MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum str. 287/91 chromosome

Total Repeats: 19633

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_011274	GC	3	6	343388	343393	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1502	NC_011274	AAT	2	6	343453	343458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_011274	GGT	2	6	343495	343500	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_011274	CAA	2	6	343507	343512	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1505	NC_011274	G	6	6	343515	343520	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_011274	TCAG	2	8	343535	343542	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1507	NC_011274	GGT	3	9	343591	343599	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_011274	GGT	2	6	343648	343653	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_011274	CCA	2	6	343716	343721	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1510	NC_011274	GGC	2	6	343801	343806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1511	NC_011274	CA	3	6	343920	343925	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1512	NC_011274	GTG	2	6	343939	343944	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_011274	GGT	2	6	343959	343964	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_011274	TGA	2	6	344003	344008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_011274	TGG	2	6	344087	344092	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_011274	ACC	2	6	344180	344185	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1517	NC_011274	GA	3	6	344254	344259	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_011274	TGAT	2	8	344863	344870	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_011274	T	7	7	344891	344897	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_011274	AAT	2	6	344926	344931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_011274	TAT	2	6	344952	344957	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_011274	TTTG	2	8	344973	344980	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_011274	GTTT	2	8	345025	345032	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_011274	ATTT	2	8	345111	345118	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_011274	T	6	6	345116	345121	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_011274	TGC	2	6	345983	345988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1527	NC_011274	TCC	2	6	345997	346002	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1528	NC_011274	CAT	2	6	346005	346010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1529	NC_011274	CGG	2	6	346011	346016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1530	NC_011274	ATG	2	6	346042	346047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_011274	GCA	2	6	346117	346122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1532	NC_011274	GTT	3	9	346200	346208	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_011274	ATT	2	6	346217	346222	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_011274	GAG	2	6	346286	346291	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_011274	TCTGT	2	10	346337	346346	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
1536	NC_011274	TCC	2	6	346348	346353	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1537	NC_011274	AAT	2	6	346363	346368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_011274	G	7	7	346381	346387	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_011274	TAAG	2	8	346391	346398	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_011274	AAT	2	6	346399	346404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_011274	TAT	2	6	346531	346536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_011274	GATG	2	8	346625	346632	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_011274	T	6	6	346675	346680	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_011274	ATG	2	6	346684	346689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_011274	CA	3	6	346708	346713	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1546	NC_011274	ATG	2	6	347763	347768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_011274	GTC	2	6	347807	347812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1548	NC_011274	A	6	6	348857	348862	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_011274	A	6	6	348899	348904	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_011274	TCG	2	6	348937	348942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1551	NC_011274	AGATGA	2	12	349040	349051	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_011274	TTA	2	6	349548	349553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_011274	CGC	2	6	349658	349663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1554	NC_011274	GCG	2	6	349666	349671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1555	NC_011274	TAC	2	6	349707	349712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1556	NC_011274	GC	3	6	349731	349736	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1557	NC_011274	TGG	2	6	349771	349776	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_011274	TGCC	2	8	349801	349808	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1559	NC_011274	CGC	2	6	349861	349866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1560	NC_011274	CTC	2	6	350660	350665	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1561	NC_011274	AAT	2	6	350698	350703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_011274	A	6	6	350704	350709	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_011274	CTTG	2	8	353218	353225	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1564	NC_011274	AGG	2	6	353227	353232	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_011274	TGA	2	6	353245	353250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_011274	ACA	2	6	353302	353307	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1567	NC_011274	TTG	2	6	353317	353322	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_011274	GTTG	2	8	354054	354061	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_011274	TCC	2	6	354107	354112	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1570	NC_011274	ATT	2	6	354136	354141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_011274	AC	3	6	355740	355745	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1572	NC_011274	CAC	2	6	355806	355811	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1573	NC_011274	GT	3	6	355833	355838	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_011274	CGC	2	6	355855	355860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1575	NC_011274	TCG	2	6	355863	355868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1576	NC_011274	GC	3	6	355913	355918	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1577	NC_011274	TTCTCA	2	12	357089	357100	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1578	NC_011274	AGG	2	6	357111	357116	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1579	NC_011274	TCA	2	6	357118	357123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1580	NC_011274	T	6	6	357210	357215	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1581	NC_011274	GGT	2	6	360616	360621	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_011274	GTA	2	6	360710	360715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1583	NC_011274	CAG	2	6	361308	361313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1584	NC_011274	AGG	2	6	361381	361386	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_011274	CTG	2	6	363101	363106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1586	NC_011274	ATC	2	6	363182	363187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1587	NC_011274	TGAT	2	8	363222	363229	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1588	NC_011274	ATA	2	6	363266	363271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1589	NC_011274	GACG	2	8	363357	363364	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1590	NC_011274	CCG	2	6	363426	363431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1591	NC_011274	GA	3	6	363573	363578	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1592	NC_011274	GCC	2	6	363608	363613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1593	NC_011274	GTAAG	2	10	363694	363703	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
1594	NC_011274	GAA	2	6	363725	363730	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1595	NC_011274	CGC	2	6	363802	363807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1596	NC_011274	GC	3	6	363850	363855	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1597	NC_011274	T	6	6	363922	363927	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1598	NC_011274	TTA	2	6	363951	363956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_011274	AACG	2	8	364030	364037	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1600	NC_011274	TTA	2	6	364113	364118	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1601	NC_011274	CGG	2	6	364138	364143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1602	NC_011274	GAT	2	6	364163	364168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_011274	CAC	2	6	364172	364177	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1604	NC_011274	A	6	6	364250	364255	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_011274	T	8	8	364306	364313	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_011274	A	7	7	364314	364320	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1607	NC_011274	TTG	2	6	364330	364335	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_011274	TAA	2	6	364339	364344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_011274	CCG	2	6	364357	364362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1610	NC_011274	CAA	2	6	364383	364388	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1611	NC_011274	GTT	2	6	364410	364415	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_011274	AC	3	6	366947	366952	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1613	NC_011274	AGC	2	6	366985	366990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1614	NC_011274	TAT	2	6	367025	367030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1615	NC_011274	T	6	6	367102	367107	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1616	NC_011274	CCGT	2	8	367116	367123	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1617	NC_011274	CGC	2	6	367226	367231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1618	NC_011274	GT	3	6	367362	367367	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_011274	CGA	2	6	367371	367376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1620	NC_011274	TCG	2	6	367399	367404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1621	NC_011274	CACC	2	8	367411	367418	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
1622	NC_011274	CGGA	2	8	367502	367509	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1623	NC_011274	CGCC	2	8	367526	367533	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1624	NC_011274	GCC	2	6	367554	367559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1625	NC_011274	GTT	2	6	367627	367632	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1626	NC_011274	GAC	2	6	367655	367660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1627	NC_011274	TGA	2	6	367701	367706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1628	NC_011274	CATGA	2	10	368194	368203	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1629	NC_011274	TCT	2	6	368223	368228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1630	NC_011274	CG	3	6	368251	368256	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1631	NC_011274	GCG	2	6	368308	368313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1632	NC_011274	GGT	2	6	368392	368397	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1633	NC_011274	TGGCTG	2	12	368411	368422	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
1634	NC_011274	ACG	2	6	368431	368436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1636	NC_011274	A	6	6	368609	368614	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1909	NC_011274	T	6	6	415724	415729	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1952	NC_011274	TTG	2	6	431336	431341	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1954	NC_011274	ATG	2	6	433542	433547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1971	NC_011274	GTT	2	6	435565	435570	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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