MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Sulfurihydrogenibium azorense Az-Fu1 chromosome

Total Repeats: 267

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012438	TGTC	2	8	15	22	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_012438	GTAT	2	8	39	46	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012438	TATG	2	8	247	254	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012438	ATCT	2	8	638	645	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_012438	CTAC	2	8	1508	1515	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_012438	CCGA	2	8	1586	1593	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7	NC_012438	TTAC	2	8	4425	4432	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_012438	CAAA	2	8	8034	8041	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_012438	CCTG	2	8	18527	18534	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10	NC_012438	TCTA	2	8	60333	60340	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_012438	TTCT	2	8	60344	60351	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_012438	TAGA	2	8	68479	68486	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012438	AATT	2	8	73278	73285	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012438	ACTA	2	8	84061	84068	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_012438	ATTT	2	8	94260	94267	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012438	CTAT	2	8	96224	96231	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_012438	ATTT	2	8	102056	102063	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012438	GCCT	2	8	105695	105702	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
19	NC_012438	ACTA	2	8	113492	113499	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_012438	TTTA	2	8	115826	115833	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_012438	ATTT	2	8	126539	126546	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012438	ATAA	2	8	138278	138285	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012438	CCAG	2	8	142113	142120	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
24	NC_012438	TATT	2	8	150278	150285	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_012438	TAAT	2	8	153182	153189	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_012438	ATAA	3	12	153453	153464	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_012438	TTTA	2	8	161979	161986	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_012438	CAAA	2	8	162011	162018	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_012438	AATT	2	8	183842	183849	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_012438	TAAA	2	8	203426	203433	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_012438	ATTA	2	8	228811	228818	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012438	TTAT	2	8	229915	229922	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012438	TTTA	2	8	233347	233354	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_012438	AACT	2	8	235401	235408	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_012438	AATG	2	8	236055	236062	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_012438	AAAC	2	8	236159	236166	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_012438	ACCA	2	8	236184	236191	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_012438	ATCT	2	8	237419	237426	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_012438	TAAA	2	8	245271	245278	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_012438	CTTT	2	8	262398	262405	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_012438	CTTT	2	8	282532	282539	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_012438	TTAT	2	8	288740	288747	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_012438	GGCT	2	8	290547	290554	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
44	NC_012438	AATT	2	8	290646	290653	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_012438	CTTT	2	8	290939	290946	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_012438	GTAA	2	8	304789	304796	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_012438	ATTT	2	8	307906	307913	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_012438	AGTA	2	8	307976	307983	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_012438	GTAA	2	8	324367	324374	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_012438	ACTA	2	8	332942	332949	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_012438	TGAG	2	8	367561	367568	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_012438	TTGT	2	8	368604	368611	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_012438	TAAA	2	8	368652	368659	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_012438	TTAT	2	8	369083	369090	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_012438	TTTC	2	8	370742	370749	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_012438	TGTA	2	8	374237	374244	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_012438	TATT	2	8	378046	378053	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_012438	TATC	2	8	388386	388393	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_012438	AATT	2	8	388529	388536	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_012438	ATCC	2	8	398844	398851	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_012438	TCCC	2	8	412847	412854	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
62	NC_012438	TTTG	2	8	412924	412931	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_012438	GGTG	2	8	419392	419399	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
64	NC_012438	AAAG	2	8	438164	438171	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_012438	AAGA	2	8	439280	439287	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_012438	TAAA	2	8	454660	454667	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_012438	TAAA	2	8	472192	472199	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_012438	TAAG	2	8	483475	483482	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_012438	TAAA	2	8	514259	514266	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_012438	TTTG	2	8	514292	514299	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_012438	TCAT	2	8	514876	514883	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_012438	TGTT	2	8	517778	517785	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_012438	CTGC	2	8	518784	518791	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
74	NC_012438	TTAT	2	8	525166	525173	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_012438	ACCT	2	8	526291	526298	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_012438	GAAA	2	8	536822	536829	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_012438	TTAT	2	8	536881	536888	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_012438	GCGG	2	8	545654	545661	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
79	NC_012438	TACA	2	8	546075	546082	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_012438	AAAT	2	8	553472	553479	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_012438	GGAG	2	8	553524	553531	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
82	NC_012438	AAAG	2	8	565385	565392	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_012438	CTAC	2	8	568239	568246	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_012438	ATCC	2	8	568263	568270	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_012438	TTTA	2	8	568307	568314	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_012438	TTGA	2	8	570582	570589	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_012438	ATGT	2	8	588518	588525	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_012438	AATG	2	8	617916	617923	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_012438	TTAT	2	8	629684	629691	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_012438	TAAA	2	8	630395	630402	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_012438	ATTT	2	8	637746	637753	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_012438	AAGC	2	8	641121	641128	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
93	NC_012438	TTTA	2	8	641703	641710	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_012438	CAAG	2	8	674081	674088	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
95	NC_012438	AATA	2	8	674128	674135	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_012438	CATT	2	8	682400	682407	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_012438	ATGA	2	8	685173	685180	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_012438	TAAT	2	8	694907	694914	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_012438	ATTT	2	8	698658	698665	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_012438	ATTA	3	12	698743	698754	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_012438	AATA	2	8	702703	702710	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_012438	GATA	2	8	703607	703614	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_012438	TGAG	2	8	704926	704933	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_012438	GCCT	2	8	710823	710830	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
105	NC_012438	TAAA	2	8	713366	713373	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_012438	AGGT	2	8	744797	744804	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_012438	CCCG	2	8	756196	756203	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
108	NC_012438	CTTT	2	8	756728	756735	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
109	NC_012438	AAAG	2	8	757036	757043	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_012438	GCTT	2	8	757108	757115	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
111	NC_012438	AAGC	2	8	757116	757123	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
112	NC_012438	TAAG	2	8	761255	761262	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_012438	TATT	2	8	763849	763856	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_012438	ATAA	2	8	764778	764785	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_012438	CAAC	2	8	769999	770006	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_012438	TTTC	2	8	776188	776195	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_012438	TAAT	2	8	778987	778994	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_012438	TATT	2	8	779325	779332	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_012438	GTAT	2	8	788488	788495	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_012438	TAAT	2	8	788910	788917	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_012438	TTTA	2	8	790100	790107	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_012438	ATTG	2	8	790145	790152	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_012438	TATC	2	8	790433	790440	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_012438	ATCT	2	8	799429	799436	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
125	NC_012438	GTTT	2	8	799541	799548	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_012438	ATTA	2	8	799604	799611	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_012438	ATTT	2	8	799913	799920	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_012438	TCAC	2	8	812549	812556	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_012438	AAGA	2	8	826820	826827	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_012438	ATGG	2	8	827183	827190	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_012438	GATG	2	8	827752	827759	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_012438	GTAG	2	8	828762	828769	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_012438	AGCG	2	8	828867	828874	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
134	NC_012438	TTCC	2	8	829694	829701	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_012438	CCAA	2	8	829751	829758	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_012438	TCCC	2	8	831887	831894	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
137	NC_012438	TTAA	2	8	862799	862806	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_012438	TTAA	2	8	864867	864874	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_012438	GTTA	2	8	864899	864906	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_012438	ACTA	2	8	864913	864920	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
141	NC_012438	CATT	2	8	916754	916761	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_012438	TTAT	2	8	919306	919313	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_012438	ATTT	2	8	919453	919460	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_012438	AATC	2	8	919578	919585	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
145	NC_012438	GATA	2	8	921134	921141	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
146	NC_012438	AGGC	2	8	928309	928316	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
147	NC_012438	GCCT	2	8	928322	928329	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
148	NC_012438	ACCT	2	8	929864	929871	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_012438	TGTA	2	8	945083	945090	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
150	NC_012438	ATTA	2	8	962698	962705	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_012438	TAGG	2	8	962727	962734	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
152	NC_012438	AAAG	2	8	962840	962847	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.