MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae JJA

Total Repeats: 7577

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_012466	ATTGAG	2	12	121619	121630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
502	NC_012466	TTGG	2	8	121754	121761	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
503	NC_012466	CTG	2	6	121805	121810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
504	NC_012466	GA	3	6	121846	121851	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
505	NC_012466	CCAA	2	8	122130	122137	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
506	NC_012466	A	6	6	122155	122160	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_012466	AG	3	6	122183	122188	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
508	NC_012466	AT	3	6	123660	123665	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_012466	A	7	7	123675	123681	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_012466	TAG	2	6	123762	123767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
511	NC_012466	AC	3	6	123771	123776	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
512	NC_012466	ATA	2	6	123843	123848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_012466	A	6	6	124762	124767	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_012466	AACA	2	8	124771	124778	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
515	NC_012466	A	6	6	124823	124828	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_012466	AAAT	2	8	124837	124844	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_012466	A	6	6	124850	124855	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_012466	TAA	2	6	124880	124885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_012466	GTAG	2	8	124896	124903	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
520	NC_012466	A	7	7	124933	124939	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_012466	GTAT	2	8	124954	124961	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
522	NC_012466	GTT	2	6	125029	125034	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
523	NC_012466	AGG	2	6	125037	125042	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
524	NC_012466	CTG	2	6	125063	125068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
525	NC_012466	TAC	2	6	125069	125074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_012466	AAAT	2	8	125117	125124	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_012466	ACT	2	6	125135	125140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
528	NC_012466	GAC	2	6	129323	129328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
529	NC_012466	TAA	2	6	129362	129367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_012466	AGG	2	6	130648	130653	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
531	NC_012466	TAA	2	6	131850	131855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_012466	ATTT	2	8	131995	132002	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_012466	AT	4	8	132031	132038	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_012466	GCT	2	6	132047	132052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
535	NC_012466	TAAAA	2	10	132157	132166	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_012466	T	7	7	132207	132213	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_012466	TTG	2	6	132236	132241	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
538	NC_012466	TA	3	6	132253	132258	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
539	NC_012466	AT	4	8	132284	132291	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_012466	AT	3	6	132478	132483	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_012466	A	7	7	132493	132499	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_012466	TAG	2	6	132538	132543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
543	NC_012466	AATT	2	8	132589	132596	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_012466	CTA	2	6	132635	132640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
545	NC_012466	TAG	2	6	132687	132692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
546	NC_012466	TAA	2	6	132746	132751	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_012466	AGT	2	6	132801	132806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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549	NC_012466	T	6	6	133385	133390	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_012466	GTT	2	6	133391	133396	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
551	NC_012466	A	6	6	133407	133412	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_012466	CT	3	6	133417	133422	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
553	NC_012466	GAAG	2	8	133447	133454	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
554	NC_012466	ATG	2	6	133455	133460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
555	NC_012466	AGT	2	6	133493	133498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
556	NC_012466	TAA	2	6	133542	133547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_012466	G	6	6	133581	133586	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
558	NC_012466	A	7	7	133653	133659	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_012466	AGA	2	6	133736	133741	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
560	NC_012466	AGA	2	6	133774	133779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
561	NC_012466	AAGCAA	2	12	133789	133800	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
562	NC_012466	AAGA	2	8	133815	133822	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
563	NC_012466	AGA	2	6	133847	133852	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
564	NC_012466	AGA	2	6	133858	133863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
565	NC_012466	ATG	2	6	133867	133872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
566	NC_012466	AGA	2	6	133879	133884	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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568	NC_012466	AGA	2	6	133910	133915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
569	NC_012466	GCT	2	6	133917	133922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
570	NC_012466	GAT	2	6	133932	133937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
571	NC_012466	AAG	2	6	133984	133989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
572	NC_012466	A	7	7	133990	133996	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_012466	A	6	6	134025	134030	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_012466	AGCAGA	2	12	134033	134044	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
575	NC_012466	A	7	7	134046	134052	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
576	NC_012466	GAG	2	6	134058	134063	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
577	NC_012466	ACTAA	2	10	134067	134076	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
578	NC_012466	A	6	6	134151	134156	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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580	NC_012466	AGA	2	6	134174	134179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
581	NC_012466	GTA	2	6	134220	134225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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583	NC_012466	TTGAAA	2	12	134257	134268	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
584	NC_012466	AAG	2	6	134299	134304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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589	NC_012466	A	7	7	134441	134447	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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593	NC_012466	TGA	2	6	134549	134554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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602	NC_012466	GAT	2	6	134874	134879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
603	NC_012466	CTG	2	6	134881	134886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
604	NC_012466	CTA	2	6	134905	134910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
605	NC_012466	A	6	6	134910	134915	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
606	NC_012466	A	6	6	134926	134931	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
607	NC_012466	GAA	3	9	134982	134990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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610	NC_012466	CCAGCT	2	12	135054	135065	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
611	NC_012466	CCAGCT	2	12	135087	135098	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
612	NC_012466	AAC	2	6	135213	135218	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
613	NC_012466	TAC	2	6	135228	135233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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615	NC_012466	TAC	2	6	135411	135416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
616	NC_012466	TAC	2	6	135470	135475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
617	NC_012466	TAC	2	6	135530	135535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
618	NC_012466	TAC	2	6	135590	135595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
619	NC_012466	AAGC	2	8	135678	135685	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
620	NC_012466	ATTAA	2	10	135801	135810	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
621	NC_012466	A	7	7	135924	135930	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_012466	GTT	2	6	135974	135979	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
623	NC_012466	TTAT	2	8	135980	135987	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
624	NC_012466	TGAA	2	8	135998	136005	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
625	NC_012466	CAT	2	6	136027	136032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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627	NC_012466	ATG	2	6	137364	137369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
628	NC_012466	T	6	6	137395	137400	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_012466	CTT	2	6	137409	137414	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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631	NC_012466	CGT	2	6	139840	139845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
632	NC_012466	CTT	2	6	139849	139854	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
633	NC_012466	AAAG	2	8	140140	140147	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
634	NC_012466	ATT	2	6	142206	142211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
635	NC_012466	TAT	2	6	142308	142313	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
636	NC_012466	AGG	2	6	142371	142376	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
637	NC_012466	TTTGCT	2	12	142396	142407	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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