MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Sulfurihydrogenibium azorense Az-Fu1 chromosome

Total Repeats: 47

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012438	CATCTT	2	12	5229	5240	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_012438	TTAAAT	2	12	33552	33563	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012438	GTGATG	2	12	79121	79132	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012438	GGAGGG	2	12	142125	142136	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012438	ATTTTT	2	12	236029	236040	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012438	TCAAAA	2	12	237451	237462	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_012438	ATTTTA	2	12	367540	367551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012438	ATTTTA	2	12	368528	368539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012438	AAGAAA	2	12	393966	393977	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012438	TTTTTA	2	12	412855	412866	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012438	ATTTAA	2	12	423657	423668	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012438	CTATGA	2	12	440464	440475	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_012438	GAGTTA	2	12	526314	526325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012438	TTATCT	2	12	529453	529464	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_012438	TAAATT	2	12	545596	545607	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012438	AATTAT	2	12	553392	553403	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_012438	TAATTA	2	12	589267	589278	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012438	TCTCAA	2	12	623171	623182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_012438	TTACAA	2	12	628462	628473	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_012438	ACATTT	2	12	630383	630394	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_012438	CTTTTT	2	12	641678	641689	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_012438	TTTATT	2	12	703441	703452	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012438	TTTTAA	2	12	703638	703649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_012438	ATTTGC	2	12	721044	721055	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_012438	TAAAAA	2	12	757165	757176	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_012438	TAAAAA	2	12	761263	761274	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_012438	TTTAAT	2	12	767636	767647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_012438	TCCTAT	2	12	769820	769831	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_012438	TAATTA	2	12	788500	788511	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_012438	TTTATC	2	12	799629	799640	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_012438	ATATTT	2	12	981316	981327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012438	TTTAAT	2	12	989687	989698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012438	GGCAAG	2	12	1010212	1010223	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_012438	TTTGAT	2	12	1013810	1013821	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_012438	AATTAA	2	12	1048163	1048174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_012438	ACCTTC	2	12	1083009	1083020	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_012438	TGTAGA	2	12	1083475	1083486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012438	TGAAGT	2	12	1158365	1158376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_012438	TCCCCC	2	12	1206269	1206280	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
40	NC_012438	TATAAA	2	12	1301047	1301058	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_012438	AATTAA	2	12	1363114	1363125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_012438	TCTTTT	2	12	1453530	1453541	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_012438	GATTTT	2	12	1486305	1486316	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_012438	CCTGCG	2	12	1522552	1522563	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
45	NC_012438	AAGTAT	2	12	1535411	1535422	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_012438	ATAAAA	2	12	1583214	1583225	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_012438	CTTTTT	2	12	1618027	1618038	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.