MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum str. 287/91 chromosome

Total Repeats: 19633

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_011274	GGT	2	6	292740	292745	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_011274	GGT	2	6	292775	292780	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_011274	AGG	2	6	292954	292959	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_011274	CCA	2	6	292984	292989	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1005	NC_011274	A	6	6	293007	293012	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_011274	AAC	2	6	293094	293099	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1007	NC_011274	GTT	2	6	293104	293109	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_011274	TC	3	6	293116	293121	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1009	NC_011274	GAT	2	6	293137	293142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_011274	GCG	2	6	293416	293421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1011	NC_011274	GAG	2	6	293432	293437	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_011274	TG	3	6	293457	293462	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_011274	GC	3	6	293484	293489	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1014	NC_011274	G	6	6	293577	293582	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_011274	TCC	2	6	293587	293592	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1016	NC_011274	CTGA	2	8	293607	293614	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1017	NC_011274	GTAC	2	8	293691	293698	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1018	NC_011274	TG	3	6	293723	293728	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_011274	GGA	2	6	293898	293903	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_011274	AC	3	6	294116	294121	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1021	NC_011274	CGTC	2	8	294134	294141	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1022	NC_011274	AAC	2	6	294153	294158	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1023	NC_011274	AGC	2	6	294243	294248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1024	NC_011274	CAT	2	6	294249	294254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1025	NC_011274	AAAG	2	8	294257	294264	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_011274	AGCGA	2	10	294383	294392	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
1027	NC_011274	AGTCG	2	10	294410	294419	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1028	NC_011274	CGTT	2	8	294431	294438	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1029	NC_011274	G	6	6	294675	294680	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_011274	GT	4	8	294733	294740	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_011274	GAC	2	6	294777	294782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1032	NC_011274	CAA	2	6	294803	294808	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1033	NC_011274	GGT	2	6	294875	294880	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_011274	GA	3	6	294905	294910	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_011274	AGTC	2	8	295001	295008	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1036	NC_011274	GCTG	2	8	295019	295026	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1037	NC_011274	TTA	2	6	295034	295039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_011274	CGG	2	6	295158	295163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1039	NC_011274	ATG	2	6	295234	295239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_011274	ACC	2	6	295429	295434	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1041	NC_011274	TGG	2	6	295489	295494	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_011274	TCC	2	6	295515	295520	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1043	NC_011274	GGA	2	6	295532	295537	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_011274	AGG	2	6	295570	295575	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_011274	GGT	2	6	295652	295657	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_011274	CGG	2	6	295739	295744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1047	NC_011274	TCA	2	6	295767	295772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1048	NC_011274	CGT	2	6	295847	295852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1049	NC_011274	G	6	6	295896	295901	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_011274	GAC	3	9	296078	296086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1051	NC_011274	GT	3	6	296100	296105	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_011274	GA	3	6	296187	296192	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_011274	CAG	2	6	296200	296205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1054	NC_011274	GCA	3	9	296236	296244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1055	NC_011274	GGC	2	6	296246	296251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1056	NC_011274	AAGGA	2	10	296257	296266	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_011274	CGC	2	6	296311	296316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1058	NC_011274	GGC	2	6	296360	296365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1059	NC_011274	GGT	2	6	296374	296379	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_011274	ACT	2	6	296512	296517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1061	NC_011274	AG	3	6	296522	296527	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_011274	GCA	2	6	296559	296564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1063	NC_011274	CCTG	2	8	296691	296698	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1064	NC_011274	CCGT	2	8	296726	296733	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1065	NC_011274	TTA	2	6	296742	296747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_011274	ATT	2	6	296794	296799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_011274	AAATT	2	10	298660	298669	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_011274	CTG	2	6	298728	298733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1069	NC_011274	ATT	2	6	299924	299929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_011274	ACAAA	2	10	299947	299956	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
1071	NC_011274	AGTG	2	8	299975	299982	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_011274	A	6	6	300059	300064	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_011274	TGC	2	6	300893	300898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1074	NC_011274	GCG	2	6	301726	301731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1075	NC_011274	TCG	2	6	301745	301750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1076	NC_011274	GAC	2	6	303150	303155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1077	NC_011274	AAT	2	6	303966	303971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_011274	ATC	2	6	305993	305998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1079	NC_011274	GCA	2	6	306014	306019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1080	NC_011274	CCTG	2	8	306129	306136	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1081	NC_011274	CCGT	2	8	306164	306171	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1082	NC_011274	T	6	6	306226	306231	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_011274	TA	3	6	307178	307183	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_011274	GGT	2	6	307234	307239	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_011274	ATC	2	6	307275	307280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1086	NC_011274	TGC	2	6	307319	307324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1087	NC_011274	TCG	2	6	307341	307346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1088	NC_011274	GAT	2	6	307355	307360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_011274	CAGC	2	8	307388	307395	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1090	NC_011274	CTT	2	6	307414	307419	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1091	NC_011274	CGGG	2	8	308298	308305	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1092	NC_011274	TGG	2	6	308340	308345	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_011274	CTGAA	2	10	311281	311290	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1094	NC_011274	TGG	2	6	312999	313004	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_011274	AGC	2	6	313009	313014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1096	NC_011274	ATTA	2	8	313309	313316	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_011274	TAA	2	6	313324	313329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_011274	TAA	2	6	313332	313337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_011274	CA	3	6	313338	313343	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1100	NC_011274	TAAA	2	8	313806	313813	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_011274	C	6	6	313849	313854	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1102	NC_011274	TTA	2	6	313883	313888	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_011274	GCT	2	6	313971	313976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1104	NC_011274	CAT	2	6	313990	313995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1105	NC_011274	ATT	2	6	314023	314028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_011274	GTT	2	6	315576	315581	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_011274	TAA	2	6	316886	316891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_011274	TTAA	2	8	316896	316903	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_011274	AAG	2	6	316971	316976	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_011274	TG	3	6	316979	316984	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_011274	GTG	2	6	317000	317005	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_011274	TGG	2	6	317019	317024	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_011274	ATC	2	6	317067	317072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1114	NC_011274	TGA	2	6	317112	317117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_011274	AGA	2	6	317132	317137	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_011274	CG	3	6	317154	317159	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1117	NC_011274	ACC	2	6	317170	317175	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1118	NC_011274	CACG	2	8	317180	317187	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1119	NC_011274	GCG	2	6	317207	317212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1120	NC_011274	ACG	2	6	317222	317227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1121	NC_011274	TGACC	2	10	317286	317295	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1122	NC_011274	TGG	2	6	317339	317344	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_011274	CAT	2	6	317364	317369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1124	NC_011274	CCA	2	6	317375	317380	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1125	NC_011274	GGC	2	6	317454	317459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1126	NC_011274	CTG	3	9	317481	317489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1127	NC_011274	CTG	3	9	317568	317576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1128	NC_011274	ACT	2	6	317603	317608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1129	NC_011274	GTC	2	6	317628	317633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1130	NC_011274	GCA	2	6	317669	317674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1131	NC_011274	CAA	2	6	317738	317743	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1132	NC_011274	TCA	2	6	317744	317749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1133	NC_011274	GAC	2	6	317756	317761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1134	NC_011274	GCA	2	6	317780	317785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1135	NC_011274	ATG	2	6	317881	317886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1137	NC_011274	A	6	6	318023	318028	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1138	NC_011274	TGA	2	6	318072	318077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1141	NC_011274	TGA	2	6	318106	318111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1143	NC_011274	A	7	7	318236	318242	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1145	NC_011274	CTGA	2	8	318328	318335	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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1155	NC_011274	TCA	2	6	318986	318991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1168	NC_011274	AGA	2	6	319553	319558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1398	NC_011274	CGC	2	6	336094	336099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1399	NC_011274	GGT	2	6	336119	336124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1403	NC_011274	GTGA	2	8	336237	336244	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1407	NC_011274	ATAGAT	2	12	336451	336462	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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1409	NC_011274	CA	3	6	336595	336600	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1410	NC_011274	TGC	2	6	336630	336635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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