MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae JJA

Total Repeats: 1064

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012466	CTAT	2	8	138	145	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_012466	ATAA	2	8	1699	1706	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012466	TTAG	2	8	3119	3126	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012466	GCTT	2	8	15427	15434	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_012466	CCTG	2	8	15475	15482	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6	NC_012466	GTGA	2	8	15755	15762	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012466	AGCG	2	8	15926	15933	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8	NC_012466	AGCC	2	8	16807	16814	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
9	NC_012466	GTAA	2	8	17229	17236	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012466	GCGA	2	8	17385	17392	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11	NC_012466	ATTC	2	8	18251	18258	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_012466	CTAA	2	8	18605	18612	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_012466	GTCT	2	8	18630	18637	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_012466	TAGG	2	8	19261	19268	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_012466	TTTG	2	8	24951	24958	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012466	AAAT	2	8	28665	28672	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_012466	TGCT	2	8	29010	29017	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_012466	TATC	2	8	30877	30884	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_012466	AATA	2	8	31175	31182	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_012466	AGAA	2	8	34144	34151	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_012466	TTGA	2	8	34996	35003	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012466	TTCT	2	8	36473	36480	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_012466	AATT	2	8	37566	37573	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_012466	CTAT	2	8	37670	37677	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_012466	TAGA	2	8	41071	41078	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_012466	TAGA	2	8	41116	41123	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_012466	TAGA	2	8	41161	41168	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_012466	TAGA	2	8	41206	41213	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012466	TAGA	2	8	41251	41258	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_012466	TAGA	2	8	41296	41303	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_012466	ATTT	2	8	46814	46821	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012466	TGTT	2	8	46891	46898	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012466	TCTA	2	8	48239	48246	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_012466	TTTA	2	8	48394	48401	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_012466	ATTT	2	8	48523	48530	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_012466	ACAT	2	8	48623	48630	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_012466	GGGA	2	8	51766	51773	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012466	GAAG	2	8	51789	51796	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_012466	TGAC	2	8	51903	51910	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_012466	TATT	2	8	55623	55630	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_012466	ATAG	2	8	60355	60362	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_012466	TTTC	2	8	65662	65669	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_012466	TAAT	2	8	78171	78178	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_012466	GTTT	2	8	84129	84136	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_012466	GAAG	2	8	91230	91237	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_012466	TAGC	2	8	91676	91683	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_012466	AAGG	2	8	91903	91910	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_012466	TAAT	2	8	92535	92542	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_012466	AAAG	2	8	92632	92639	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_012466	AAAT	2	8	95241	95248	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_012466	CTTT	2	8	95302	95309	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_012466	AATT	2	8	98343	98350	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_012466	TTTG	2	8	99299	99306	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_012466	ATTC	2	8	103092	103099	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_012466	AAAT	2	8	103250	103257	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_012466	ATAA	2	8	103293	103300	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_012466	GTTT	2	8	104383	104390	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_012466	TGTA	2	8	104419	104426	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_012466	TTAG	2	8	106462	106469	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_012466	ACAT	2	8	108370	108377	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_012466	AAAG	2	8	108388	108395	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_012466	GTAT	2	8	112843	112850	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_012466	AGAA	2	8	115462	115469	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_012466	GAAG	2	8	116776	116783	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_012466	AAAT	2	8	116860	116867	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_012466	TCCC	2	8	117153	117160	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
67	NC_012466	GTTC	2	8	119945	119952	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
68	NC_012466	TGAC	2	8	119962	119969	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_012466	ACAA	2	8	120115	120122	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_012466	AAAG	2	8	121042	121049	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_012466	TTGG	2	8	121754	121761	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_012466	CCAA	2	8	122130	122137	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_012466	AACA	2	8	124771	124778	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_012466	AAAT	2	8	124837	124844	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_012466	GTAG	2	8	124896	124903	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_012466	GTAT	2	8	124954	124961	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_012466	AAAT	2	8	125117	125124	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_012466	ATTT	2	8	131995	132002	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_012466	AATT	2	8	132589	132596	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_012466	GAAG	2	8	133447	133454	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_012466	AAGA	2	8	133815	133822	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_012466	AAGC	2	8	135316	135323	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
83	NC_012466	AAGC	2	8	135678	135685	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
84	NC_012466	TTAT	2	8	135980	135987	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_012466	TGAA	2	8	135998	136005	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_012466	AAAG	2	8	140140	140147	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_012466	TTGC	2	8	142442	142449	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
88	NC_012466	TAGG	2	8	147355	147362	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_012466	GTAG	2	8	147453	147460	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_012466	AAGC	2	8	147474	147481	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_012466	CTGC	2	8	147642	147649	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
92	NC_012466	AAAT	2	8	148191	148198	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_012466	ATGG	2	8	148593	148600	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_012466	GAAA	2	8	148967	148974	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_012466	GAAG	2	8	149198	149205	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_012466	GGGA	2	8	151959	151966	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
97	NC_012466	ATTT	2	8	152432	152439	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_012466	GGCT	2	8	154978	154985	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
99	NC_012466	AATT	2	8	158594	158601	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_012466	GAAA	2	8	158864	158871	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_012466	GCAG	2	8	158891	158898	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
102	NC_012466	AGAT	2	8	159898	159905	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_012466	CAAA	2	8	160907	160914	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_012466	TTTC	2	8	172292	172299	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
105	NC_012466	TTCT	2	8	173505	173512	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_012466	AGCT	2	8	182839	182846	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
107	NC_012466	AGAA	2	8	184693	184700	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_012466	GGTA	2	8	188714	188721	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_012466	AGAA	2	8	189172	189179	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_012466	AAAT	2	8	189764	189771	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_012466	ATTG	2	8	191081	191088	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_012466	AGAA	2	8	194633	194640	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_012466	CTAA	2	8	194659	194666	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_012466	AGAA	2	8	196464	196471	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_012466	AGAA	2	8	200652	200659	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_012466	GTTT	2	8	208514	208521	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_012466	ACAA	2	8	208522	208529	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_012466	TAAA	2	8	217605	217612	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_012466	TTTA	2	8	217679	217686	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_012466	CTTG	2	8	218495	218502	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
121	NC_012466	TAGG	2	8	219126	219133	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_012466	TGGA	2	8	219393	219400	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_012466	CAAG	2	8	219605	219612	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
124	NC_012466	CATA	2	8	219959	219966	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
125	NC_012466	AAAG	2	8	220071	220078	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_012466	AAGA	2	8	220170	220177	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_012466	AGTG	2	8	221403	221410	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_012466	AATT	2	8	222566	222573	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_012466	GAAA	2	8	223744	223751	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_012466	ACGA	2	8	223759	223766	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
131	NC_012466	GAAA	2	8	227859	227866	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_012466	GAAA	2	8	227880	227887	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_012466	AATT	2	8	232234	232241	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_012466	TATT	2	8	232333	232340	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_012466	ATTA	2	8	232349	232356	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_012466	ATTT	2	8	235089	235096	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_012466	TAAA	2	8	236459	236466	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_012466	TTTA	2	8	236478	236485	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_012466	TTTA	2	8	236666	236673	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_012466	AATA	2	8	239147	239154	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_012466	CTGA	2	8	245430	245437	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
142	NC_012466	GAAA	2	8	245512	245519	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_012466	CAAT	2	8	252497	252504	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_012466	CAAG	2	8	252741	252748	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
145	NC_012466	CTAA	2	8	254037	254044	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
146	NC_012466	AAAT	2	8	254205	254212	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_012466	AAAC	2	8	254218	254225	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
148	NC_012466	GAAG	2	8	256326	256333	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
149	NC_012466	CTTT	2	8	260864	260871	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
150	NC_012466	ATAA	2	8	267513	267520	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_012466	GATT	2	8	269812	269819	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
152	NC_012466	GCAG	2	8	270983	270990	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
153	NC_012466	CAAA	2	8	271003	271010	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
154	NC_012466	CAAA	2	8	271042	271049	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
155	NC_012466	CTTT	2	8	277563	277570	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
156	NC_012466	GGAA	2	8	279100	279107	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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158	NC_012466	AGGA	2	8	281105	281112	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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168	NC_012466	TTTA	2	8	324258	324265	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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171	NC_012466	ATTA	2	8	324594	324601	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
172	NC_012466	AGAA	2	8	324889	324896	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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