MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Enteritidis str. P125109 chromosome

Total Repeats: 601

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011294	CCTTC	2	10	8438	8447	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
2	NC_011294	GAAAA	2	10	9825	9834	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011294	TCTTT	2	10	11087	11096	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_011294	GTGAT	2	10	14678	14687	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011294	TATTG	2	10	17342	17351	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011294	ATCGT	2	10	34675	34684	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
7	NC_011294	ATTTT	2	10	34719	34728	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011294	TTTTA	2	10	34980	34989	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011294	TAAAA	2	10	43945	43954	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011294	AGCGC	2	10	56988	56997	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
11	NC_011294	AAAAT	2	10	58706	58715	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011294	GGAAA	2	10	59493	59502	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011294	TTTGA	2	10	75008	75017	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011294	AAGCG	2	10	81268	81277	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
15	NC_011294	TAAAA	2	10	95332	95341	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011294	GCGCT	2	10	97492	97501	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
17	NC_011294	AGCGC	2	10	97559	97568	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
18	NC_011294	AAGCG	2	10	108866	108875	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
19	NC_011294	TAATT	2	10	116092	116101	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011294	ATTTT	2	10	116118	116127	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011294	AAATG	2	10	117411	117420	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011294	TAGTG	2	10	126172	126181	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011294	CCCAA	2	10	137864	137873	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
24	NC_011294	TTGTT	2	10	139211	139220	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011294	CGCGG	2	10	158348	158357	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
26	NC_011294	TTTTA	2	10	191268	191277	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011294	TATTG	2	10	198200	198209	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011294	GCGCT	2	10	214176	214185	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
29	NC_011294	CGCGT	2	10	214228	214237	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
30	NC_011294	CTGTC	2	10	231678	231687	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
31	NC_011294	ATATA	2	10	232389	232398	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011294	TGCTC	2	10	247877	247886	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
33	NC_011294	GTCTG	2	10	262124	262133	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
34	NC_011294	GCGCT	2	10	284980	284989	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
35	NC_011294	TGTGT	2	10	291371	291380	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011294	AATGA	2	10	293082	293091	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011294	GCCGC	2	10	294034	294043	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
38	NC_011294	AGCGA	2	10	296824	296833	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
39	NC_011294	TGGGG	2	10	296930	296939	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011294	AAGGA	2	10	299389	299398	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011294	AAATT	2	10	301792	301801	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011294	ACAAA	2	10	303079	303088	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
43	NC_011294	AATGC	2	10	312458	312467	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
44	NC_011294	TATGT	2	10	312542	312551	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011294	GGCGG	2	10	313744	313753	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
46	NC_011294	CTGGA	2	10	313943	313952	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
47	NC_011294	ACGAC	2	10	315459	315468	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
48	NC_011294	GTTCG	2	10	316378	316387	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
49	NC_011294	TATTC	2	10	321501	321510	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
50	NC_011294	TCTGT	2	10	327707	327716	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
51	NC_011294	CATGA	2	10	349509	349518	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
52	NC_011294	AAAAT	2	10	350598	350607	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011294	AATGT	2	10	357517	357526	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011294	TGAAA	2	10	357802	357811	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011294	GATGC	2	10	369467	369476	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
56	NC_011294	CGCTT	2	10	380954	380963	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
57	NC_011294	CCCGT	2	10	387674	387683	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
58	NC_011294	CGTTT	2	10	388001	388010	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
59	NC_011294	CTCTT	2	10	394758	394767	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
60	NC_011294	TTTTC	2	10	397124	397133	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
61	NC_011294	CTTTG	2	10	397231	397240	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
62	NC_011294	TACGG	2	10	398238	398247	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
63	NC_011294	TGTTT	2	10	404241	404250	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011294	GCTAA	2	10	414937	414946	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
65	NC_011294	ACAAT	2	10	421093	421102	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
66	NC_011294	TTAAT	2	10	421959	421968	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011294	AACGC	2	10	438088	438097	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
68	NC_011294	CTTTT	2	10	451373	451382	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
69	NC_011294	GCGCC	2	10	452954	452963	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
70	NC_011294	ACGAT	2	10	462677	462686	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
71	NC_011294	GCAAC	2	10	467166	467175	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
72	NC_011294	TTTGC	2	10	469438	469447	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
73	NC_011294	GTTTT	2	10	480761	480770	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011294	ACTAA	2	10	484891	484900	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
75	NC_011294	GAAGA	2	10	487465	487474	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011294	ATGCG	2	10	487898	487907	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
77	NC_011294	GCGCT	2	10	501572	501581	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
78	NC_011294	CAGGT	2	10	503835	503844	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
79	NC_011294	TGTTA	2	10	505693	505702	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011294	TTCAA	2	10	519012	519021	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
81	NC_011294	TTTAT	2	10	561851	561860	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011294	AAAAT	2	10	570582	570591	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011294	AGGGA	2	10	584173	584182	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011294	CTTCA	2	10	593024	593033	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
85	NC_011294	CTTTT	2	10	603520	603529	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
86	NC_011294	GTCGC	2	10	610644	610653	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
87	NC_011294	TGCGG	2	10	610839	610848	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
88	NC_011294	TGTAA	2	10	633022	633031	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011294	TTGAT	2	10	642234	642243	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011294	CATTT	2	10	643033	643042	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
91	NC_011294	TTATT	2	10	663831	663840	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011294	TTTGT	2	10	663857	663866	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011294	TTCAA	2	10	667736	667745	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
94	NC_011294	ATAAG	2	10	668965	668974	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011294	GCATA	2	10	683629	683638	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
96	NC_011294	AAACG	2	10	696263	696272	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
97	NC_011294	AGTAA	2	10	696544	696553	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_011294	GAAGC	2	10	698411	698420	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
99	NC_011294	GTCCC	2	10	700744	700753	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
100	NC_011294	GGCGG	2	10	715969	715978	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
101	NC_011294	GCGCT	2	10	733521	733530	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
102	NC_011294	AATAA	2	10	755262	755271	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_011294	AGCGC	2	10	760677	760686	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
104	NC_011294	TAAAA	2	10	768297	768306	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011294	GGCGA	2	10	778128	778137	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
106	NC_011294	GGCGA	2	10	778416	778425	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
107	NC_011294	TGCGC	2	10	779176	779185	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
108	NC_011294	TGGCA	2	10	787923	787932	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
109	NC_011294	GTTTG	2	10	788913	788922	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
110	NC_011294	GCGCT	2	10	795437	795446	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
111	NC_011294	TATGG	2	10	800764	800773	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011294	ATTCT	2	10	813984	813993	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
113	NC_011294	GGCGC	2	10	817337	817346	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
114	NC_011294	AATAA	2	10	826186	826195	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011294	AAATG	2	10	853784	853793	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_011294	ACCGC	2	10	861043	861052	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
117	NC_011294	CAGGG	2	10	883777	883786	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
118	NC_011294	ATTTT	2	10	884907	884916	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_011294	GTCAG	2	10	891993	892002	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
120	NC_011294	ACGCG	2	10	905291	905300	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
121	NC_011294	CAAAT	2	10	913254	913263	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
122	NC_011294	AGCGC	2	10	917747	917756	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
123	NC_011294	AGGCG	2	10	938311	938320	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
124	NC_011294	CCCTA	2	10	960312	960321	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
125	NC_011294	AAATC	2	10	964650	964659	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
126	NC_011294	TTGCT	2	10	965997	966006	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
127	NC_011294	AAAAT	2	10	966009	966018	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_011294	GAGTT	2	10	977777	977786	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
129	NC_011294	TTTTC	2	10	990686	990695	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
130	NC_011294	TTAGG	2	10	1000015	1000024	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
131	NC_011294	TTTGA	2	10	1006284	1006293	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
132	NC_011294	CTGGA	2	10	1014599	1014608	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
133	NC_011294	TATTG	2	10	1021279	1021288	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
134	NC_011294	TTTTC	2	10	1035453	1035462	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
135	NC_011294	TTATT	2	10	1036293	1036302	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_011294	TTCTT	2	10	1038226	1038235	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
137	NC_011294	AGTCA	2	10	1055218	1055227	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
138	NC_011294	ATCAC	2	10	1065955	1065964	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
139	NC_011294	TACTT	2	10	1065968	1065977	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
140	NC_011294	GCGCT	2	10	1070084	1070093	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
141	NC_011294	AGCGC	2	10	1071826	1071835	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
142	NC_011294	CAGAG	2	10	1094077	1094086	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
143	NC_011294	ACGAT	2	10	1095881	1095890	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
144	NC_011294	TTTTC	2	10	1096130	1096139	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
145	NC_011294	GCGCT	2	10	1101938	1101947	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
146	NC_011294	CCAGA	2	10	1107679	1107688	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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282	NC_011294	TGGGT	2	10	2053924	2053933	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
283	NC_011294	CGTTT	2	10	2055790	2055799	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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286	NC_011294	TTATT	2	10	2070037	2070046	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
287	NC_011294	TTTAA	2	10	2070255	2070264	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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292	NC_011294	TATTT	2	10	2080002	2080011	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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461	NC_011294	GGTCA	2	10	3696964	3696973	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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