MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae JJA

Total Repeats: 7577

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_012466	TATC	2	8	1086681	1086688	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4002	NC_012466	CTT	2	6	1088894	1088899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4003	NC_012466	TCT	2	6	1088959	1088964	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4004	NC_012466	T	6	6	1088976	1088981	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_012466	TCAA	2	8	1089002	1089009	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4006	NC_012466	TCT	2	6	1089011	1089016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4007	NC_012466	CTG	2	6	1089063	1089068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4008	NC_012466	GTT	2	6	1089104	1089109	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_012466	TGGA	2	8	1089112	1089119	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4010	NC_012466	CAA	2	6	1089120	1089125	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4011	NC_012466	CTT	2	6	1089192	1089197	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4012	NC_012466	CAA	2	6	1089336	1089341	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4013	NC_012466	TAA	2	6	1089471	1089476	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4014	NC_012466	CAA	2	6	1089534	1089539	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4015	NC_012466	ATT	2	6	1089590	1089595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_012466	GA	3	6	1089663	1089668	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4017	NC_012466	TCAA	2	8	1089791	1089798	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4018	NC_012466	GCT	2	6	1089824	1089829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4019	NC_012466	TCC	2	6	1089836	1089841	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4020	NC_012466	GTT	2	6	1089863	1089868	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4021	NC_012466	AGC	2	6	1089931	1089936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4022	NC_012466	ACC	2	6	1090021	1090026	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4023	NC_012466	TGT	2	6	1090039	1090044	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4024	NC_012466	TCA	2	6	1090115	1090120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4026	NC_012466	TGT	2	6	1090132	1090137	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4027	NC_012466	TAG	2	6	1090164	1090169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4028	NC_012466	TTA	2	6	1090251	1090256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4029	NC_012466	TGAAAA	2	12	1090339	1090350	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4030	NC_012466	A	6	6	1090347	1090352	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4031	NC_012466	T	6	6	1091192	1091197	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_012466	TAG	2	6	1091261	1091266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_012466	A	6	6	1091382	1091387	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4034	NC_012466	AGTA	2	8	1094655	1094662	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4035	NC_012466	ACA	2	6	1094663	1094668	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4036	NC_012466	T	6	6	1094753	1094758	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4037	NC_012466	TAA	2	6	1094796	1094801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4038	NC_012466	ATC	2	6	1095834	1095839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4039	NC_012466	GTT	2	6	1095845	1095850	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4040	NC_012466	T	7	7	1095849	1095855	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_012466	T	7	7	1095861	1095867	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_012466	TAT	2	6	1095871	1095876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_012466	GTTGAA	2	12	1095882	1095893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_012466	GTT	2	6	1095917	1095922	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4045	NC_012466	ATTTT	2	10	1095958	1095967	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4046	NC_012466	ATA	2	6	1096008	1096013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4047	NC_012466	ACTT	2	8	1096033	1096040	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4048	NC_012466	T	6	6	1096086	1096091	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4049	NC_012466	TTC	2	6	1096120	1096125	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4050	NC_012466	T	6	6	1096128	1096133	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4051	NC_012466	TTA	2	6	1096883	1096888	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4052	NC_012466	T	6	6	1097413	1097418	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4053	NC_012466	TTCT	2	8	1097484	1097491	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4054	NC_012466	CTA	2	6	1100364	1100369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4055	NC_012466	A	6	6	1100377	1100382	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4056	NC_012466	AGA	2	6	1100388	1100393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4057	NC_012466	ATAG	2	8	1101637	1101644	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4058	NC_012466	TA	3	6	1101645	1101650	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4059	NC_012466	TCTA	2	8	1101656	1101663	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4060	NC_012466	TGA	2	6	1101828	1101833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4061	NC_012466	A	6	6	1101851	1101856	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_012466	ATT	2	6	1101868	1101873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_012466	CT	3	6	1103645	1103650	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4064	NC_012466	TTAC	2	8	1103771	1103778	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4065	NC_012466	CTA	2	6	1105772	1105777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4066	NC_012466	A	6	6	1105790	1105795	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4067	NC_012466	TTA	2	6	1107421	1107426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4068	NC_012466	TAC	2	6	1107439	1107444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4069	NC_012466	T	6	6	1107464	1107469	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4071	NC_012466	GAA	2	6	1110545	1110550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4075	NC_012466	TAT	3	9	1111549	1111557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4077	NC_012466	T	7	7	1111639	1111645	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4078	NC_012466	GA	3	6	1111663	1111668	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4079	NC_012466	TAT	2	6	1123431	1123436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4080	NC_012466	A	7	7	1123440	1123446	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4081	NC_012466	A	6	6	1123543	1123548	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4082	NC_012466	TAT	2	6	1123662	1123667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4083	NC_012466	TAA	2	6	1123683	1123688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4084	NC_012466	T	6	6	1123693	1123698	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4086	NC_012466	TAT	2	6	1124778	1124783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4087	NC_012466	T	9	9	1124808	1124816	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4088	NC_012466	AT	3	6	1124827	1124832	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4089	NC_012466	AAAG	2	8	1124861	1124868	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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4091	NC_012466	TTA	2	6	1128156	1128161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4092	NC_012466	AT	3	6	1128164	1128169	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4093	NC_012466	AGAAAA	2	12	1128196	1128207	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4094	NC_012466	CTT	2	6	1128263	1128268	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4095	NC_012466	T	7	7	1128267	1128273	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4096	NC_012466	TAG	2	6	1128861	1128866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4098	NC_012466	A	6	6	1128977	1128982	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4099	NC_012466	T	6	6	1129056	1129061	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4100	NC_012466	AC	3	6	1130742	1130747	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4101	NC_012466	TA	3	6	1130821	1130826	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4102	NC_012466	CTG	2	6	1130865	1130870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4103	NC_012466	CCAT	2	8	1131059	1131066	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4104	NC_012466	GGCTA	2	10	1131070	1131079	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
4105	NC_012466	ATC	2	6	1131124	1131129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4106	NC_012466	CTT	2	6	1131205	1131210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4107	NC_012466	TC	3	6	1131278	1131283	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4108	NC_012466	CAA	2	6	1131291	1131296	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4109	NC_012466	ACCA	2	8	1131337	1131344	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4110	NC_012466	TGA	2	6	1131354	1131359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4112	NC_012466	ACG	2	6	1131434	1131439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4114	NC_012466	TTC	2	6	1131568	1131573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4116	NC_012466	GCTC	2	8	1131590	1131597	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4117	NC_012466	CAG	2	6	1131645	1131650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4118	NC_012466	TCA	2	6	1131680	1131685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4119	NC_012466	GAT	2	6	1131703	1131708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_012466	TTC	2	6	1131797	1131802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4121	NC_012466	ATT	2	6	1131839	1131844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_012466	T	6	6	1132549	1132554	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4123	NC_012466	TAT	2	6	1133215	1133220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4124	NC_012466	ACT	2	6	1133265	1133270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4125	NC_012466	TCT	3	9	1133659	1133667	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4126	NC_012466	ATG	2	6	1133681	1133686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4127	NC_012466	CTC	2	6	1133737	1133742	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4128	NC_012466	TAA	2	6	1135851	1135856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4129	NC_012466	T	6	6	1135877	1135882	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4130	NC_012466	CTA	2	6	1135902	1135907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4131	NC_012466	AGA	2	6	1135912	1135917	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4133	NC_012466	GA	3	6	1135971	1135976	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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4253	NC_012466	A	8	8	1172582	1172589	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4260	NC_012466	TACT	2	8	1174188	1174195	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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4264	NC_012466	A	6	6	1174481	1174486	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4265	NC_012466	ACT	2	6	1175142	1175147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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