MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum str. 287/91 chromosome

Total Repeats: 19633

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_011274	ATG	2	6	122000	122005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
502	NC_011274	TCA	2	6	122089	122094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
503	NC_011274	AC	3	6	122104	122109	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
504	NC_011274	GGC	2	6	122896	122901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
505	NC_011274	CGG	2	6	126081	126086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
506	NC_011274	T	7	7	126166	126172	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_011274	GC	4	8	126274	126281	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
508	NC_011274	TAGTG	2	10	126312	126321	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
509	NC_011274	TTG	2	6	126325	126330	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
510	NC_011274	GCA	2	6	126335	126340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
511	NC_011274	TAT	2	6	128048	128053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_011274	AAT	2	6	128068	128073	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_011274	AAGAGG	2	12	128089	128100	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
514	NC_011274	A	6	6	128143	128148	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_011274	CTGG	2	8	128153	128160	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
516	NC_011274	GC	3	6	128170	128175	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
517	NC_011274	CAT	2	6	128242	128247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
518	NC_011274	CAG	2	6	128292	128297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
519	NC_011274	ATA	2	6	128298	128303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_011274	CTG	2	6	128305	128310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
521	NC_011274	T	7	7	128313	128319	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_011274	GAC	2	6	128339	128344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
523	NC_011274	CGG	2	6	128374	128379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
524	NC_011274	TGA	2	6	128398	128403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
525	NC_011274	T	8	8	128469	128476	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_011274	ATC	2	6	128483	128488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
527	NC_011274	T	7	7	128558	128564	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_011274	GCA	2	6	128665	128670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
529	NC_011274	A	7	7	128727	128733	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_011274	TGC	2	6	128766	128771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_011274	AGAT	2	8	128829	128836	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
532	NC_011274	A	7	7	133605	133611	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_011274	TTTG	2	8	133631	133638	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
534	NC_011274	TTG	2	6	133826	133831	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
535	NC_011274	TTTG	2	8	133942	133949	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
536	NC_011274	GGATAA	2	12	134049	134060	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
537	NC_011274	TAA	2	6	134096	134101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_011274	TTGC	2	8	134177	134184	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
539	NC_011274	ATT	2	6	134340	134345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_011274	TA	3	6	135403	135408	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_011274	A	6	6	135408	135413	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_011274	TCG	2	6	135446	135451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
543	NC_011274	ATT	2	6	135496	135501	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_011274	TCT	2	6	135540	135545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
545	NC_011274	CTT	2	6	135546	135551	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
546	NC_011274	CCT	2	6	135553	135558	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
547	NC_011274	ATT	2	6	135560	135565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_011274	AGCG	2	8	135614	135621	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
549	NC_011274	TGA	2	6	135643	135648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
550	NC_011274	TGT	2	6	135679	135684	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
551	NC_011274	GTC	2	6	135699	135704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
552	NC_011274	GAC	2	6	137906	137911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
553	NC_011274	CAGG	2	8	137976	137983	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
554	NC_011274	CCCAA	2	10	138015	138024	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
555	NC_011274	T	8	8	138040	138047	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_011274	CGG	2	6	139184	139189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
557	NC_011274	CT	3	6	139199	139204	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
558	NC_011274	GCC	2	6	139208	139213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
559	NC_011274	CAAA	2	8	139216	139223	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
560	NC_011274	AAT	2	6	139249	139254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_011274	T	6	6	139287	139292	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_011274	CTTT	2	8	139298	139305	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
563	NC_011274	TTGTT	2	10	139362	139371	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
564	NC_011274	TCG	2	6	139388	139393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
565	NC_011274	CGG	2	6	139568	139573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
566	NC_011274	T	7	7	139585	139591	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_011274	T	6	6	139673	139678	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_011274	CTTG	2	8	139698	139705	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
569	NC_011274	TCC	2	6	139715	139720	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
570	NC_011274	AAG	2	6	139765	139770	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
571	NC_011274	TC	3	6	148562	148567	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
572	NC_011274	CG	3	6	148584	148589	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
573	NC_011274	CCT	2	6	148603	148608	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
574	NC_011274	GCG	2	6	148622	148627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
575	NC_011274	AAT	2	6	150904	150909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
576	NC_011274	GCC	2	6	155470	155475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
577	NC_011274	GA	4	8	155510	155517	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
578	NC_011274	CCG	2	6	156718	156723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
579	NC_011274	TC	3	6	157733	157738	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
580	NC_011274	T	8	8	157758	157765	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
581	NC_011274	CTG	2	6	157877	157882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
582	NC_011274	TTA	2	6	158028	158033	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
583	NC_011274	A	6	6	158468	158473	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_011274	CGCGG	2	10	158499	158508	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
585	NC_011274	ATT	2	6	161291	161296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
586	NC_011274	T	6	6	161364	161369	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
587	NC_011274	CAA	2	6	161377	161382	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
588	NC_011274	GGCA	2	8	162831	162838	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
589	NC_011274	CTA	2	6	165473	165478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
590	NC_011274	A	7	7	165510	165516	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
591	NC_011274	CTGG	2	8	166664	166671	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
592	NC_011274	AAT	2	6	169867	169872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_011274	CGG	2	6	170751	170756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
594	NC_011274	GTCG	2	8	170796	170803	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
595	NC_011274	GGC	2	6	170822	170827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
596	NC_011274	AGC	2	6	170882	170887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
597	NC_011274	CAC	2	6	170894	170899	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
598	NC_011274	ATC	2	6	171550	171555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
599	NC_011274	TGC	2	6	172358	172363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
600	NC_011274	GAT	2	6	174798	174803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
601	NC_011274	ATT	2	6	174811	174816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NC_011274	T	8	8	174828	174835	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_011274	CGC	2	6	174850	174855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
604	NC_011274	AGT	2	6	176372	176377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
605	NC_011274	GT	3	6	176380	176385	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
606	NC_011274	ATTT	2	8	176413	176420	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
607	NC_011274	T	7	7	176430	176436	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_011274	AAT	2	6	176469	176474	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_011274	TGA	2	6	176512	176517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
610	NC_011274	AAAG	2	8	176530	176537	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
611	NC_011274	CCT	2	6	176550	176555	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
612	NC_011274	ATT	2	6	176593	176598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
613	NC_011274	T	6	6	176647	176652	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_011274	CCT	2	6	176754	176759	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
615	NC_011274	TCAA	2	8	176769	176776	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
616	NC_011274	T	6	6	177644	177649	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
617	NC_011274	AGA	2	6	177667	177672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
618	NC_011274	TGT	2	6	177673	177678	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
619	NC_011274	TTA	2	6	177725	177730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
620	NC_011274	TAGA	2	8	177781	177788	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
621	NC_011274	CGGC	2	8	182383	182390	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
622	NC_011274	T	8	8	182391	182398	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_011274	TTA	2	6	182423	182428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
624	NC_011274	TGT	2	6	182455	182460	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
625	NC_011274	GAT	2	6	182513	182518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
626	NC_011274	CCG	2	6	182539	182544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
627	NC_011274	TCT	2	6	183991	183996	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_011274	A	6	6	184023	184028	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_011274	T	7	7	184045	184051	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
630	NC_011274	ATG	2	6	184077	184082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
631	NC_011274	GCA	2	6	184119	184124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
632	NC_011274	TGTC	2	8	184162	184169	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
633	NC_011274	TCA	2	6	184218	184223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
634	NC_011274	ATA	2	6	184248	184253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
635	NC_011274	TC	3	6	187032	187037	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
636	NC_011274	TGCC	2	8	187067	187074	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
637	NC_011274	T	6	6	187244	187249	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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639	NC_011274	CTA	2	6	187327	187332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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785	NC_011274	ATT	2	6	211026	211031	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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792	NC_011274	A	7	7	211169	211175	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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947	NC_011274	GCAG	2	8	276090	276097	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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