MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853 chromosome

Total Repeats: 16792

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_011205	TG	3	6	342569	342574	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_011205	TAT	2	6	342575	342580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_011205	TG	3	6	342585	342590	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_011205	CTG	2	6	342612	342617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1005	NC_011205	CTT	2	6	342698	342703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1006	NC_011205	TAA	2	6	342730	342735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_011205	G	6	6	342792	342797	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_011205	GAA	2	6	343392	343397	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_011205	TAT	2	6	343407	343412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_011205	TTA	2	6	343537	343542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_011205	TTA	2	6	343575	343580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_011205	AAT	2	6	343599	343604	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_011205	TGCT	2	8	343655	343662	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1014	NC_011205	TAC	2	6	343710	343715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1015	NC_011205	ATTA	2	8	343752	343759	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_011205	TGA	2	6	343791	343796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_011205	CTGTTG	2	12	343799	343810	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
1018	NC_011205	TGA	2	6	343824	343829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_011205	GGTT	2	8	343857	343864	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_011205	TTA	2	6	343883	343888	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_011205	AAT	2	6	343890	343895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_011205	GGA	2	6	343961	343966	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_011205	TC	3	6	344284	344289	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1024	NC_011205	ATC	2	6	344341	344346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1025	NC_011205	AATC	2	8	344353	344360	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1026	NC_011205	ATC	2	6	344411	344416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1027	NC_011205	CGGA	2	8	344440	344447	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1028	NC_011205	CGT	2	6	344669	344674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1029	NC_011205	TGT	2	6	344689	344694	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_011205	TGA	2	6	344695	344700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_011205	TGC	2	6	344804	344809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1032	NC_011205	GAA	2	6	344904	344909	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_011205	TCA	2	6	344918	344923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1034	NC_011205	AAC	2	6	345080	345085	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1035	NC_011205	GCT	2	6	345189	345194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1036	NC_011205	AAGG	2	8	345259	345266	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_011205	GTCA	2	8	345306	345313	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1038	NC_011205	TAA	2	6	345414	345419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_011205	ATGT	2	8	345440	345447	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_011205	CT	3	6	345488	345493	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1041	NC_011205	TATTC	2	10	345586	345595	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1042	NC_011205	ACA	2	6	345603	345608	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1043	NC_011205	T	7	7	345650	345656	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_011205	AT	3	6	345676	345681	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_011205	TTA	2	6	345739	345744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_011205	TGC	2	6	345910	345915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1047	NC_011205	ATG	2	6	346029	346034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_011205	AGTT	2	8	346057	346064	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_011205	G	6	6	346092	346097	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_011205	AAC	2	6	346348	346353	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1051	NC_011205	AGA	2	6	346647	346652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_011205	GCC	2	6	346683	346688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1053	NC_011205	CAG	2	6	346711	346716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1054	NC_011205	TAT	2	6	346728	346733	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_011205	TGG	2	6	346740	346745	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_011205	AGG	2	6	346790	346795	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_011205	ACC	2	6	346797	346802	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1058	NC_011205	CAA	2	6	346953	346958	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1059	NC_011205	ACCCC	2	10	346973	346982	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
1060	NC_011205	C	6	6	347046	347051	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1061	NC_011205	GTG	2	6	347089	347094	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_011205	ATT	2	6	347109	347114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_011205	GGT	2	6	347124	347129	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_011205	GA	3	6	349709	349714	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_011205	TAC	2	6	350205	350210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1066	NC_011205	TGAT	2	8	350318	350325	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_011205	T	7	7	350346	350352	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_011205	AAT	2	6	350381	350386	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_011205	TAT	2	6	350407	350412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_011205	TTTG	2	8	350428	350435	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_011205	GTTT	2	8	350480	350487	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_011205	ATTT	2	8	350566	350573	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_011205	T	6	6	350571	350576	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_011205	TGC	2	6	351438	351443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1075	NC_011205	TCC	2	6	351452	351457	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1076	NC_011205	CAT	2	6	351460	351465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1077	NC_011205	CGG	2	6	351466	351471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1078	NC_011205	ATG	2	6	351497	351502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_011205	GCA	2	6	351572	351577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1080	NC_011205	GTT	3	9	351655	351663	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_011205	ATT	2	6	351672	351677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_011205	GAG	2	6	351741	351746	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_011205	TCTGT	2	10	351792	351801	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
1084	NC_011205	TCC	2	6	351803	351808	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1085	NC_011205	AAT	2	6	351818	351823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_011205	AAT	2	6	351852	351857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_011205	GATG	2	8	352078	352085	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_011205	T	6	6	352128	352133	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_011205	GAT	2	6	352139	352144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_011205	CA	3	6	352161	352166	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1091	NC_011205	ATG	3	9	353222	353230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_011205	GTC	2	6	353269	353274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1093	NC_011205	ATG	2	6	353299	353304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_011205	ATA	2	6	353321	353326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_011205	TCC	2	6	353465	353470	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1096	NC_011205	A	6	6	354319	354324	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_011205	A	6	6	354361	354366	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_011205	AGATGA	2	12	354502	354513	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_011205	TTA	2	6	355010	355015	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_011205	TAC	2	6	355108	355113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1101	NC_011205	GC	3	6	355132	355137	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1102	NC_011205	TGG	2	6	355172	355177	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_011205	TGCC	2	8	355202	355209	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1104	NC_011205	CGC	2	6	355262	355267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1105	NC_011205	CTC	2	6	356061	356066	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1106	NC_011205	AAT	2	6	356099	356104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_011205	A	6	6	356105	356110	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_011205	ATC	2	6	356233	356238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1109	NC_011205	GGC	2	6	356256	356261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1110	NC_011205	GGC	2	6	356284	356289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1111	NC_011205	GC	3	6	356326	356331	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1112	NC_011205	TGG	2	6	356387	356392	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_011205	CTT	2	6	356424	356429	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1114	NC_011205	ACCG	2	8	356437	356444	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1115	NC_011205	CGG	2	6	356454	356459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1116	NC_011205	ATC	2	6	356579	356584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1117	NC_011205	ACG	2	6	356603	356608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1118	NC_011205	GCA	2	6	356625	356630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1119	NC_011205	GGC	2	6	356706	356711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1120	NC_011205	TCG	3	9	356714	356722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1121	NC_011205	CG	3	6	356777	356782	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1122	NC_011205	GCC	2	6	356809	356814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1123	NC_011205	CAG	2	6	356839	356844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1124	NC_011205	TAA	2	6	356879	356884	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_011205	TTG	2	6	356960	356965	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_011205	ACA	2	6	356988	356993	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1127	NC_011205	CAT	2	6	357012	357017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1128	NC_011205	CTGCG	2	10	357022	357031	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1129	NC_011205	ATC	2	6	357083	357088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1130	NC_011205	GC	3	6	357135	357140	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1131	NC_011205	CTG	2	6	357223	357228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1132	NC_011205	GGTG	2	8	357234	357241	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_011205	CCG	2	6	357270	357275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1134	NC_011205	GCG	2	6	357314	357319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1135	NC_011205	CATC	2	8	357321	357328	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1407	NC_011205	TGA	2	6	431604	431609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1408	NC_011205	GTT	2	6	431644	431649	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1409	NC_011205	TGGCG	2	10	431718	431727	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
1410	NC_011205	A	6	6	431728	431733	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1411	NC_011205	AATT	2	8	431747	431754	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1412	NC_011205	TCA	3	9	431785	431793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1421	NC_011205	GGT	2	6	433345	433350	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1429	NC_011205	TTG	2	6	436581	436586	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1442	NC_011205	TGG	2	6	439424	439429	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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