MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum str. 287/91 chromosome

Total Repeats: 19633

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_011274	AATC	2	8	884167	884174	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3502	NC_011274	ATT	2	6	884244	884249	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3503	NC_011274	TTATA	2	10	884250	884259	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3504	NC_011274	CT	3	6	884447	884452	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3505	NC_011274	GCA	2	6	884544	884549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3506	NC_011274	TCA	2	6	884561	884566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3507	NC_011274	AAT	2	6	884595	884600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3508	NC_011274	TTAC	2	8	884708	884715	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3509	NC_011274	GAA	2	6	884751	884756	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3510	NC_011274	ATT	3	9	884869	884877	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3511	NC_011274	ATTT	2	8	884897	884904	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3512	NC_011274	CGA	2	6	884988	884993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3513	NC_011274	AAT	2	6	885061	885066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3514	NC_011274	TCA	2	6	885191	885196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3515	NC_011274	TTGC	2	8	885388	885395	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3516	NC_011274	GTG	2	6	885549	885554	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3517	NC_011274	ACG	2	6	885571	885576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3518	NC_011274	ATT	2	6	885577	885582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3519	NC_011274	GTA	2	6	885586	885591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3520	NC_011274	TCA	2	6	887003	887008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3521	NC_011274	TTCG	2	8	887012	887019	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3522	NC_011274	GA	3	6	887099	887104	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3523	NC_011274	GA	3	6	887108	887113	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3524	NC_011274	AAAT	2	8	887185	887192	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3525	NC_011274	TTA	2	6	887213	887218	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3526	NC_011274	CT	3	6	891489	891494	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3527	NC_011274	ACA	2	6	891590	891595	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3528	NC_011274	GAT	2	6	891627	891632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3529	NC_011274	GCT	2	6	891638	891643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3530	NC_011274	TAT	2	6	893778	893783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3531	NC_011274	GAAT	2	8	893877	893884	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3532	NC_011274	CAA	2	6	893891	893896	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3533	NC_011274	TG	3	6	893919	893924	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3534	NC_011274	AAC	2	6	896796	896801	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3535	NC_011274	GC	4	8	898362	898369	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3536	NC_011274	CAGGG	2	10	901683	901692	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
3537	NC_011274	GCG	2	6	901739	901744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3538	NC_011274	A	6	6	901826	901831	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3539	NC_011274	AGG	2	6	901867	901872	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3540	NC_011274	A	6	6	901873	901878	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3541	NC_011274	ATTG	2	8	902331	902338	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3542	NC_011274	ATC	2	6	902358	902363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3543	NC_011274	CCG	2	6	902429	902434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3544	NC_011274	ATCG	2	8	902548	902555	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3545	NC_011274	A	6	6	902615	902620	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3546	NC_011274	TTAT	2	8	902792	902799	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3547	NC_011274	AAT	2	6	902804	902809	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3548	NC_011274	ATTTT	2	10	902813	902822	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3549	NC_011274	TTTC	2	8	902854	902861	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3550	NC_011274	G	6	6	902892	902897	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3551	NC_011274	AT	3	6	902935	902940	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3552	NC_011274	GA	3	6	902967	902972	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3553	NC_011274	TCC	2	6	905241	905246	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3554	NC_011274	GCT	2	6	905339	905344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3555	NC_011274	GCC	2	6	905346	905351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3556	NC_011274	G	7	7	905384	905390	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3557	NC_011274	TTC	2	6	905423	905428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3558	NC_011274	ATCT	2	8	905447	905454	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3559	NC_011274	A	6	6	905515	905520	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3560	NC_011274	ATT	2	6	906796	906801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3561	NC_011274	ATG	2	6	906856	906861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3562	NC_011274	TCA	3	9	906937	906945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3563	NC_011274	T	7	7	906952	906958	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3564	NC_011274	TA	3	6	906976	906981	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3565	NC_011274	ATTT	2	8	907049	907056	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3566	NC_011274	ATA	2	6	907090	907095	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3567	NC_011274	TGC	2	6	909750	909755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3568	NC_011274	T	6	6	909756	909761	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3569	NC_011274	TCAG	2	8	909768	909775	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3570	NC_011274	GTCAG	2	10	909900	909909	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
3571	NC_011274	TCA	2	6	909961	909966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3572	NC_011274	GAA	2	6	910523	910528	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3573	NC_011274	CGG	2	6	910552	910557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3574	NC_011274	TAA	2	6	910580	910585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3575	NC_011274	CAT	2	6	910658	910663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3576	NC_011274	ATG	2	6	910747	910752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3577	NC_011274	GC	3	6	910781	910786	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3578	NC_011274	GTT	2	6	910915	910920	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3579	NC_011274	GCG	2	6	910982	910987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3580	NC_011274	CG	3	6	911012	911017	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3581	NC_011274	GCG	3	9	911015	911023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3582	NC_011274	TGGC	2	8	911058	911065	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3583	NC_011274	AGC	2	6	911141	911146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3584	NC_011274	TTA	2	6	911151	911156	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3585	NC_011274	GC	3	6	911239	911244	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3586	NC_011274	GAA	2	6	911295	911300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3587	NC_011274	AGC	2	6	911323	911328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3588	NC_011274	GAT	2	6	912076	912081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3589	NC_011274	A	7	7	912134	912140	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3590	NC_011274	GAAG	2	8	912148	912155	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3591	NC_011274	CGT	2	6	912214	912219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3592	NC_011274	TTA	2	6	912227	912232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3593	NC_011274	TTA	2	6	912243	912248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3594	NC_011274	GGT	2	6	912252	912257	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3595	NC_011274	GT	3	6	912263	912268	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3596	NC_011274	GGT	2	6	912287	912292	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3597	NC_011274	T	7	7	914360	914366	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3598	NC_011274	GGA	2	6	915064	915069	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3599	NC_011274	GGC	2	6	915090	915095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3600	NC_011274	TGA	2	6	915134	915139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3601	NC_011274	AG	3	6	916567	916572	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3602	NC_011274	TCG	2	6	918668	918673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3603	NC_011274	CTGT	2	8	918702	918709	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3604	NC_011274	T	6	6	918709	918714	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3605	NC_011274	T	6	6	919471	919476	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3606	NC_011274	CTT	2	6	921194	921199	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3607	NC_011274	GAAA	2	8	921218	921225	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3608	NC_011274	ACA	2	6	921297	921302	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3609	NC_011274	CAA	2	6	921303	921308	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3610	NC_011274	CGG	2	6	921414	921419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3611	NC_011274	AG	3	6	921434	921439	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3612	NC_011274	AGG	2	6	921444	921449	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3613	NC_011274	TC	3	6	922129	922134	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3614	NC_011274	CTT	2	6	922589	922594	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3615	NC_011274	TGAC	2	8	922635	922642	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3616	NC_011274	ATT	2	6	922658	922663	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3617	NC_011274	GCC	2	6	922664	922669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3618	NC_011274	GC	3	6	922670	922675	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3619	NC_011274	TCCAGT	2	12	922682	922693	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
3620	NC_011274	T	6	6	922693	922698	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3621	NC_011274	TAT	2	6	922711	922716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3622	NC_011274	CGGG	2	8	922761	922768	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3623	NC_011274	AAC	2	6	922866	922871	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3624	NC_011274	GTC	2	6	922883	922888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3625	NC_011274	GAT	2	6	922897	922902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3626	NC_011274	CGG	3	9	922920	922928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3627	NC_011274	GGC	2	6	922943	922948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3628	NC_011274	CGG	2	6	922957	922962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3629	NC_011274	GCCT	2	8	923076	923083	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3630	NC_011274	TGA	2	6	923122	923127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3631	NC_011274	GCT	2	6	923131	923136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3632	NC_011274	GC	3	6	923138	923143	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3633	NC_011274	TAT	2	6	923165	923170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3634	NC_011274	ACGCG	2	10	923189	923198	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
3635	NC_011274	CCG	2	6	924269	924274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3636	NC_011274	T	6	6	924314	924319	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3637	NC_011274	CATCGT	2	12	924320	924331	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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