MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Enteritidis str. P125109 chromosome

Total Repeats: 14062

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_011294	ATTA	2	8	1261104	1261111	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4002	NC_011294	AGA	2	6	1261150	1261155	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_011294	T	6	6	1261650	1261655	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_011294	ATTA	2	8	1261724	1261731	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_011294	TGT	2	6	1261815	1261820	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_011294	TGC	2	6	1261840	1261845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4007	NC_011294	GTCG	2	8	1261846	1261853	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4008	NC_011294	TAT	2	6	1261948	1261953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_011294	TGT	2	6	1262393	1262398	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4010	NC_011294	TTG	2	6	1262408	1262413	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4011	NC_011294	AGC	2	6	1262420	1262425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4012	NC_011294	AAT	3	9	1262450	1262458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_011294	ATT	2	6	1262514	1262519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4014	NC_011294	T	7	7	1262532	1262538	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4015	NC_011294	CATTT	2	10	1262562	1262571	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
4016	NC_011294	ATA	2	6	1262600	1262605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4017	NC_011294	TA	3	6	1262604	1262609	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_011294	TTAA	2	8	1262618	1262625	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_011294	GA	3	6	1262655	1262660	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4020	NC_011294	TGGCG	2	10	1262663	1262672	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
4021	NC_011294	AGCC	2	8	1262722	1262729	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4022	NC_011294	AAC	2	6	1262751	1262756	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4023	NC_011294	ATAA	2	8	1262763	1262770	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4024	NC_011294	AGT	2	6	1262799	1262804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4025	NC_011294	A	8	8	1262884	1262891	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_011294	AGA	2	6	1262905	1262910	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4027	NC_011294	AAAAT	2	10	1262926	1262935	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4028	NC_011294	T	6	6	1262980	1262985	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4029	NC_011294	GTA	2	6	1263770	1263775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4030	NC_011294	AATAC	2	10	1263776	1263785	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
4031	NC_011294	TA	3	6	1263826	1263831	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_011294	CGT	2	6	1263862	1263867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4033	NC_011294	TTA	2	6	1263923	1263928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4034	NC_011294	T	7	7	1263956	1263962	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4035	NC_011294	GTT	2	6	1263975	1263980	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4036	NC_011294	GAT	2	6	1264003	1264008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4037	NC_011294	GAT	2	6	1264311	1264316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4038	NC_011294	ACA	2	6	1264356	1264361	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4039	NC_011294	A	7	7	1264379	1264385	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4040	NC_011294	ACT	2	6	1265317	1265322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4041	NC_011294	G	6	6	1265353	1265358	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_011294	GAA	2	6	1265371	1265376	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_011294	T	7	7	1265749	1265755	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_011294	A	7	7	1267220	1267226	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4045	NC_011294	GC	3	6	1267230	1267235	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4046	NC_011294	AAT	2	6	1271190	1271195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4047	NC_011294	CTG	2	6	1271850	1271855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4048	NC_011294	TTG	2	6	1271857	1271862	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4049	NC_011294	AGGCC	2	10	1272583	1272592	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
4050	NC_011294	A	6	6	1274660	1274665	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4051	NC_011294	T	9	9	1274675	1274683	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4052	NC_011294	GTC	2	6	1274697	1274702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4053	NC_011294	TAA	2	6	1277152	1277157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4054	NC_011294	AAT	3	9	1277174	1277182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4055	NC_011294	GTT	2	6	1277200	1277205	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4056	NC_011294	TAA	2	6	1277267	1277272	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4057	NC_011294	TTA	2	6	1278115	1278120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4058	NC_011294	A	8	8	1278131	1278138	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4059	NC_011294	GCT	2	6	1278157	1278162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4060	NC_011294	T	7	7	1278162	1278168	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4061	NC_011294	ATA	2	6	1278202	1278207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_011294	TTA	2	6	1278228	1278233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_011294	ATT	2	6	1278238	1278243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4064	NC_011294	AAC	2	6	1278258	1278263	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4065	NC_011294	ATT	2	6	1278279	1278284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4066	NC_011294	ATT	2	6	1278305	1278310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4067	NC_011294	TAC	2	6	1278560	1278565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4068	NC_011294	CTTTT	2	10	1278568	1278577	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
4069	NC_011294	TTAG	2	8	1278578	1278585	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4070	NC_011294	ATTG	2	8	1278604	1278611	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4071	NC_011294	TTCC	2	8	1278879	1278886	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4072	NC_011294	GGT	2	6	1278922	1278927	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4073	NC_011294	TC	3	6	1279273	1279278	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4074	NC_011294	TAC	2	6	1279300	1279305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4075	NC_011294	AT	3	6	1279325	1279330	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4076	NC_011294	TC	4	8	1279422	1279429	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4077	NC_011294	TTGT	2	8	1279444	1279451	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4078	NC_011294	ATT	2	6	1279454	1279459	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4079	NC_011294	CTTTT	2	10	1279513	1279522	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
4080	NC_011294	TAT	2	6	1279524	1279529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4081	NC_011294	T	6	6	1279545	1279550	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4082	NC_011294	GAA	2	6	1279631	1279636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4083	NC_011294	CAG	2	6	1279673	1279678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4084	NC_011294	AT	3	6	1279711	1279716	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4085	NC_011294	TTG	2	6	1279728	1279733	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4086	NC_011294	TTG	2	6	1280352	1280357	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4087	NC_011294	TTA	2	6	1280371	1280376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4088	NC_011294	T	6	6	1280383	1280388	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4089	NC_011294	ATCA	2	8	1280416	1280423	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4090	NC_011294	CAG	2	6	1283718	1283723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4091	NC_011294	GCG	2	6	1283752	1283757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4092	NC_011294	ACA	2	6	1283875	1283880	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4093	NC_011294	ATT	2	6	1283891	1283896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4094	NC_011294	TCA	2	6	1283934	1283939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4095	NC_011294	TTAAA	2	10	1283948	1283957	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4096	NC_011294	TAT	2	6	1283993	1283998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4097	NC_011294	TCC	2	6	1284507	1284512	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4098	NC_011294	A	7	7	1284521	1284527	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4099	NC_011294	ACA	2	6	1284553	1284558	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4100	NC_011294	CGG	2	6	1286273	1286278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4101	NC_011294	CCT	2	6	1287254	1287259	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4102	NC_011294	TTA	2	6	1287260	1287265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4103	NC_011294	T	6	6	1287294	1287299	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4104	NC_011294	ATT	2	6	1287366	1287371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4105	NC_011294	A	7	7	1287382	1287388	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4106	NC_011294	TG	3	6	1287394	1287399	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4107	NC_011294	AAGG	2	8	1287474	1287481	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4108	NC_011294	GCA	2	6	1287550	1287555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4109	NC_011294	TGT	2	6	1287677	1287682	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4110	NC_011294	GCC	2	6	1290907	1290912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4111	NC_011294	CGA	2	6	1290975	1290980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4112	NC_011294	AGGG	2	8	1291022	1291029	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
4113	NC_011294	ATA	2	6	1292406	1292411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4114	NC_011294	GC	3	6	1292567	1292572	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4115	NC_011294	TA	3	6	1292584	1292589	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4116	NC_011294	ACC	2	6	1292632	1292637	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4117	NC_011294	ACA	2	6	1294627	1294632	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4118	NC_011294	CCG	2	6	1294644	1294649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4119	NC_011294	AAT	2	6	1294660	1294665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_011294	GC	3	6	1297289	1297294	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4121	NC_011294	ACT	2	6	1298024	1298029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4122	NC_011294	C	6	6	1298034	1298039	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4123	NC_011294	ATA	2	6	1298733	1298738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4124	NC_011294	AAAT	2	8	1298740	1298747	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4125	NC_011294	TAAT	2	8	1298778	1298785	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4126	NC_011294	TTA	2	6	1298825	1298830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4127	NC_011294	TGA	2	6	1298841	1298846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4128	NC_011294	CGA	2	6	1298847	1298852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4129	NC_011294	GA	3	6	1300579	1300584	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4130	NC_011294	T	8	8	1300602	1300609	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4131	NC_011294	CGG	2	6	1301762	1301767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4132	NC_011294	AAAT	2	8	1301792	1301799	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4133	NC_011294	AAT	2	6	1301812	1301817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4134	NC_011294	A	7	7	1301820	1301826	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4135	NC_011294	A	6	6	1301828	1301833	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4136	NC_011294	TTC	2	6	1301840	1301845	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4137	NC_011294	T	6	6	1301850	1301855	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4142	NC_011294	GCC	2	6	1304834	1304839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4143	NC_011294	GCG	2	6	1304844	1304849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4152	NC_011294	AACC	2	8	1305867	1305874	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4153	NC_011294	T	6	6	1305902	1305907	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4154	NC_011294	TCT	2	6	1305911	1305916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4156	NC_011294	TAG	2	6	1305976	1305981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4167	NC_011294	AGCG	2	8	1309014	1309021	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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4257	NC_011294	CT	4	8	1340859	1340866	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4258	NC_011294	ATG	2	6	1340890	1340895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4259	NC_011294	TAC	2	6	1340923	1340928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4261	NC_011294	T	6	6	1342211	1342216	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4262	NC_011294	T	6	6	1346287	1346292	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4263	NC_011294	AAG	2	6	1347439	1347444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4264	NC_011294	T	7	7	1347467	1347473	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4266	NC_011294	T	7	7	1347508	1347514	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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