MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae 70585

Total Repeats: 120

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012468	TAAGGA	2	12	18316	18327	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012468	GAAGTG	2	12	21404	21415	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012468	ACTAAT	2	12	21434	21445	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_012468	CCCCCT	2	12	37690	37701	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
5	NC_012468	AGGCTT	2	12	61135	61146	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_012468	TAAAAA	2	12	77413	77424	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012468	AAAAAT	2	12	98398	98409	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012468	TTCTAT	2	12	106001	106012	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_012468	TCCCAT	2	12	111809	111820	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_012468	TAAAAT	2	12	114186	114197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012468	TAAAAA	2	12	131085	131096	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012468	AGACTT	2	12	151429	151440	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_012468	ATTGAG	2	12	151955	151966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012468	TTTGCT	2	12	178956	178967	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_012468	ATAAAA	2	12	179347	179358	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012468	ATAAAT	2	12	184258	184269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_012468	GAAGCA	2	12	189198	189209	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_012468	TCAAAA	2	12	208921	208932	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_012468	TTTTAC	2	12	226271	226282	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_012468	AGATAA	2	12	252653	252664	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_012468	TCTTAA	2	12	271584	271595	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_012468	GGTTGC	2	12	288437	288448	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_012468	TCTTTT	2	12	307883	307894	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_012468	ATTTAT	2	12	319436	319447	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_012468	GAAAAA	2	12	354729	354740	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_012468	GCAGTT	2	12	401401	401412	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_012468	AGAAAT	2	12	455171	455182	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_012468	AAATAA	2	12	460323	460334	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012468	ATGAAG	2	12	466001	466012	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_012468	ACTATC	2	12	479799	479810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_012468	GCTTGC	2	12	496740	496751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_012468	AAAAAC	2	12	514569	514580	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_012468	ATAAAA	2	12	514685	514696	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_012468	AGGAAC	2	12	515148	515159	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_012468	CTTGAA	2	12	536407	536418	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_012468	AGGATA	2	12	536601	536612	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_012468	TAAAAA	2	12	542330	542341	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012468	TGCTTT	2	12	547901	547912	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_012468	TCTTTT	2	12	579415	579426	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_012468	AAAGTT	2	12	629514	629525	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_012468	ACTTCT	2	12	646102	646113	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_012468	GAGATG	2	12	648567	648578	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_012468	AGAGGA	2	12	717350	717361	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_012468	AGATTG	2	12	729783	729794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_012468	AACATA	2	12	750008	750019	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_012468	TTTTCA	2	12	772125	772136	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_012468	TTTTGT	2	12	791907	791918	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_012468	AAAAAC	2	12	797657	797668	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_012468	TTCGGG	2	12	820814	820825	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_012468	TTAAAA	2	12	856947	856958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_012468	TATAAA	2	12	860428	860439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_012468	TCAAGT	2	12	881567	881578	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_012468	TATTTT	2	12	882785	882796	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_012468	AAAAAG	2	12	912396	912407	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_012468	ACCAAG	2	12	913259	913270	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_012468	ACAAAC	2	12	919772	919783	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_012468	TTTTTA	2	12	932538	932549	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_012468	CTATTT	2	12	944014	944025	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_012468	AAAAAG	2	12	944063	944074	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_012468	TTTTCT	2	12	954347	954358	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_012468	TTTTGT	2	12	1006713	1006724	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_012468	TATGAT	2	12	1013572	1013583	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_012468	TAAAAA	2	12	1016314	1016325	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_012468	TGTCAA	2	12	1021931	1021942	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_012468	AATGGA	2	12	1033872	1033883	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_012468	GAAGTA	2	12	1038682	1038693	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_012468	TGGTAT	2	12	1038821	1038832	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_012468	TTTTTG	2	12	1147954	1147965	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_012468	TGAAAA	2	12	1172866	1172877	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_012468	GTTGAA	2	12	1178397	1178408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_012468	AGAAAA	2	12	1223086	1223097	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_012468	TAAAAA	2	12	1263818	1263829	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_012468	AATCTA	2	12	1285926	1285937	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_012468	TAGGTA	2	12	1303847	1303858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_012468	TTGAAA	2	12	1314823	1314834	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_012468	AGCAAC	2	12	1328668	1328679	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_012468	GATGGT	2	12	1343636	1343647	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_012468	TTTTAT	2	12	1355153	1355164	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_012468	TTTCCT	2	12	1359490	1359501	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_012468	TGCTTC	2	12	1413145	1413156	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_012468	ACTAAA	2	12	1414486	1414497	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_012468	AAATTT	2	12	1429246	1429257	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_012468	TCAAGT	2	12	1429317	1429328	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_012468	CTTTTC	2	12	1429845	1429856	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_012468	CTTTCT	2	12	1534855	1534866	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_012468	CCGTTT	2	12	1541437	1541448	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_012468	TTAAAA	2	12	1596240	1596251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_012468	AACTTG	2	12	1632052	1632063	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_012468	ATTTGA	2	12	1654894	1654905	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_012468	TAATCA	2	12	1662864	1662875	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_012468	CCTGTC	2	12	1670112	1670123	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
92	NC_012468	CACTTC	2	12	1706827	1706838	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_012468	AAAAAT	2	12	1723997	1724008	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_012468	TCTATT	2	12	1729417	1729428	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_012468	GAACAT	2	12	1746081	1746092	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_012468	CTTTCT	2	12	1765172	1765183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_012468	TAGGCT	2	12	1766099	1766110	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_012468	TCATTA	2	12	1777847	1777858	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_012468	TAATCA	2	12	1796604	1796615	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_012468	TAAAAA	2	12	1822884	1822895	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_012468	TATTAG	2	12	1824639	1824650	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_012468	CACTTC	2	12	1824670	1824681	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_012468	TCCTTA	2	12	1827758	1827769	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_012468	CCAGAA	2	12	1854291	1854302	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_012468	AGGACA	2	12	1898097	1898108	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_012468	AAAAAT	2	12	1901613	1901624	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_012468	TATTAG	2	12	1913833	1913844	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_012468	CACTTC	2	12	1913864	1913875	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_012468	TCCTTA	2	12	1916952	1916963	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_012468	ATGATT	2	12	1929945	1929956	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_012468	CCCGAA	2	12	1976626	1976637	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
112	NC_012468	TATTAG	2	12	1977500	1977511	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_012468	CACTTC	2	12	1977531	1977542	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_012468	TCCTTA	2	12	1980619	1980630	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_012468	TATAGT	2	12	2049708	2049719	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_012468	TAAATT	2	12	2078557	2078568	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_012468	TCCAAC	2	12	2083976	2083987	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_012468	GATAAA	2	12	2121826	2121837	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_012468	TCCACT	2	12	2123989	2124000	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_012468	ACCTTG	2	12	2142340	2142351	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.