MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Enteritidis str. P125109 chromosome

Total Repeats: 14062

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_011294	CT	3	6	1058386	1058391	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3002	NC_011294	ATA	2	6	1058400	1058405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3003	NC_011294	ATT	2	6	1058406	1058411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3004	NC_011294	AT	3	6	1062263	1062268	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3005	NC_011294	CGC	2	6	1062794	1062799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3006	NC_011294	GCG	2	6	1062802	1062807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3007	NC_011294	TAC	2	6	1062843	1062848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3008	NC_011294	GC	3	6	1062867	1062872	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3009	NC_011294	TGG	2	6	1062907	1062912	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3010	NC_011294	CGC	2	6	1062937	1062942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3011	NC_011294	CGG	2	6	1062965	1062970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3012	NC_011294	GGT	2	6	1063011	1063016	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3013	NC_011294	CCT	2	6	1063562	1063567	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3014	NC_011294	TAA	2	6	1065171	1065176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3015	NC_011294	TGT	2	6	1065190	1065195	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3016	NC_011294	CGG	2	6	1065244	1065249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3017	NC_011294	GAA	3	9	1065270	1065278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3018	NC_011294	CGG	2	6	1065330	1065335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3019	NC_011294	ATT	2	6	1065815	1065820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3020	NC_011294	AAT	2	6	1065829	1065834	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3021	NC_011294	TTTA	2	8	1065898	1065905	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3022	NC_011294	TAA	3	9	1065927	1065935	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3023	NC_011294	ATCAC	2	10	1065955	1065964	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
3024	NC_011294	TACTT	2	10	1065968	1065977	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
3025	NC_011294	AT	3	6	1066020	1066025	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3026	NC_011294	GAG	2	6	1066056	1066061	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3027	NC_011294	GCGCT	2	10	1070084	1070093	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
3028	NC_011294	A	7	7	1070106	1070112	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3029	NC_011294	CAG	2	6	1070175	1070180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3030	NC_011294	GAA	2	6	1071012	1071017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3031	NC_011294	AGCGC	2	10	1071826	1071835	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
3032	NC_011294	GTA	2	6	1071848	1071853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3033	NC_011294	ATG	2	6	1074181	1074186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3034	NC_011294	A	7	7	1074187	1074193	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3035	NC_011294	ATG	2	6	1075152	1075157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3036	NC_011294	ATT	2	6	1075213	1075218	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3037	NC_011294	T	6	6	1075217	1075222	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3038	NC_011294	ACT	2	6	1075229	1075234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3039	NC_011294	GAT	2	6	1075263	1075268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3040	NC_011294	CTC	2	6	1075378	1075383	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3041	NC_011294	A	6	6	1075416	1075421	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3042	NC_011294	AGT	2	6	1075498	1075503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3043	NC_011294	T	6	6	1075996	1076001	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3044	NC_011294	T	6	6	1076025	1076030	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3045	NC_011294	TTAT	2	8	1076037	1076044	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3046	NC_011294	GTG	2	6	1076094	1076099	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3047	NC_011294	ATT	2	6	1076135	1076140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3048	NC_011294	TGT	2	6	1076155	1076160	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3049	NC_011294	TTAT	2	8	1076166	1076173	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3050	NC_011294	AG	3	6	1076244	1076249	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3051	NC_011294	AT	3	6	1076267	1076272	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3052	NC_011294	A	6	6	1076322	1076327	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3053	NC_011294	TTTA	2	8	1076347	1076354	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3054	NC_011294	GAT	2	6	1076358	1076363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3055	NC_011294	TTC	2	6	1076435	1076440	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3056	NC_011294	TAT	2	6	1076472	1076477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3057	NC_011294	CAT	2	6	1077771	1077776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3058	NC_011294	ATAC	2	8	1077789	1077796	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3059	NC_011294	GTT	2	6	1077893	1077898	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3060	NC_011294	GC	3	6	1077920	1077925	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3061	NC_011294	A	6	6	1078408	1078413	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3062	NC_011294	AAC	2	6	1081530	1081535	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3063	NC_011294	A	6	6	1081553	1081558	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3064	NC_011294	TGT	2	6	1081593	1081598	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3065	NC_011294	CCG	2	6	1081602	1081607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3066	NC_011294	ACA	2	6	1081642	1081647	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3067	NC_011294	TGA	3	9	1081653	1081661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3068	NC_011294	GCC	2	6	1081662	1081667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3069	NC_011294	AAT	2	6	1081691	1081696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3070	NC_011294	CGG	2	6	1081750	1081755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3071	NC_011294	GAC	2	6	1081762	1081767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3072	NC_011294	GGC	2	6	1081772	1081777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3073	NC_011294	AC	3	6	1081803	1081808	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3074	NC_011294	TCA	2	6	1081957	1081962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3076	NC_011294	GAT	2	6	1082012	1082017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3078	NC_011294	TGA	2	6	1082080	1082085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3079	NC_011294	TGG	2	6	1082241	1082246	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3080	NC_011294	AT	3	6	1082416	1082421	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3081	NC_011294	GC	3	6	1082451	1082456	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3082	NC_011294	TGG	2	6	1082472	1082477	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3083	NC_011294	GCT	2	6	1082500	1082505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3084	NC_011294	GA	3	6	1082549	1082554	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3085	NC_011294	TGA	2	6	1082616	1082621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3086	NC_011294	CTG	2	6	1082778	1082783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3087	NC_011294	TCC	2	6	1083058	1083063	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3088	NC_011294	TAC	2	6	1083673	1083678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3089	NC_011294	GT	3	6	1083695	1083700	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3090	NC_011294	CCT	2	6	1083732	1083737	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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3092	NC_011294	TTG	2	6	1083800	1083805	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3093	NC_011294	TTAT	2	8	1083856	1083863	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3094	NC_011294	TTA	2	6	1083873	1083878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3095	NC_011294	TGA	2	6	1083970	1083975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3096	NC_011294	GAG	2	6	1083995	1084000	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3097	NC_011294	CTC	2	6	1084004	1084009	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3098	NC_011294	ATG	2	6	1084024	1084029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3099	NC_011294	CCG	3	9	1084278	1084286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3100	NC_011294	CGG	2	6	1084293	1084298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3101	NC_011294	T	7	7	1084299	1084305	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3102	NC_011294	TTAA	2	8	1085431	1085438	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3103	NC_011294	A	7	7	1089556	1089562	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3104	NC_011294	ATTT	2	8	1089596	1089603	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3105	NC_011294	A	6	6	1089642	1089647	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3106	NC_011294	GA	3	6	1089651	1089656	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3107	NC_011294	GT	3	6	1089709	1089714	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3108	NC_011294	ACC	2	6	1089732	1089737	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3109	NC_011294	AATA	2	8	1089825	1089832	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3110	NC_011294	GGC	2	6	1091402	1091407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3111	NC_011294	GCCT	2	8	1091415	1091422	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3112	NC_011294	CT	3	6	1091479	1091484	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3113	NC_011294	AT	3	6	1091554	1091559	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3114	NC_011294	ATAA	2	8	1091664	1091671	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3115	NC_011294	GA	3	6	1091689	1091694	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3116	NC_011294	GGT	2	6	1091752	1091757	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3117	NC_011294	TAG	2	6	1091775	1091780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3118	NC_011294	T	6	6	1091793	1091798	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3119	NC_011294	AAT	2	6	1091815	1091820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3120	NC_011294	AAT	2	6	1091856	1091861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3121	NC_011294	AT	3	6	1091882	1091887	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3122	NC_011294	ATT	2	6	1091894	1091899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3123	NC_011294	TGT	2	6	1091909	1091914	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3124	NC_011294	TAG	2	6	1091918	1091923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3126	NC_011294	AGT	2	6	1092008	1092013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3127	NC_011294	ACA	2	6	1092015	1092020	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3128	NC_011294	TC	4	8	1092035	1092042	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3129	NC_011294	GGT	3	9	1092044	1092052	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3130	NC_011294	TCA	2	6	1092072	1092077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3131	NC_011294	GTG	2	6	1092111	1092116	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3132	NC_011294	GT	3	6	1092126	1092131	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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