MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae JJA

Total Repeats: 7577

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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6002	NC_012466	AAT	2	6	1690379	1690384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6003	NC_012466	CAC	2	6	1690401	1690406	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6004	NC_012466	AACT	2	8	1690420	1690427	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6005	NC_012466	TCC	2	6	1690455	1690460	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6006	NC_012466	ATTT	2	8	1690529	1690536	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6007	NC_012466	TCT	2	6	1690611	1690616	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6008	NC_012466	CAAT	2	8	1690648	1690655	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6009	NC_012466	TCAA	2	8	1690736	1690743	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6010	NC_012466	ACT	2	6	1690877	1690882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6011	NC_012466	TAC	2	6	1690915	1690920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6012	NC_012466	A	6	6	1690950	1690955	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6013	NC_012466	ACC	2	6	1691277	1691282	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6014	NC_012466	CTT	2	6	1692367	1692372	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6015	NC_012466	TCT	2	6	1692609	1692614	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6016	NC_012466	AT	3	6	1692623	1692628	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6017	NC_012466	GTTG	2	8	1692630	1692637	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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6019	NC_012466	AATT	2	8	1692679	1692686	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6020	NC_012466	GTT	2	6	1692703	1692708	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6021	NC_012466	A	6	6	1692751	1692756	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6022	NC_012466	TC	3	6	1692860	1692865	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6023	NC_012466	ATG	2	6	1692922	1692927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6024	NC_012466	CTTA	2	8	1692943	1692950	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6025	NC_012466	GAA	2	6	1692951	1692956	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6033	NC_012466	AAG	2	6	1693492	1693497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6037	NC_012466	TTAA	2	8	1693579	1693586	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6041	NC_012466	GCTA	2	8	1693680	1693687	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6042	NC_012466	ATT	2	6	1693701	1693706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6043	NC_012466	TTG	2	6	1693759	1693764	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6044	NC_012466	CT	3	6	1693765	1693770	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6045	NC_012466	TTG	2	6	1693773	1693778	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6046	NC_012466	TATT	2	8	1693779	1693786	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6051	NC_012466	TGAT	2	8	1703564	1703571	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6052	NC_012466	GAAC	2	8	1703595	1703602	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6053	NC_012466	CT	4	8	1703633	1703640	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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6057	NC_012466	T	7	7	1708117	1708123	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6065	NC_012466	A	7	7	1712041	1712047	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6071	NC_012466	T	9	9	1718689	1718697	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6072	NC_012466	AT	3	6	1718700	1718705	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6073	NC_012466	ACGG	2	8	1718804	1718811	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6074	NC_012466	AAATT	2	10	1718833	1718842	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
6075	NC_012466	AT	3	6	1718943	1718948	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6093	NC_012466	ATA	2	6	1729667	1729672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6100	NC_012466	A	6	6	1731318	1731323	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6101	NC_012466	ACA	2	6	1731374	1731379	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6102	NC_012466	CCG	2	6	1731458	1731463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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6109	NC_012466	GCG	2	6	1731790	1731795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6110	NC_012466	CT	3	6	1732125	1732130	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6111	NC_012466	ACG	2	6	1732137	1732142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6114	NC_012466	AT	3	6	1732399	1732404	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6118	NC_012466	ATC	2	6	1732921	1732926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6119	NC_012466	TC	3	6	1732925	1732930	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6120	NC_012466	AT	3	6	1732944	1732949	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6121	NC_012466	TCCCT	2	10	1733007	1733016	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
6122	NC_012466	ACG	2	6	1733149	1733154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6126	NC_012466	GTA	2	6	1733568	1733573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6127	NC_012466	CCTA	2	8	1733620	1733627	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6128	NC_012466	TC	3	6	1733740	1733745	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6129	NC_012466	GCC	2	6	1733837	1733842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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6131	NC_012466	CAT	2	6	1733928	1733933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6398	NC_012466	CCAGTC	2	12	1790429	1790440	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
6399	NC_012466	CAA	2	6	1790445	1790450	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6400	NC_012466	CCA	2	6	1790514	1790519	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6401	NC_012466	CTG	2	6	1790529	1790534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6402	NC_012466	CGT	2	6	1790538	1790543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6403	NC_012466	GACCT	2	10	1790695	1790704	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
6404	NC_012466	TCA	2	6	1790714	1790719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6422	NC_012466	AAG	2	6	1791506	1791511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6423	NC_012466	AAGA	2	8	1791514	1791521	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6424	NC_012466	CAT	3	9	1791529	1791537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6427	NC_012466	CTA	2	6	1791686	1791691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6432	NC_012466	A	6	6	1792036	1792041	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6433	NC_012466	CCCA	2	8	1792062	1792069	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
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6441	NC_012466	TTA	2	6	1793080	1793085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6466	NC_012466	A	6	6	1797905	1797910	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6467	NC_012466	ATA	2	6	1797914	1797919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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