MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum str. 287/91 chromosome

Total Repeats: 19633

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_011274	TTC	2	6	1281752	1281757	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5002	NC_011274	TTAA	2	8	1281778	1281785	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5003	NC_011274	TAT	2	6	1281791	1281796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5004	NC_011274	AATA	2	8	1281817	1281824	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5005	NC_011274	TCC	2	6	1281825	1281830	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5006	NC_011274	GGA	2	6	1281840	1281845	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5007	NC_011274	TATT	2	8	1281846	1281853	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5008	NC_011274	CA	3	6	1281879	1281884	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5009	NC_011274	CTG	2	6	1281966	1281971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5010	NC_011274	TGT	2	6	1282005	1282010	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5011	NC_011274	T	6	6	1282030	1282035	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5012	NC_011274	TTA	2	6	1282750	1282755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5013	NC_011274	CAAT	2	8	1282814	1282821	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5014	NC_011274	CAACC	2	10	1282943	1282952	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
5015	NC_011274	TCAC	2	8	1282956	1282963	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5016	NC_011274	ATC	2	6	1282981	1282986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5017	NC_011274	T	6	6	1284344	1284349	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5018	NC_011274	GGT	2	6	1284412	1284417	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5019	NC_011274	T	6	6	1284421	1284426	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5020	NC_011274	GTT	2	6	1285023	1285028	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5021	NC_011274	CAGGG	2	10	1287106	1287115	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
5022	NC_011274	CAT	2	6	1287175	1287180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5023	NC_011274	GTCA	2	8	1287189	1287196	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5024	NC_011274	GGA	2	6	1287214	1287219	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5025	NC_011274	AAT	2	6	1287266	1287271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5026	NC_011274	T	7	7	1290898	1290904	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5027	NC_011274	T	7	7	1293295	1293301	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5028	NC_011274	CGG	2	6	1293754	1293759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5029	NC_011274	TCA	2	6	1294044	1294049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5030	NC_011274	CGAT	2	8	1297450	1297457	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5031	NC_011274	CTG	3	9	1297480	1297488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5032	NC_011274	AAT	2	6	1297510	1297515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5033	NC_011274	A	7	7	1297517	1297523	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5034	NC_011274	T	6	6	1298101	1298106	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5035	NC_011274	T	6	6	1298692	1298697	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5036	NC_011274	TAA	2	6	1298718	1298723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5037	NC_011274	ATAA	2	8	1298745	1298752	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5038	NC_011274	TC	3	6	1298760	1298765	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5039	NC_011274	ACA	2	6	1300823	1300828	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5040	NC_011274	CGG	2	6	1300855	1300860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5041	NC_011274	TTAT	2	8	1300866	1300873	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_011274	CA	3	6	1300945	1300950	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5043	NC_011274	TGAT	2	8	1300962	1300969	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5044	NC_011274	TAA	2	6	1301026	1301031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5045	NC_011274	GGT	2	6	1301038	1301043	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5046	NC_011274	CAC	2	6	1301103	1301108	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5047	NC_011274	TGT	2	6	1301194	1301199	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5048	NC_011274	TGC	2	6	1301244	1301249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5049	NC_011274	TCC	2	6	1301282	1301287	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5050	NC_011274	CTG	2	6	1301294	1301299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5051	NC_011274	CACAA	2	10	1301362	1301371	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
5052	NC_011274	CCG	2	6	1301402	1301407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5053	NC_011274	CAC	2	6	1301449	1301454	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5054	NC_011274	GTC	2	6	1301482	1301487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5055	NC_011274	ATC	2	6	1301498	1301503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5056	NC_011274	CTG	2	6	1301543	1301548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5057	NC_011274	CAGC	2	8	1301569	1301576	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5058	NC_011274	ACC	2	6	1301592	1301597	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5059	NC_011274	GTG	2	6	1301704	1301709	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5060	NC_011274	ACCC	2	8	1301726	1301733	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
5061	NC_011274	G	9	9	1301759	1301767	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5062	NC_011274	CGGA	2	8	1301825	1301832	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5063	NC_011274	GGC	2	6	1301836	1301841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5064	NC_011274	ACC	2	6	1301875	1301880	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5065	NC_011274	GTG	2	6	1302013	1302018	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5066	NC_011274	GGCG	2	8	1302019	1302026	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5067	NC_011274	TGGC	2	8	1302099	1302106	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5068	NC_011274	TGG	2	6	1302122	1302127	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5069	NC_011274	CTG	2	6	1302163	1302168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5070	NC_011274	TGA	3	9	1302227	1302235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5071	NC_011274	GCT	2	6	1302240	1302245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5072	NC_011274	ATT	2	6	1302307	1302312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5073	NC_011274	GTCG	2	8	1302342	1302349	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5074	NC_011274	GCG	2	6	1302422	1302427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5075	NC_011274	CCA	2	6	1302428	1302433	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5076	NC_011274	GGT	2	6	1302504	1302509	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5077	NC_011274	CCCT	2	8	1302565	1302572	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
5078	NC_011274	GCC	2	6	1302578	1302583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5079	NC_011274	TGCG	2	8	1302592	1302599	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5080	NC_011274	GAC	2	6	1302613	1302618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5081	NC_011274	GCA	2	6	1302642	1302647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5082	NC_011274	ACC	2	6	1302706	1302711	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5083	NC_011274	ATT	2	6	1302718	1302723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5084	NC_011274	CCGC	2	8	1302724	1302731	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5085	NC_011274	GCA	2	6	1302735	1302740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5086	NC_011274	CGC	2	6	1302800	1302805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5087	NC_011274	GGT	2	6	1302807	1302812	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5088	NC_011274	CGA	2	6	1302890	1302895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5089	NC_011274	GCA	2	6	1302975	1302980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5090	NC_011274	CGC	2	6	1303073	1303078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5091	NC_011274	GCC	2	6	1303144	1303149	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5092	NC_011274	ATG	2	6	1303220	1303225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5093	NC_011274	CTGG	2	8	1303252	1303259	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5094	NC_011274	T	7	7	1303320	1303326	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5095	NC_011274	A	8	8	1303369	1303376	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5096	NC_011274	GGA	2	6	1303387	1303392	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5097	NC_011274	CAA	2	6	1303409	1303414	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5098	NC_011274	TGG	2	6	1303560	1303565	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5099	NC_011274	CGG	2	6	1303566	1303571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5100	NC_011274	ATGA	2	8	1303646	1303653	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5101	NC_011274	GC	3	6	1303674	1303679	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5102	NC_011274	TCC	2	6	1303702	1303707	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5103	NC_011274	AG	3	6	1303844	1303849	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5104	NC_011274	CGA	2	6	1303902	1303907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5105	NC_011274	ACG	2	6	1303908	1303913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5106	NC_011274	GCA	2	6	1303917	1303922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5107	NC_011274	CGG	2	6	1304052	1304057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5108	NC_011274	CGT	2	6	1304101	1304106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5109	NC_011274	TC	3	6	1304148	1304153	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5110	NC_011274	TGAA	2	8	1304525	1304532	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5111	NC_011274	GCGG	2	8	1304547	1304554	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5112	NC_011274	T	6	6	1304557	1304562	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5113	NC_011274	ACG	2	6	1304664	1304669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5114	NC_011274	TGG	2	6	1304761	1304766	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5115	NC_011274	TTA	2	6	1304794	1304799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5116	NC_011274	GAT	2	6	1304808	1304813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5117	NC_011274	GAC	2	6	1304859	1304864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5118	NC_011274	GCG	2	6	1304882	1304887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5119	NC_011274	TGG	2	6	1304899	1304904	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5120	NC_011274	AAG	2	6	1304905	1304910	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5121	NC_011274	CCG	2	6	1304947	1304952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5122	NC_011274	GGCA	2	8	1304956	1304963	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5123	NC_011274	CAG	2	6	1304983	1304988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5124	NC_011274	GCC	2	6	1305012	1305017	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5125	NC_011274	TCA	2	6	1305021	1305026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5126	NC_011274	CGC	3	9	1305047	1305055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5127	NC_011274	GGC	2	6	1305077	1305082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5128	NC_011274	CTG	2	6	1305094	1305099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5129	NC_011274	AGC	3	9	1305104	1305112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5130	NC_011274	AGA	2	6	1305122	1305127	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5131	NC_011274	AGA	2	6	1305143	1305148	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5132	NC_011274	A	6	6	1305189	1305194	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5133	NC_011274	GTTAA	2	10	1305201	1305210	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
5134	NC_011274	ACTG	2	8	1305314	1305321	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5135	NC_011274	GTTG	2	8	1305407	1305414	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5136	NC_011274	AGC	2	6	1305505	1305510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5139	NC_011274	ACTG	2	8	1305737	1305744	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5140	NC_011274	ACA	2	6	1305790	1305795	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5147	NC_011274	CGG	2	6	1306310	1306315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5149	NC_011274	GGA	2	6	1306419	1306424	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5152	NC_011274	TGC	2	6	1307140	1307145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5159	NC_011274	T	6	6	1308095	1308100	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5202	NC_011274	TTCTG	2	10	1311271	1311280	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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5244	NC_011274	AAAT	2	8	1313148	1313155	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5245	NC_011274	GTT	2	6	1313171	1313176	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5250	NC_011274	ATTT	2	8	1313308	1313315	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5253	NC_011274	GC	3	6	1313374	1313379	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5254	NC_011274	GGAA	2	8	1313968	1313975	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5255	NC_011274	TGTT	2	8	1313988	1313995	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5256	NC_011274	CGG	2	6	1314012	1314017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5257	NC_011274	ACA	2	6	1314061	1314066	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5258	NC_011274	TGGC	2	8	1314110	1314117	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5259	NC_011274	T	6	6	1314130	1314135	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5260	NC_011274	TCG	2	6	1314138	1314143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5261	NC_011274	ACC	3	9	1314234	1314242	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5262	NC_011274	AG	3	6	1314269	1314274	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5263	NC_011274	GGC	2	6	1314307	1314312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5265	NC_011274	CCCA	2	8	1314332	1314339	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
5266	NC_011274	TTCT	2	8	1314349	1314356	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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5396	NC_011274	TTAT	2	8	1324508	1324515	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5397	NC_011274	TGC	2	6	1324980	1324985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5398	NC_011274	AT	3	6	1325034	1325039	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5399	NC_011274	AC	3	6	1325056	1325061	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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