MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Enteritidis str. P125109 chromosome

Total Repeats: 14062

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_011294	ACTC	2	8	1542877	1542884	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5002	NC_011294	GCC	2	6	1542889	1542894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5003	NC_011294	ATT	2	6	1542909	1542914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5004	NC_011294	AGG	2	6	1542928	1542933	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5005	NC_011294	ATG	2	6	1542998	1543003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_011294	TTG	2	6	1543874	1543879	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5007	NC_011294	AAC	2	6	1543943	1543948	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5008	NC_011294	AGC	2	6	1543976	1543981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5009	NC_011294	GC	3	6	1545487	1545492	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5010	NC_011294	GCG	2	6	1545510	1545515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5011	NC_011294	A	6	6	1547013	1547018	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5012	NC_011294	CGG	2	6	1547030	1547035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5013	NC_011294	GCA	2	6	1547062	1547067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5014	NC_011294	GCA	3	9	1547135	1547143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5015	NC_011294	ACG	2	6	1547159	1547164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5016	NC_011294	CATT	2	8	1547178	1547185	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5017	NC_011294	TCA	2	6	1547197	1547202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5018	NC_011294	AAT	2	6	1547241	1547246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5019	NC_011294	GTT	2	6	1554054	1554059	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5020	NC_011294	CTT	2	6	1554070	1554075	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5021	NC_011294	GCAA	2	8	1554103	1554110	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5022	NC_011294	CGG	2	6	1554112	1554117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5023	NC_011294	AGG	2	6	1554187	1554192	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5024	NC_011294	GCG	2	6	1554196	1554201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5025	NC_011294	GGC	2	6	1555527	1555532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5026	NC_011294	GAAA	2	8	1555577	1555584	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5027	NC_011294	A	6	6	1556731	1556736	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5028	NC_011294	GGC	2	6	1556738	1556743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5029	NC_011294	TCA	2	6	1556796	1556801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5030	NC_011294	TTG	2	6	1556911	1556916	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5031	NC_011294	TATT	2	8	1556955	1556962	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5032	NC_011294	T	6	6	1556986	1556991	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5033	NC_011294	CTT	2	6	1557009	1557014	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5034	NC_011294	TGT	2	6	1557031	1557036	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5035	NC_011294	GAAG	2	8	1557050	1557057	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5036	NC_011294	TTAAG	2	10	1559977	1559986	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
5037	NC_011294	ATAA	2	8	1560046	1560053	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5038	NC_011294	ATT	3	9	1560056	1560064	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5039	NC_011294	TAA	2	6	1560074	1560079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5040	NC_011294	AGT	2	6	1560107	1560112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5041	NC_011294	AGC	2	6	1560117	1560122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5042	NC_011294	GTC	2	6	1560146	1560151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5043	NC_011294	CCG	2	6	1561280	1561285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5044	NC_011294	TGA	2	6	1561292	1561297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5045	NC_011294	GGC	2	6	1561602	1561607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5046	NC_011294	GGGGAA	2	12	1561642	1561653	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5047	NC_011294	CCG	2	6	1563270	1563275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5048	NC_011294	AGA	2	6	1563323	1563328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5049	NC_011294	TTGCG	2	10	1563421	1563430	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
5050	NC_011294	AAT	2	6	1563432	1563437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5051	NC_011294	ACC	2	6	1563495	1563500	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5052	NC_011294	AGC	2	6	1563513	1563518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5053	NC_011294	TCC	2	6	1563553	1563558	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5054	NC_011294	TTGA	2	8	1563587	1563594	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5055	NC_011294	GA	3	6	1563609	1563614	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5056	NC_011294	CGC	2	6	1564363	1564368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5057	NC_011294	GGC	2	6	1564375	1564380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5058	NC_011294	T	6	6	1564466	1564471	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5059	NC_011294	TG	3	6	1564536	1564541	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5060	NC_011294	TTAATG	2	12	1564555	1564566	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5061	NC_011294	T	6	6	1565423	1565428	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5062	NC_011294	GAA	2	6	1566370	1566375	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5063	NC_011294	TCA	2	6	1566376	1566381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5064	NC_011294	GAC	2	6	1566402	1566407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5065	NC_011294	C	6	6	1566439	1566444	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5066	NC_011294	GAA	2	6	1574618	1574623	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5067	NC_011294	A	6	6	1574630	1574635	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5068	NC_011294	T	7	7	1574676	1574682	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5069	NC_011294	A	6	6	1574707	1574712	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5070	NC_011294	GCGCG	2	10	1574721	1574730	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
5071	NC_011294	GAG	2	6	1574733	1574738	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5072	NC_011294	ATG	2	6	1574741	1574746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5073	NC_011294	ATT	2	6	1574792	1574797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5074	NC_011294	GC	3	6	1575405	1575410	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5075	NC_011294	AGCC	2	8	1577492	1577499	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5076	NC_011294	ACA	2	6	1577528	1577533	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5077	NC_011294	TAA	2	6	1578628	1578633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5078	NC_011294	AAT	2	6	1578729	1578734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5079	NC_011294	ATT	2	6	1578754	1578759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5080	NC_011294	TG	3	6	1578766	1578771	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5081	NC_011294	TAA	2	6	1578823	1578828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5082	NC_011294	AT	3	6	1578830	1578835	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5083	NC_011294	GTA	2	6	1578877	1578882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5084	NC_011294	ACT	2	6	1578883	1578888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5085	NC_011294	ATT	2	6	1578890	1578895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5086	NC_011294	TAA	2	6	1578904	1578909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5087	NC_011294	TA	3	6	1578931	1578936	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5088	NC_011294	AGG	2	6	1579022	1579027	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5089	NC_011294	AATATC	2	12	1579122	1579133	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5090	NC_011294	GCCC	2	8	1579135	1579142	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5091	NC_011294	CAA	2	6	1579993	1579998	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5092	NC_011294	T	6	6	1580111	1580116	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5093	NC_011294	A	6	6	1580193	1580198	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5094	NC_011294	TGC	2	6	1580259	1580264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5095	NC_011294	AGG	2	6	1580272	1580277	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5096	NC_011294	A	6	6	1580291	1580296	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5097	NC_011294	CTG	2	6	1584955	1584960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5098	NC_011294	GAC	2	6	1584973	1584978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5099	NC_011294	TGA	2	6	1585971	1585976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5100	NC_011294	TG	3	6	1585980	1585985	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5101	NC_011294	ACA	2	6	1585986	1585991	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5102	NC_011294	TTA	2	6	1586015	1586020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5103	NC_011294	TGA	2	6	1586085	1586090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5104	NC_011294	GGC	2	6	1586100	1586105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5105	NC_011294	TAG	2	6	1586179	1586184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5106	NC_011294	GT	3	6	1586215	1586220	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5107	NC_011294	ACTAAA	2	12	1586231	1586242	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5108	NC_011294	GAA	2	6	1586243	1586248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5109	NC_011294	CGG	2	6	1586258	1586263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5110	NC_011294	CCG	2	6	1586270	1586275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5111	NC_011294	ACTC	2	8	1587985	1587992	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5112	NC_011294	CGT	2	6	1588018	1588023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5113	NC_011294	ATC	2	6	1588026	1588031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5114	NC_011294	AT	3	6	1588032	1588037	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5115	NC_011294	CCA	2	6	1588044	1588049	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5116	NC_011294	CTC	2	6	1588307	1588312	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5117	NC_011294	GAAA	2	8	1588351	1588358	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5118	NC_011294	TATT	2	8	1588632	1588639	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5119	NC_011294	AATT	2	8	1588657	1588664	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5120	NC_011294	GAA	2	6	1588757	1588762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5121	NC_011294	AT	3	6	1588764	1588769	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5122	NC_011294	TTA	2	6	1588853	1588858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5123	NC_011294	AGA	2	6	1588918	1588923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5124	NC_011294	AGG	2	6	1588939	1588944	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5125	NC_011294	AT	3	6	1588946	1588951	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5126	NC_011294	AAAG	2	8	1588957	1588964	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5127	NC_011294	TCA	2	6	1588986	1588991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5128	NC_011294	ACA	2	6	1589039	1589044	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5129	NC_011294	AGC	2	6	1589077	1589082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5130	NC_011294	T	6	6	1589098	1589103	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5131	NC_011294	TGA	2	6	1589593	1589598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5135	NC_011294	TAT	2	6	1589827	1589832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5143	NC_011294	T	6	6	1597775	1597780	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5232	NC_011294	GC	3	6	1631162	1631167	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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5248	NC_011294	A	6	6	1635088	1635093	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5254	NC_011294	A	9	9	1635300	1635308	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5255	NC_011294	CCG	2	6	1635309	1635314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5256	NC_011294	GC	3	6	1635561	1635566	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5257	NC_011294	CT	3	6	1635962	1635967	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5258	NC_011294	TAA	2	6	1635971	1635976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5259	NC_011294	T	6	6	1636196	1636201	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5260	NC_011294	TTG	2	6	1636276	1636281	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5262	NC_011294	ATAAA	2	10	1636317	1636326	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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