	313131	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_012469	GAAAAA	2	12	348672	348683	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_012469	ACAAGA	2	12	355351	355362	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_012469	TCTATC	2	12	355997	356008	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_012469	GCAGTT	2	12	389489	389500	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_012469	AGAAAT	2	12	437495	437506	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_012469	ATGAAG	2	12	448324	448335	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_012469	CATCTC	2	12	473526	473537	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_012469	AGTTGA	2	12	473645	473656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012469	GCTTGC	2	12	492384	492395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_012469	CTTGAA	2	12	535266	535277	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_012469	AGTGGA	2	12	537250	537261	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_012469	TAAAAA	2	12	540290	540301	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_012469	TGCTTT	2	12	544398	544409	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_012469	ATTAAT	2	12	559801	559812	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_012469	AAAATG	2	12	563666	563677	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_012469	TCTTTT	2	12	574737	574748	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_012469	AAAGTT	2	12	624715	624726	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_012469	ACTTCT	2	12	641455	641466	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_012469	GAGATG	2	12	643913	643924	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_012469	TAACAT	2	12	751242	751253	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_012469	CATCTC	2	12	783315	783326	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_012469	AGTTGA	2	12	783434	783445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_012469	AAAGGA	2	12	796642	796653	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_012469	CTAATA	2	12	804924	804935	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_012469	ACCATC	2	12	813354	813365	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_012469	TTTCAA	2	12	842094	842105	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_012469	TACCTA	2	12	853070	853081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_012469	GATGAA	2	12	859908	859919	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_012469	GTAGCT	2	12	860484	860495	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_012469	ATTTTT	2	12	878065	878076	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_012469	TGATTG	2	12	909119	909130	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_012469	AAATAA	2	12	909251	909262	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_012469	AACAAA	2	12	973521	973532	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_012469	AAACAA	2	12	982700	982711	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_012469	AGTTGA	2	12	995945	995956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_012469	TAAAAA	2	12	1024220	1024231	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_012469	TTAAAA	2	12	1028753	1028764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_012469	TGTCAA	2	12	1035259	1035270	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_012469	AAGAAA	2	12	1036565	1036576	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_012469	AAAGTA	2	12	1037345	1037356	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_012469	ATTCGA	2	12	1041563	1041574	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_012469	AGCCTT	2	12	1042837	1042848	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_012469	CCAGAT	2	12	1042913	1042924	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_012469	CATCTC	2	12	1061709	1061720	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_012469	AGTTGA	2	12	1061828	1061839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_012469	CATCTC	2	12	1081170	1081181	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_012469	AGTTGA	2	12	1081289	1081300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_012469	AGTTGA	2	12	1110457	1110468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_012469	AATTTT	2	12	1144065	1144076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_012469	AAGAAA	2	12	1150240	1150251	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_012469	TCAACT	2	12	1153999	1154010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_012469	GAGATG	2	12	1154118	1154129	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_012469	CTTTTT	2	12	1161990	1162001	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_012469	GAAATA	2	12	1162038	1162049	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_012469	TAAAAA	2	12	1173525	1173536	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_012469	GTTTGT	2	12	1186291	1186302	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_012469	CTTGGT	2	12	1192814	1192825	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_012469	CTTTTT	2	12	1193677	1193688	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_012469	TTTATA	2	12	1243110	1243121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_012469	TTTTAA	2	12	1246592	1246603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_012469	ATAAAA	2	12	1268248	1268259	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_012469	TCAACT	2	12	1280261	1280272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_012469	CCCGAA	2	12	1282733	1282744	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
93	NC_012469	GTTTTT	2	12	1305928	1305939	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_012469	AAATTT	2	12	1315291	1315302	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_012469	AACAAA	2	12	1319382	1319393	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_012469	TTGTTC	2	12	1319394	1319405	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_012469	TCTTTT	2	12	1323973	1323984	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_012469	TGAAAA	2	12	1333850	1333861	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_012469	ATCCTT	2	12	1355517	1355528	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_012469	TGCTTC	2	12	1363011	1363022	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_012469	ACTAAA	2	12	1364334	1364345	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_012469	AAATTT	2	12	1379095	1379106	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_012469	TCAAGT	2	12	1379166	1379177	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_012469	CTTTTC	2	12	1379692	1379703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_012469	CTTTCT	2	12	1483177	1483188	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_012469	CCGTTT	2	12	1489763	1489774	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_012469	AAAAAC	2	12	1489929	1489940	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_012469	TTAAAA	2	12	1546266	1546277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_012469	CTAGAG	2	12	1559329	1559340	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_012469	CCTAAG	2	12	1581765	1581776	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_012469	AACTTG	2	12	1581888	1581899	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_012469	ATTTGA	2	12	1606249	1606260	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_012469	TAATCA	2	12	1614219	1614230	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_012469	CACTTC	2	12	1631965	1631976	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_012469	AAAAAT	2	12	1643233	1643244	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_012469	GAACAT	2	12	1655521	1655532	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_012469	CTTTCT	2	12	1677422	1677433	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_012469	TAGGCT	2	12	1678353	1678364	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_012469	TCATTA	2	12	1688807	1688818	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_012469	TAATCA	2	12	1707605	1707616	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_012469	TCAACT	2	12	1713422	1713433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_012469	GAGATG	2	12	1713541	1713552	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_012469	TATTAG	2	12	1735423	1735434	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_012469	CACTTC	2	12	1735454	1735465	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_012469	TCCTTA	2	12	1738542	1738553	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_012469	TGGGCT	2	12	1745820	1745831	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_012469	AATTGA	2	12	1761787	1761798	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.