MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae Taiwan19F-14 chromosome

Total Repeats: 8305

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_012469	A	6	6	1236743	1236748	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5002	NC_012469	GAG	2	6	1236767	1236772	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5003	NC_012469	CAG	2	6	1236817	1236822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5004	NC_012469	GAG	2	6	1236842	1236847	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5005	NC_012469	GAA	2	6	1236848	1236853	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_012469	GA	3	6	1236896	1236901	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5007	NC_012469	ATGA	2	8	1236905	1236912	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5008	NC_012469	GTAA	2	8	1236976	1236983	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5009	NC_012469	AT	3	6	1237038	1237043	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5010	NC_012469	A	6	6	1237175	1237180	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5011	NC_012469	CA	3	6	1237186	1237191	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5012	NC_012469	TA	4	8	1238753	1238760	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5013	NC_012469	TTA	2	6	1238775	1238780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5014	NC_012469	TTC	2	6	1239831	1239836	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5015	NC_012469	TTC	2	6	1239864	1239869	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5016	NC_012469	TAT	2	6	1243015	1243020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5017	NC_012469	TCA	2	6	1243060	1243065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5018	NC_012469	ATTT	2	8	1243074	1243081	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5019	NC_012469	TCA	2	6	1243102	1243107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5020	NC_012469	TTTATA	2	12	1243110	1243121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5021	NC_012469	TA	3	6	1243130	1243135	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5022	NC_012469	ATATA	2	10	1243148	1243157	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5023	NC_012469	CTAT	2	8	1243180	1243187	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5024	NC_012469	ATT	2	6	1243248	1243253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5025	NC_012469	T	9	9	1243284	1243292	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5026	NC_012469	ATA	2	6	1243296	1243301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5027	NC_012469	ATT	2	6	1245616	1245621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5028	NC_012469	A	6	6	1246123	1246128	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5029	NC_012469	TAT	2	6	1246369	1246374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5030	NC_012469	TAA	2	6	1246451	1246456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5031	NC_012469	CAA	2	6	1246463	1246468	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5032	NC_012469	AAC	2	6	1246512	1246517	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5033	NC_012469	TTC	2	6	1246547	1246552	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5034	NC_012469	TAA	2	6	1246554	1246559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5035	NC_012469	AT	3	6	1246568	1246573	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5036	NC_012469	TTTTAA	2	12	1246592	1246603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5037	NC_012469	ACC	2	6	1251062	1251067	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5039	NC_012469	ATTT	2	8	1252136	1252143	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5040	NC_012469	TCC	2	6	1252828	1252833	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5041	NC_012469	TAT	2	6	1252841	1252846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_012469	ATT	2	6	1255548	1255553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5043	NC_012469	CAAA	2	8	1255565	1255572	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5044	NC_012469	GTC	2	6	1255806	1255811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5045	NC_012469	T	6	6	1255958	1255963	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5046	NC_012469	ACAAA	2	10	1255969	1255978	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
5047	NC_012469	T	6	6	1257939	1257944	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5048	NC_012469	CT	3	6	1258791	1258796	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5049	NC_012469	A	9	9	1258832	1258840	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5050	NC_012469	T	6	6	1258846	1258851	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5051	NC_012469	A	8	8	1258864	1258871	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5052	NC_012469	T	7	7	1258877	1258883	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5053	NC_012469	T	7	7	1261359	1261365	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5054	NC_012469	T	7	7	1261370	1261376	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5055	NC_012469	TAA	2	6	1261391	1261396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5056	NC_012469	GA	3	6	1261410	1261415	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5057	NC_012469	CTTC	2	8	1261861	1261868	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5058	NC_012469	AAG	2	6	1261879	1261884	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5059	NC_012469	CTT	2	6	1264129	1264134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5060	NC_012469	TTG	2	6	1264168	1264173	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5061	NC_012469	TTC	2	6	1264195	1264200	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5062	NC_012469	TAT	2	6	1264201	1264206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5063	NC_012469	CCT	2	6	1267886	1267891	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5064	NC_012469	ATTC	2	8	1267907	1267914	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5065	NC_012469	CTTT	2	8	1267922	1267929	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5066	NC_012469	T	6	6	1267942	1267947	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5067	NC_012469	TTTC	2	8	1267953	1267960	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5068	NC_012469	T	6	6	1267972	1267977	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5069	NC_012469	AGTA	2	8	1268031	1268038	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5070	NC_012469	GCGT	2	8	1268098	1268105	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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5075	NC_012469	T	7	7	1268183	1268189	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5080	NC_012469	TAT	2	6	1268393	1268398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5081	NC_012469	TAA	3	9	1268492	1268500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5082	NC_012469	CTG	2	6	1268541	1268546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5099	NC_012469	ATTT	2	8	1270405	1270412	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5100	NC_012469	CCTC	2	8	1270430	1270437	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
5101	NC_012469	ATT	2	6	1270477	1270482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5102	NC_012469	T	8	8	1270495	1270502	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5103	NC_012469	ACT	2	6	1270520	1270525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5104	NC_012469	T	6	6	1271791	1271796	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5105	NC_012469	CATA	2	8	1271901	1271908	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5106	NC_012469	CTTT	2	8	1273385	1273392	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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5109	NC_012469	TACT	2	8	1277189	1277196	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5110	NC_012469	A	8	8	1277262	1277269	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5111	NC_012469	A	6	6	1277442	1277447	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5112	NC_012469	CAG	2	6	1277455	1277460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5113	NC_012469	ATA	3	9	1277475	1277483	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5114	NC_012469	TTG	2	6	1277486	1277491	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5115	NC_012469	TAT	2	6	1279686	1279691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5116	NC_012469	A	6	6	1279695	1279700	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5117	NC_012469	ATA	2	6	1279756	1279761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5118	NC_012469	A	7	7	1279813	1279819	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5120	NC_012469	CAT	2	6	1279939	1279944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5127	NC_012469	TCAACT	2	12	1280261	1280272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5128	NC_012469	ATC	2	6	1280405	1280410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5129	NC_012469	ACA	2	6	1280739	1280744	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5130	NC_012469	AAAGA	2	10	1280992	1281001	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
5131	NC_012469	AAT	2	6	1281052	1281057	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5132	NC_012469	TCA	2	6	1281059	1281064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5134	NC_012469	A	6	6	1281142	1281147	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5405	NC_012469	ATGA	2	8	1357549	1357556	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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