MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Enteritidis str. P125109 chromosome

Total Repeats: 14062

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_011294	ATGT	2	8	513090	513097	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_011294	TGTT	2	8	513825	513832	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_011294	ATT	2	6	513858	513863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_011294	CG	3	6	517274	517279	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1505	NC_011294	GC	3	6	517290	517295	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1506	NC_011294	TTG	2	6	518249	518254	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_011294	TTCAA	2	10	519012	519021	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1508	NC_011294	CAGGCG	2	12	519524	519535	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
1509	NC_011294	AT	3	6	519607	519612	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_011294	AG	3	6	520196	520201	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_011294	AG	5	10	522241	522250	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_011294	GGC	2	6	523198	523203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1513	NC_011294	TTG	2	6	523281	523286	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_011294	ACGG	2	8	525224	525231	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1515	NC_011294	AGCGCC	2	12	525369	525380	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
1516	NC_011294	T	6	6	525389	525394	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_011294	ATA	2	6	525395	525400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_011294	GGC	2	6	525445	525450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1519	NC_011294	TGG	2	6	525472	525477	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_011294	A	6	6	525496	525501	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_011294	T	6	6	526176	526181	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_011294	GGC	2	6	526263	526268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1523	NC_011294	CTG	2	6	526287	526292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1524	NC_011294	GCA	2	6	526334	526339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1525	NC_011294	TTC	2	6	526345	526350	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1526	NC_011294	CAA	2	6	526376	526381	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1527	NC_011294	GGC	2	6	526397	526402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1528	NC_011294	A	6	6	528365	528370	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_011294	TCG	2	6	528393	528398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1530	NC_011294	CGTC	2	8	528418	528425	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1531	NC_011294	GC	3	6	528426	528431	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1532	NC_011294	GC	3	6	529813	529818	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1533	NC_011294	A	6	6	531589	531594	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_011294	TAG	2	6	532986	532991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_011294	ATT	2	6	533000	533005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_011294	GAAG	2	8	533036	533043	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_011294	TAT	2	6	533069	533074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_011294	GA	3	6	533115	533120	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_011294	GC	3	6	534814	534819	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1540	NC_011294	CTG	2	6	534844	534849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1541	NC_011294	CTT	2	6	535389	535394	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1542	NC_011294	A	6	6	535439	535444	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_011294	ATA	3	9	535526	535534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_011294	TCGG	2	8	536454	536461	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1545	NC_011294	A	7	7	537313	537319	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_011294	TGT	2	6	537330	537335	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_011294	T	6	6	537335	537340	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_011294	TA	3	6	537371	537376	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_011294	TAA	2	6	537402	537407	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_011294	TGC	2	6	537424	537429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1551	NC_011294	TCA	2	6	539969	539974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1552	NC_011294	CCT	2	6	541846	541851	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1553	NC_011294	C	6	6	541921	541926	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1554	NC_011294	TTA	2	6	541927	541932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_011294	AAC	2	6	541966	541971	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1556	NC_011294	GAT	2	6	543438	543443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_011294	GAC	2	6	543470	543475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1558	NC_011294	GC	3	6	543491	543496	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1559	NC_011294	AG	3	6	543506	543511	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_011294	CT	3	6	544376	544381	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1561	NC_011294	GC	3	6	544416	544421	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1562	NC_011294	CGTT	2	8	545274	545281	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1563	NC_011294	GCC	2	6	545328	545333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1564	NC_011294	ATG	2	6	549039	549044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_011294	AAT	2	6	549047	549052	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_011294	T	6	6	549082	549087	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_011294	TAG	2	6	549118	549123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_011294	A	6	6	549135	549140	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_011294	ACA	2	6	549144	549149	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1570	NC_011294	TTA	2	6	549168	549173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_011294	CTAT	2	8	549200	549207	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1572	NC_011294	AC	3	6	550427	550432	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1573	NC_011294	GCCT	2	8	550441	550448	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1574	NC_011294	AC	3	6	550462	550467	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1575	NC_011294	CAT	2	6	550475	550480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1576	NC_011294	AAT	2	6	550483	550488	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1577	NC_011294	CAG	2	6	550497	550502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1578	NC_011294	ATC	2	6	554300	554305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1579	NC_011294	CCT	2	6	555285	555290	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1580	NC_011294	AGT	2	6	555333	555338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1581	NC_011294	ATA	2	6	555344	555349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_011294	CTT	2	6	555995	556000	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1583	NC_011294	CGCT	2	8	556891	556898	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1584	NC_011294	T	6	6	556909	556914	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_011294	AAT	2	6	559544	559549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1586	NC_011294	T	8	8	559561	559568	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1587	NC_011294	GAA	2	6	560574	560579	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1588	NC_011294	AAT	2	6	561830	561835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1589	NC_011294	CTA	2	6	561841	561846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1590	NC_011294	TTTAT	2	10	561851	561860	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1591	NC_011294	ATTT	2	8	561861	561868	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1592	NC_011294	AAC	2	6	561890	561895	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1593	NC_011294	AG	3	6	561936	561941	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1594	NC_011294	CAG	2	6	561948	561953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1595	NC_011294	TTA	2	6	561972	561977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1596	NC_011294	ATGG	2	8	562028	562035	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1597	NC_011294	CGT	2	6	564838	564843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1598	NC_011294	ACG	2	6	564845	564850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1599	NC_011294	A	7	7	567351	567357	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1600	NC_011294	AGG	2	6	567409	567414	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1601	NC_011294	CCG	2	6	567420	567425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1602	NC_011294	ACG	2	6	570544	570549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1603	NC_011294	AAAAT	2	10	570582	570591	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_011294	A	7	7	570613	570619	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_011294	ATTT	2	8	570630	570637	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_011294	TAAA	2	8	570667	570674	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1607	NC_011294	T	6	6	570679	570684	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_011294	GTT	2	6	570711	570716	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_011294	TAA	2	6	570730	570735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_011294	AT	3	6	570774	570779	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_011294	TGCAAT	2	12	570808	570819	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1612	NC_011294	ATT	2	6	570827	570832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_011294	GTT	2	6	570838	570843	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_011294	GCG	2	6	575505	575510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1615	NC_011294	GCC	2	6	575522	575527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1616	NC_011294	GCT	2	6	577140	577145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1617	NC_011294	TGCG	2	8	577192	577199	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1618	NC_011294	CGA	2	6	577217	577222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1619	NC_011294	AG	3	6	578464	578469	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1620	NC_011294	TGC	2	6	578548	578553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1621	NC_011294	AAT	2	6	578564	578569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_011294	ATT	2	6	578585	578590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_011294	CA	3	6	578594	578599	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1624	NC_011294	GAT	2	6	581902	581907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1625	NC_011294	AG	3	6	583053	583058	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1626	NC_011294	CGTT	2	8	583167	583174	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1627	NC_011294	GC	3	6	583200	583205	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1628	NC_011294	TCA	2	6	583230	583235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1629	NC_011294	TCG	2	6	583261	583266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1630	NC_011294	GGC	2	6	583279	583284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1631	NC_011294	CTT	2	6	583320	583325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1632	NC_011294	T	6	6	583373	583378	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1633	NC_011294	TTA	2	6	583398	583403	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1634	NC_011294	ATTA	2	8	583431	583438	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1635	NC_011294	TAAT	2	8	583472	583479	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1637	NC_011294	ATA	2	6	583535	583540	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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