MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Enteritidis str. P125109 chromosome

Total Repeats: 1801

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011294	CTGT	2	8	8430	8437	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_011294	ATTT	2	8	11134	11141	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011294	TGTT	2	8	11148	11155	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011294	TTAT	2	8	23031	23038	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011294	CCAG	2	8	33103	33110	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6	NC_011294	TGAT	2	8	34789	34796	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011294	ATTA	2	8	38522	38529	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011294	AATT	2	8	39802	39809	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011294	TGAC	2	8	45796	45803	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_011294	TACC	2	8	48075	48082	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_011294	AGTA	2	8	51691	51698	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011294	ATCA	2	8	51731	51738	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_011294	GAAA	2	8	51851	51858	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011294	AGGG	2	8	51884	51891	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011294	TGGA	2	8	58748	58755	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011294	CCTG	2	8	58784	58791	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
17	NC_011294	GATT	2	8	59146	59153	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011294	GATC	2	8	59515	59522	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_011294	TACT	2	8	63237	63244	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_011294	TTTC	2	8	63245	63252	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_011294	TAAT	2	8	68241	68248	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011294	TTAA	2	8	68272	68279	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011294	ATAA	2	8	74692	74699	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011294	ACTT	2	8	75268	75275	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_011294	ACTG	2	8	75392	75399	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_011294	AGTG	2	8	75421	75428	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011294	ATTT	2	8	87800	87807	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011294	GTTT	2	8	87827	87834	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011294	TTTA	2	8	87982	87989	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011294	ATTG	2	8	87993	88000	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011294	TTTC	2	8	88087	88094	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_011294	CAGG	2	8	93494	93501	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
33	NC_011294	CTGC	2	8	94166	94173	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
34	NC_011294	TGCC	2	8	94194	94201	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
35	NC_011294	CCCA	2	8	94746	94753	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
36	NC_011294	ACTC	2	8	94852	94859	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_011294	TTTC	2	8	95199	95206	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_011294	ATCA	2	8	105369	105376	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_011294	TATT	2	8	107746	107753	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011294	AATG	2	8	108848	108855	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011294	GTTC	2	8	115673	115680	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_011294	TTTA	2	8	115822	115829	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011294	GTTT	2	8	115955	115962	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011294	TAAA	2	8	116046	116053	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011294	TCCA	2	8	120676	120683	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_011294	CAGG	2	8	120730	120737	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
47	NC_011294	AGAT	2	8	128689	128696	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011294	TTTG	2	8	133491	133498	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011294	TTTG	2	8	133802	133809	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011294	TTGC	2	8	134037	134044	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_011294	AGCG	2	8	135463	135470	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
52	NC_011294	CAGG	2	8	137825	137832	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
53	NC_011294	CAAA	2	8	139065	139072	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_011294	CTTT	2	8	139147	139154	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_011294	CTTG	2	8	139547	139554	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_011294	GCCG	2	8	161704	161711	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57	NC_011294	CATA	2	8	162482	162489	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_011294	GGCA	2	8	162679	162686	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
59	NC_011294	CTGG	2	8	166512	166519	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
60	NC_011294	GTCG	2	8	170644	170651	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
61	NC_011294	ATTT	2	8	176261	176268	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011294	AAAG	2	8	176378	176385	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011294	TCAA	2	8	176617	176624	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_011294	TAGA	2	8	177629	177636	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011294	CGGC	2	8	182231	182238	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
66	NC_011294	TGTC	2	8	184010	184017	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
67	NC_011294	TGCC	2	8	186915	186922	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
68	NC_011294	TCCT	2	8	190372	190379	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_011294	AAAT	2	8	191108	191115	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011294	TTTC	2	8	191299	191306	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_011294	TTGA	2	8	191914	191921	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011294	GAAT	2	8	202488	202495	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011294	AAGT	2	8	203939	203946	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011294	GTTT	2	8	210890	210897	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011294	AACG	2	8	218163	218170	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_011294	ACGC	2	8	218764	218771	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
77	NC_011294	CCTT	2	8	225366	225373	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_011294	AAAT	2	8	232031	232038	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011294	AAAT	2	8	232109	232116	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011294	TTTG	2	8	232211	232218	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011294	TATT	2	8	232238	232245	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011294	TAAA	2	8	232266	232273	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011294	TTAT	2	8	232328	232335	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011294	ATAA	2	8	255144	255151	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011294	TCAG	2	8	258922	258929	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
86	NC_011294	GAAA	2	8	261282	261289	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011294	TTAG	2	8	267368	267375	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011294	GCAG	2	8	279164	279171	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
89	NC_011294	AATG	2	8	290426	290433	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011294	ATCA	2	8	293166	293173	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_011294	CGGT	2	8	293944	293951	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
92	NC_011294	GTAG	2	8	295625	295632	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011294	GAAA	2	8	296224	296231	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011294	CTGA	2	8	296683	296690	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
95	NC_011294	GTAC	2	8	296767	296774	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
96	NC_011294	AGGC	2	8	296895	296902	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
97	NC_011294	CGTC	2	8	297347	297354	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
98	NC_011294	AAAG	2	8	297470	297477	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_011294	AGTC	2	8	298132	298139	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
100	NC_011294	GCTG	2	8	298150	298157	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
101	NC_011294	CCTG	2	8	299823	299830	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
102	NC_011294	CCGT	2	8	299858	299865	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
103	NC_011294	AGTG	2	8	303107	303114	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_011294	CCTG	2	8	309262	309269	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
105	NC_011294	CCGT	2	8	309297	309304	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
106	NC_011294	CATG	2	8	310753	310760	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
107	NC_011294	TGCC	2	8	311327	311334	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
108	NC_011294	CAGC	2	8	311345	311352	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
109	NC_011294	ATCC	2	8	311476	311483	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_011294	TTAT	2	8	312521	312528	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_011294	TATT	2	8	312678	312685	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011294	ACGG	2	8	313264	313271	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
113	NC_011294	CGGG	2	8	313282	313289	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
114	NC_011294	GACG	2	8	314107	314114	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
115	NC_011294	ACGC	2	8	314467	314474	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
116	NC_011294	GACG	2	8	314488	314495	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
117	NC_011294	GCAG	2	8	314670	314677	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
118	NC_011294	ACGA	2	8	314741	314748	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
119	NC_011294	GCAG	2	8	315575	315582	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
120	NC_011294	GGAA	2	8	315808	315815	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_011294	GACG	2	8	316015	316022	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
122	NC_011294	GATC	2	8	316267	316274	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
123	NC_011294	TCCA	2	8	316564	316571	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_011294	TAAA	2	8	317371	317378	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_011294	GCTG	2	8	317399	317406	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
126	NC_011294	GTCA	2	8	317581	317588	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
127	NC_011294	ATTT	2	8	318255	318262	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_011294	TGCT	2	8	319570	319577	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
129	NC_011294	AATC	2	8	320268	320275	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
130	NC_011294	CGGA	2	8	320355	320362	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
131	NC_011294	AAGG	2	8	321174	321181	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_011294	GTCA	2	8	321221	321228	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
133	NC_011294	ATGT	2	8	321355	321362	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_011294	AATT	2	8	322348	322355	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_011294	TGAT	2	8	326233	326240	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_011294	TTTG	2	8	326343	326350	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_011294	GTTT	2	8	326395	326402	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_011294	ATTT	2	8	326481	326488	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_011294	GATG	2	8	327993	328000	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_011294	TGCC	2	8	331117	331124	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
141	NC_011294	CTTG	2	8	334534	334541	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
142	NC_011294	GTTG	2	8	335370	335377	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_011294	CCGT	2	8	348431	348438	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
144	NC_011294	CACC	2	8	348726	348733	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
145	NC_011294	CGGA	2	8	348817	348824	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
146	NC_011294	CGCC	2	8	348841	348848	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
147	NC_011294	AAAG	2	8	349975	349982	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_011294	AATA	2	8	350496	350503	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_011294	TGTT	2	8	350659	350666	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
150	NC_011294	GATT	2	8	357254	357261	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
151	NC_011294	CCAT	2	8	357347	357354	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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157	NC_011294	TTAT	2	8	369395	369402	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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445	NC_011294	AGTC	2	8	1168211	1168218	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
446	NC_011294	GCTG	2	8	1168961	1168968	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
447	NC_011294	GGCT	2	8	1168985	1168992	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
448	NC_011294	AATG	2	8	1169072	1169079	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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450	NC_011294	ATTA	2	8	1172322	1172329	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
451	NC_011294	ATTA	2	8	1172468	1172475	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
452	NC_011294	TGAG	2	8	1177888	1177895	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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455	NC_011294	AATA	2	8	1187288	1187295	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
456	NC_011294	AGGT	2	8	1187320	1187327	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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459	NC_011294	CAGT	2	8	1197980	1197987	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
460	NC_011294	GGCA	2	8	1198139	1198146	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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462	NC_011294	TATT	2	8	1202471	1202478	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
463	NC_011294	CACT	2	8	1214722	1214729	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
464	NC_011294	GCTT	2	8	1217461	1217468	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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467	NC_011294	TCAT	2	8	1220390	1220397	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
468	NC_011294	ATTC	2	8	1223314	1223321	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
469	NC_011294	ATTG	2	8	1224411	1224418	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
470	NC_011294	ATTT	2	8	1226444	1226451	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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472	NC_011294	TCAG	2	8	1227985	1227992	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
473	NC_011294	ATTT	2	8	1228067	1228074	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
474	NC_011294	TAAT	2	8	1228164	1228171	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
475	NC_011294	TAAG	2	8	1230627	1230634	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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480	NC_011294	TTAA	2	8	1234378	1234385	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
481	NC_011294	AATA	2	8	1234417	1234424	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
482	NC_011294	TATT	2	8	1234446	1234453	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
483	NC_011294	CAAT	2	8	1235414	1235421	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
484	NC_011294	TCAC	2	8	1235556	1235563	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
485	NC_011294	AGGT	2	8	1237390	1237397	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
486	NC_011294	ATAA	2	8	1238361	1238368	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
487	NC_011294	TCTG	2	8	1239198	1239205	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
488	NC_011294	CAGC	2	8	1239917	1239924	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
489	NC_011294	ACCC	2	8	1240074	1240081	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
490	NC_011294	CGGA	2	8	1240171	1240178	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
491	NC_011294	GGCG	2	8	1240365	1240372	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
492	NC_011294	TGGC	2	8	1240445	1240452	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
493	NC_011294	GTCG	2	8	1240688	1240695	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
494	NC_011294	CCCT	2	8	1240911	1240918	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
495	NC_011294	TGCG	2	8	1240938	1240945	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
496	NC_011294	CCGC	2	8	1241070	1241077	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
497	NC_011294	CTGG	2	8	1241598	1241605	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
498	NC_011294	ATGA	2	8	1241992	1241999	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
499	NC_011294	AGTT	2	8	1243053	1243060	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
500	NC_011294	TGAT	2	8	1243946	1243953	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding

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