MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum str. 287/91 chromosome

Total Repeats: 19633

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_011274	AG	3	6	1481742	1481747	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6002	NC_011274	AAT	2	6	1481777	1481782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6003	NC_011274	GCTCT	2	10	1481853	1481862	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
6004	NC_011274	CAA	2	6	1481904	1481909	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6005	NC_011274	TGCG	2	8	1481931	1481938	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6006	NC_011274	ATG	2	6	1482004	1482009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6007	NC_011274	TAT	2	6	1482075	1482080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6008	NC_011274	CGC	2	6	1482081	1482086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6009	NC_011274	AAAG	2	8	1484105	1484112	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6010	NC_011274	GAA	3	9	1484272	1484280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6011	NC_011274	GAGC	2	8	1484316	1484323	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6012	NC_011274	GCA	2	6	1486326	1486331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6013	NC_011274	CGC	2	6	1486406	1486411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6014	NC_011274	A	6	6	1486468	1486473	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6015	NC_011274	GCG	2	6	1486477	1486482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6016	NC_011274	GTC	3	9	1486557	1486565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6017	NC_011274	TGA	2	6	1486580	1486585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6018	NC_011274	GGTTG	2	10	1486606	1486615	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
6019	NC_011274	GGC	2	6	1486632	1486637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6020	NC_011274	GATG	2	8	1486654	1486661	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6021	NC_011274	GAG	2	6	1486663	1486668	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6022	NC_011274	AAG	2	6	1486686	1486691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6023	NC_011274	GT	3	6	1486703	1486708	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6024	NC_011274	CAT	2	6	1486774	1486779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6025	NC_011274	GCC	2	6	1486803	1486808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6026	NC_011274	GGA	2	6	1486826	1486831	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6027	NC_011274	GGC	2	6	1486846	1486851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6028	NC_011274	GCC	2	6	1486854	1486859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6029	NC_011274	CG	3	6	1486883	1486888	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6030	NC_011274	CGC	2	6	1486960	1486965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6031	NC_011274	TGAT	2	8	1487000	1487007	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6032	NC_011274	CT	4	8	1487132	1487139	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6033	NC_011274	GCG	2	6	1487160	1487165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6034	NC_011274	CG	3	6	1487171	1487176	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6035	NC_011274	ATA	2	6	1487179	1487184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6036	NC_011274	GCG	2	6	1487216	1487221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6037	NC_011274	A	6	6	1487375	1487380	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6038	NC_011274	GAC	2	6	1487429	1487434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6039	NC_011274	CGAT	2	8	1487517	1487524	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6040	NC_011274	TA	3	6	1487618	1487623	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6041	NC_011274	GTGA	2	8	1487636	1487643	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6042	NC_011274	GCA	2	6	1487654	1487659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6043	NC_011274	GCC	2	6	1487667	1487672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6044	NC_011274	TAA	2	6	1487676	1487681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6045	NC_011274	T	6	6	1488509	1488514	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6046	NC_011274	ATT	2	6	1488551	1488556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6047	NC_011274	GT	3	6	1488594	1488599	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6048	NC_011274	CCG	2	6	1488612	1488617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6049	NC_011274	CCA	2	6	1488815	1488820	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6050	NC_011274	AAT	2	6	1488927	1488932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6051	NC_011274	T	6	6	1488936	1488941	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6052	NC_011274	TATT	2	8	1488961	1488968	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6053	NC_011274	AGT	2	6	1489018	1489023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6054	NC_011274	TAT	2	6	1489055	1489060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6055	NC_011274	ATC	2	6	1489149	1489154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6056	NC_011274	ATA	2	6	1489156	1489161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6057	NC_011274	T	6	6	1489174	1489179	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6058	NC_011274	T	6	6	1489202	1489207	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6059	NC_011274	AT	3	6	1489213	1489218	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6060	NC_011274	A	7	7	1489273	1489279	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6061	NC_011274	TC	3	6	1489305	1489310	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6062	NC_011274	CTT	2	6	1489358	1489363	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6063	NC_011274	AT	3	6	1489366	1489371	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6064	NC_011274	TAC	3	9	1489449	1489457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6065	NC_011274	T	6	6	1489516	1489521	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6066	NC_011274	TAA	2	6	1489543	1489548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6067	NC_011274	CCG	2	6	1489589	1489594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6068	NC_011274	GTA	2	6	1489605	1489610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6069	NC_011274	CGCC	2	8	1489659	1489666	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6070	NC_011274	TGA	2	6	1489678	1489683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6071	NC_011274	GCG	2	6	1489686	1489691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6072	NC_011274	TTA	2	6	1489737	1489742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6073	NC_011274	A	7	7	1489785	1489791	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6074	NC_011274	ATG	2	6	1489833	1489838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6075	NC_011274	TGT	2	6	1489843	1489848	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6076	NC_011274	AGTA	2	8	1489928	1489935	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6077	NC_011274	CAT	2	6	1489978	1489983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6080	NC_011274	CTT	2	6	1490084	1490089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6081	NC_011274	G	6	6	1490097	1490102	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6082	NC_011274	TTCTT	2	10	1490154	1490163	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
6083	NC_011274	CAA	2	6	1490226	1490231	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6087	NC_011274	A	7	7	1490449	1490455	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6088	NC_011274	ATT	2	6	1490521	1490526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6089	NC_011274	AAC	2	6	1490650	1490655	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6090	NC_011274	CGT	2	6	1490723	1490728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6092	NC_011274	GTA	2	6	1490745	1490750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6093	NC_011274	AGA	2	6	1490772	1490777	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6094	NC_011274	AT	3	6	1490821	1490826	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6095	NC_011274	T	8	8	1490829	1490836	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6096	NC_011274	T	6	6	1490843	1490848	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6097	NC_011274	AT	3	6	1490849	1490854	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6098	NC_011274	ATTG	2	8	1490866	1490873	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6099	NC_011274	AGTGG	2	10	1490912	1490921	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
6100	NC_011274	GCA	2	6	1495135	1495140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6101	NC_011274	ATG	2	6	1495174	1495179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6102	NC_011274	GCG	2	6	1495189	1495194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6103	NC_011274	GCG	2	6	1495198	1495203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6104	NC_011274	GAA	2	6	1495238	1495243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6105	NC_011274	CAGCAA	2	12	1495253	1495264	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
6106	NC_011274	GTC	2	6	1497025	1497030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6107	NC_011274	CAC	2	6	1498059	1498064	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6108	NC_011274	T	6	6	1498072	1498077	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6109	NC_011274	AAT	2	6	1498096	1498101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6110	NC_011274	GC	3	6	1498131	1498136	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6111	NC_011274	GGC	2	6	1498876	1498881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6112	NC_011274	TCA	2	6	1498900	1498905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6113	NC_011274	ATA	2	6	1499764	1499769	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6114	NC_011274	GT	3	6	1499792	1499797	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6115	NC_011274	GTT	2	6	1500190	1500195	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6116	NC_011274	TC	3	6	1500198	1500203	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6117	NC_011274	ATA	2	6	1500214	1500219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6118	NC_011274	TTA	2	6	1500252	1500257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6119	NC_011274	T	6	6	1500258	1500263	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6120	NC_011274	CGC	2	6	1502778	1502783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6121	NC_011274	TTG	2	6	1502815	1502820	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6122	NC_011274	TCCT	2	8	1502827	1502834	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6123	NC_011274	ATC	2	6	1502854	1502859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6124	NC_011274	ATT	2	6	1502873	1502878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6125	NC_011274	A	7	7	1504436	1504442	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6126	NC_011274	CTT	2	6	1504463	1504468	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6127	NC_011274	GTA	2	6	1504489	1504494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6128	NC_011274	CAG	2	6	1504511	1504516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6129	NC_011274	ATT	2	6	1505081	1505086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6130	NC_011274	ATC	2	6	1506848	1506853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6132	NC_011274	AAT	2	6	1506964	1506969	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6399	NC_011274	AGTGC	2	10	1553137	1553146	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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