MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae Taiwan19F-14 chromosome

Total Repeats: 1121

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012469	CTAT	2	8	138	145	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_012469	ATAA	2	8	1699	1706	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012469	TTAG	2	8	3119	3126	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012469	ATCT	2	8	5357	5364	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_012469	TCTG	2	8	5518	5525	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_012469	TTGC	2	8	11484	11491	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_012469	GCTT	2	8	12736	12743	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_012469	AAAG	2	8	14228	14235	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012469	ATGA	2	8	15769	15776	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012469	CTTT	2	8	16040	16047	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_012469	AGCT	2	8	18461	18468	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_012469	TGAC	2	8	18635	18642	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_012469	AATA	2	8	19680	19687	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012469	ATTT	2	8	20232	20239	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_012469	CAAA	2	8	21963	21970	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_012469	TTGC	2	8	22157	22164	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_012469	TGAG	2	8	35610	35617	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012469	GCTT	2	8	35707	35714	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_012469	CCTG	2	8	35755	35762	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
20	NC_012469	GTGA	2	8	36035	36042	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_012469	AGCG	2	8	36206	36213	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
22	NC_012469	AGCC	2	8	37087	37094	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
23	NC_012469	GTAA	2	8	37509	37516	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_012469	GCGA	2	8	37665	37672	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
25	NC_012469	ATTC	2	8	38531	38538	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_012469	CTAA	2	8	38885	38892	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_012469	GTCT	2	8	38910	38917	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_012469	TAGG	2	8	39541	39548	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012469	CTTT	2	8	41056	41063	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_012469	AATA	2	8	44623	44630	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_012469	AGAA	2	8	47592	47599	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012469	TTGA	2	8	48476	48483	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012469	AATA	2	8	49579	49586	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_012469	TTCT	2	8	49953	49960	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_012469	AATT	2	8	51048	51055	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_012469	CTAT	2	8	51152	51159	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_012469	ATTT	2	8	60016	60023	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012469	GGGA	2	8	60133	60140	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
39	NC_012469	GAAG	2	8	60156	60163	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_012469	TGAC	2	8	60270	60277	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_012469	ATAG	2	8	68722	68729	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_012469	TTTC	2	8	74029	74036	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_012469	TAAT	2	8	84274	84281	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_012469	GTTT	2	8	90273	90280	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_012469	AGAA	2	8	97327	97334	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_012469	TAGC	2	8	97729	97736	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_012469	AAAT	2	8	97772	97779	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_012469	AAGG	2	8	97956	97963	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_012469	TAAT	2	8	98588	98595	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_012469	AAAG	2	8	98685	98692	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_012469	AAAT	2	8	101750	101757	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_012469	CTTT	2	8	101811	101818	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_012469	AATT	2	8	104851	104858	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_012469	TTTG	2	8	105807	105814	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_012469	ATTC	2	8	109600	109607	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_012469	AAAT	2	8	109758	109765	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_012469	ATAA	2	8	109801	109808	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_012469	GTTT	2	8	111044	111051	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_012469	TGTA	2	8	111080	111087	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_012469	ACAA	2	8	112574	112581	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_012469	TTCC	2	8	112717	112724	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_012469	AAAG	2	8	112998	113005	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_012469	AAAG	2	8	113231	113238	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_012469	ATGA	2	8	114772	114779	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_012469	ATTT	2	8	115047	115054	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_012469	TTAT	2	8	115419	115426	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_012469	TTAG	2	8	117180	117187	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_012469	ACAT	2	8	119088	119095	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_012469	AAAG	2	8	119106	119113	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_012469	AGAA	2	8	126224	126231	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_012469	GAAG	2	8	127539	127546	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_012469	AAAT	2	8	127623	127630	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_012469	TCCC	2	8	127916	127923	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
74	NC_012469	TTCA	2	8	130709	130716	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_012469	GTAG	2	8	133040	133047	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_012469	GTAT	2	8	133098	133105	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_012469	TGCT	2	8	133235	133242	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
78	NC_012469	AGGA	2	8	133431	133438	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_012469	TTAT	2	8	133939	133946	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_012469	TTTG	2	8	134045	134052	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_012469	AAAT	2	8	135250	135257	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_012469	GTAT	2	8	135367	135374	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_012469	TCAG	2	8	135657	135664	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
84	NC_012469	GATA	2	8	136435	136442	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_012469	TATT	2	8	136487	136494	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_012469	TCTA	2	8	136909	136916	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_012469	TGAA	2	8	137001	137008	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_012469	TTTA	2	8	137022	137029	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_012469	AAGC	2	8	137107	137114	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
90	NC_012469	TTAT	2	8	139151	139158	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_012469	ATAA	2	8	139185	139192	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_012469	GTAT	2	8	140360	140367	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_012469	TTTA	2	8	140412	140419	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_012469	ATTT	2	8	143582	143589	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_012469	AATT	2	8	144176	144183	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_012469	GAAA	2	8	144924	144931	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_012469	GAAG	2	8	145034	145041	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_012469	TTAT	2	8	147589	147596	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_012469	TGAA	2	8	147607	147614	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_012469	AAAG	2	8	151749	151756	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_012469	TCAA	2	8	157455	157462	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_012469	GGAT	2	8	157977	157984	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_012469	TAGG	2	8	158964	158971	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_012469	GTAG	2	8	159062	159069	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_012469	AAGC	2	8	159083	159090	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
106	NC_012469	CTGC	2	8	159251	159258	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
107	NC_012469	AAAT	2	8	159800	159807	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_012469	ATGG	2	8	160202	160209	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_012469	AATA	2	8	160348	160355	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_012469	GAAA	2	8	160576	160583	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_012469	GAAG	2	8	160807	160814	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_012469	GGGA	2	8	163535	163542	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
113	NC_012469	ATTT	2	8	164007	164014	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_012469	GTTA	2	8	164844	164851	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_012469	ATAA	2	8	165168	165175	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_012469	CAAA	2	8	165436	165443	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_012469	GAAG	2	8	165561	165568	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_012469	GTTT	2	8	165767	165774	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_012469	AAAT	2	8	165873	165880	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_012469	TAAT	2	8	166035	166042	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_012469	ATTG	2	8	166048	166055	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_012469	GGCT	2	8	166542	166549	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
123	NC_012469	AATT	2	8	170161	170168	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_012469	GAAA	2	8	170521	170528	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_012469	GCAG	2	8	170548	170555	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
126	NC_012469	AGAT	2	8	171555	171562	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_012469	GGTG	2	8	172489	172496	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
128	NC_012469	CAAA	2	8	172564	172571	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_012469	TCAT	2	8	182238	182245	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
130	NC_012469	CTTT	2	8	183779	183786	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_012469	TTTC	2	8	185658	185665	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_012469	TTCT	2	8	186871	186878	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
133	NC_012469	AGCT	2	8	196200	196207	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
134	NC_012469	CAAT	2	8	200870	200877	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_012469	TTAG	2	8	200920	200927	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_012469	TCGG	2	8	203034	203041	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
137	NC_012469	GATT	2	8	208430	208437	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_012469	TGAT	2	8	208450	208457	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_012469	TTAA	2	8	208933	208940	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_012469	GGAA	2	8	209606	209613	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_012469	TTGC	2	8	209862	209869	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
142	NC_012469	AGAA	2	8	210938	210945	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_012469	GGTA	2	8	214959	214966	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_012469	AGAA	2	8	215417	215424	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
145	NC_012469	AAAT	2	8	216009	216016	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_012469	ATTG	2	8	217376	217383	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
147	NC_012469	AGAA	2	8	220928	220935	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_012469	CTAA	2	8	220954	220961	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
149	NC_012469	AGAA	2	8	222759	222766	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
150	NC_012469	GCAT	2	8	222781	222788	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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152	NC_012469	GTTT	2	8	234970	234977	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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