MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus uberis 0140J chromosome

Total Repeats: 419

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012004	AT	3	6	18714	18719	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012004	CT	3	6	18745	18750	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_012004	AC	3	6	19235	19240	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_012004	AC	3	6	19404	19409	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_012004	AG	3	6	20245	20250	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012004	CT	3	6	20359	20364	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_012004	TC	3	6	20737	20742	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_012004	TG	3	6	21123	21128	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012004	GA	3	6	21274	21279	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012004	GA	3	6	21570	21575	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012004	CT	3	6	21687	21692	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_012004	GA	3	6	21894	21899	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012004	GA	3	6	22709	22714	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012004	CT	3	6	38497	38502	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_012004	TA	3	6	42758	42763	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012004	GA	3	6	58754	58759	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_012004	TG	3	6	60555	60560	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012004	AT	3	6	81244	81249	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012004	TA	3	6	84226	84231	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_012004	TA	3	6	86277	86282	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_012004	AG	3	6	87858	87863	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012004	AT	3	6	88952	88957	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012004	CT	3	6	88983	88988	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_012004	AC	3	6	89473	89478	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_012004	AC	3	6	89642	89647	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_012004	AG	3	6	90483	90488	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_012004	CT	3	6	90597	90602	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_012004	TC	3	6	90975	90980	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_012004	TG	3	6	91361	91366	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_012004	GA	3	6	91512	91517	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_012004	GA	3	6	91808	91813	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012004	CT	3	6	91925	91930	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_012004	GA	3	6	92132	92137	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_012004	GA	3	6	92947	92952	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_012004	TA	3	6	93710	93715	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_012004	CT	3	6	94072	94077	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_012004	AT	3	6	95649	95654	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012004	AT	3	6	95758	95763	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_012004	AG	3	6	96804	96809	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_012004	AT	3	6	97032	97037	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_012004	AG	3	6	127561	127566	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_012004	CT	3	6	138454	138459	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_012004	TA	3	6	146611	146616	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_012004	AT	3	6	146761	146766	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_012004	GA	3	6	160295	160300	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_012004	AG	3	6	160508	160513	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_012004	GC	3	6	160695	160700	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_012004	GA	3	6	162082	162087	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_012004	CA	3	6	162096	162101	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_012004	TG	3	6	165352	165357	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_012004	AT	3	6	165422	165427	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_012004	TA	3	6	167173	167178	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_012004	GT	3	6	167705	167710	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_012004	CA	3	6	167952	167957	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_012004	AC	3	6	168077	168082	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_012004	GA	3	6	169807	169812	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_012004	CT	3	6	175219	175224	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_012004	TA	3	6	177895	177900	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_012004	AT	4	8	179482	179489	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_012004	TA	3	6	196639	196644	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_012004	TA	4	8	211728	211735	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_012004	CA	3	6	212558	212563	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_012004	TA	4	8	213711	213718	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_012004	TA	3	6	213876	213881	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_012004	TA	3	6	213911	213916	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_012004	CT	3	6	215163	215168	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_012004	TA	3	6	215307	215312	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_012004	TA	3	6	215336	215341	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_012004	AT	3	6	215350	215355	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_012004	TA	3	6	215376	215381	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_012004	CA	3	6	215440	215445	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_012004	TA	3	6	218948	218953	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_012004	AT	3	6	239930	239935	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_012004	AT	3	6	239971	239976	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_012004	TA	3	6	254665	254670	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_012004	AG	5	10	256872	256881	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_012004	CT	3	6	259060	259065	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_012004	AC	3	6	262119	262124	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_012004	TA	4	8	262577	262584	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_012004	TA	3	6	262767	262772	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_012004	GA	3	6	275367	275372	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_012004	TA	3	6	275548	275553	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_012004	AT	3	6	276196	276201	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_012004	AT	3	6	276769	276774	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_012004	AT	4	8	281359	281366	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_012004	TC	3	6	286448	286453	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_012004	CA	3	6	289090	289095	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_012004	AT	3	6	294491	294496	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_012004	TA	3	6	301525	301530	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_012004	GA	3	6	303062	303067	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_012004	TG	3	6	303134	303139	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_012004	AT	3	6	309816	309821	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_012004	CT	3	6	309847	309852	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_012004	AC	3	6	310337	310342	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_012004	AC	3	6	310506	310511	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_012004	AG	3	6	311347	311352	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_012004	CT	3	6	311461	311466	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_012004	TC	3	6	311839	311844	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_012004	TG	3	6	312225	312230	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_012004	GA	3	6	312376	312381	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_012004	GA	3	6	312672	312677	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_012004	CT	3	6	312789	312794	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_012004	GA	3	6	312996	313001	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_012004	GA	3	6	313811	313816	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_012004	AG	3	6	321036	321041	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_012004	TG	3	6	322642	322647	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_012004	AT	3	6	326206	326211	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_012004	CT	3	6	326304	326309	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_012004	AT	3	6	333840	333845	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_012004	TA	3	6	338967	338972	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_012004	AG	3	6	339388	339393	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_012004	TC	3	6	339405	339410	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_012004	AT	3	6	350396	350401	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_012004	CT	3	6	350427	350432	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_012004	AC	3	6	350917	350922	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_012004	AC	3	6	351086	351091	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_012004	AG	3	6	351927	351932	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_012004	CT	3	6	352041	352046	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_012004	TC	3	6	352419	352424	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_012004	TG	3	6	352805	352810	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_012004	GA	3	6	352956	352961	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_012004	GA	3	6	353252	353257	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_012004	CT	3	6	353369	353374	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_012004	GA	3	6	353576	353581	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_012004	GA	3	6	354391	354396	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_012004	TA	4	8	355779	355786	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_012004	TA	3	6	362046	362051	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_012004	AT	3	6	363620	363625	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_012004	TA	3	6	374103	374108	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_012004	AT	3	6	378901	378906	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_012004	AG	3	6	392390	392395	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_012004	AG	3	6	397691	397696	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_012004	GA	3	6	404954	404959	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_012004	TA	3	6	424290	424295	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_012004	GA	4	8	424318	424325	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_012004	AT	3	6	441338	441343	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_012004	TA	3	6	441357	441362	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_012004	TC	4	8	449370	449377	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_012004	TG	3	6	449672	449677	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_012004	AT	3	6	457709	457714	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_012004	TA	3	6	457721	457726	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_012004	TA	3	6	457747	457752	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_012004	GA	3	6	460413	460418	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_012004	TA	3	6	460539	460544	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_012004	TA	3	6	465687	465692	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_012004	AT	3	6	465718	465723	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_012004	CA	3	6	465736	465741	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
148	NC_012004	TG	3	6	476937	476942	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
149	NC_012004	AT	3	6	477047	477052	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_012004	AT	3	6	481963	481968	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_012004	AT	3	6	482672	482677	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_012004	TA	3	6	484568	484573	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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154	NC_012004	GA	3	6	496580	496585	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.