MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853 chromosome

Total Repeats: 16792

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_011205	ATT	2	6	2883695	2883700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10002	NC_011205	AAAG	2	8	2883727	2883734	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
10003	NC_011205	CTT	2	6	2885482	2885487	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10004	NC_011205	CAA	2	6	2886353	2886358	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10005	NC_011205	T	7	7	2886385	2886391	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10006	NC_011205	CTT	2	6	2886482	2886487	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10007	NC_011205	AAT	2	6	2886532	2886537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10008	NC_011205	CA	3	6	2886549	2886554	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10009	NC_011205	T	6	6	2886996	2887001	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10010	NC_011205	GTACT	2	10	2887026	2887035	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
10011	NC_011205	TTC	2	6	2887076	2887081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10012	NC_011205	T	6	6	2887088	2887093	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10013	NC_011205	AAG	2	6	2887149	2887154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10014	NC_011205	T	6	6	2887175	2887180	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10015	NC_011205	A	6	6	2887190	2887195	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10016	NC_011205	A	6	6	2889251	2889256	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10017	NC_011205	TCA	2	6	2889286	2889291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10018	NC_011205	AAC	2	6	2890414	2890419	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10019	NC_011205	TCC	2	6	2891531	2891536	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10020	NC_011205	CAT	2	6	2891604	2891609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10021	NC_011205	TCG	2	6	2891616	2891621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10022	NC_011205	ACA	2	6	2891656	2891661	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10023	NC_011205	ATT	2	6	2891817	2891822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10024	NC_011205	AAT	2	6	2891839	2891844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10025	NC_011205	AAT	2	6	2891858	2891863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10026	NC_011205	ACAA	2	8	2891875	2891882	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
10027	NC_011205	TGG	2	6	2891917	2891922	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10028	NC_011205	CGG	2	6	2892492	2892497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10029	NC_011205	TGC	2	6	2892514	2892519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10030	NC_011205	A	7	7	2893752	2893758	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10031	NC_011205	CTT	2	6	2893781	2893786	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10032	NC_011205	TTA	2	6	2895000	2895005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10033	NC_011205	GGT	2	6	2895016	2895021	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10034	NC_011205	ACC	2	6	2895575	2895580	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10035	NC_011205	TG	3	6	2895848	2895853	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10036	NC_011205	AAC	2	6	2895859	2895864	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10037	NC_011205	TAA	2	6	2895949	2895954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10038	NC_011205	CTG	2	6	2895957	2895962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10039	NC_011205	CGG	2	6	2895974	2895979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10040	NC_011205	GC	3	6	2896003	2896008	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10041	NC_011205	TC	3	6	2897454	2897459	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10042	NC_011205	CGC	2	6	2897482	2897487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10043	NC_011205	TGT	2	6	2897536	2897541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10044	NC_011205	A	7	7	2897690	2897696	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10045	NC_011205	GGC	2	6	2897705	2897710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10046	NC_011205	TTCT	2	8	2897720	2897727	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
10047	NC_011205	CGG	2	6	2897781	2897786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10048	NC_011205	CTG	2	6	2897809	2897814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10049	NC_011205	TGA	2	6	2897837	2897842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10050	NC_011205	TGA	2	6	2897852	2897857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10051	NC_011205	GTCGC	2	10	2897863	2897872	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
10052	NC_011205	GGCT	2	8	2897881	2897888	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10053	NC_011205	AT	3	6	2897955	2897960	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10054	NC_011205	ATG	2	6	2897986	2897991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10055	NC_011205	CGC	2	6	2898036	2898041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10056	NC_011205	GAA	2	6	2898081	2898086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10057	NC_011205	GCC	2	6	2898114	2898119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10058	NC_011205	TGA	2	6	2898122	2898127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10059	NC_011205	CGT	2	6	2898165	2898170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10060	NC_011205	CTG	2	6	2898172	2898177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10061	NC_011205	CT	3	6	2898250	2898255	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10062	NC_011205	CTG	2	6	2898283	2898288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10063	NC_011205	CGG	2	6	2898319	2898324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10064	NC_011205	TAAGC	2	10	2898401	2898410	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
10065	NC_011205	CCA	3	9	2898441	2898449	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10066	NC_011205	ATC	2	6	2898467	2898472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10067	NC_011205	T	6	6	2899739	2899744	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10068	NC_011205	A	6	6	2902093	2902098	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10069	NC_011205	T	6	6	2903817	2903822	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10070	NC_011205	CAA	2	6	2903845	2903850	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10071	NC_011205	TGA	2	6	2903887	2903892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10072	NC_011205	TAT	2	6	2903899	2903904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10073	NC_011205	TGA	2	6	2904317	2904322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10074	NC_011205	TCA	2	6	2904331	2904336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10075	NC_011205	A	8	8	2905236	2905243	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10076	NC_011205	AGAT	2	8	2905298	2905305	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10077	NC_011205	TCA	2	6	2905315	2905320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10078	NC_011205	T	6	6	2905862	2905867	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10079	NC_011205	CATG	2	8	2905910	2905917	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10080	NC_011205	AT	3	6	2905926	2905931	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10081	NC_011205	AATA	2	8	2905959	2905966	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10082	NC_011205	CAA	2	6	2905970	2905975	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10083	NC_011205	AT	3	6	2905978	2905983	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10084	NC_011205	A	6	6	2905993	2905998	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10085	NC_011205	GTT	2	6	2906157	2906162	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10086	NC_011205	T	7	7	2906250	2906256	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10087	NC_011205	ATC	2	6	2906265	2906270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10089	NC_011205	ATT	2	6	2906308	2906313	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10090	NC_011205	A	6	6	2906347	2906352	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10091	NC_011205	TC	3	6	2906374	2906379	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10092	NC_011205	ATG	2	6	2906380	2906385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10094	NC_011205	TTAA	2	8	2906431	2906438	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10095	NC_011205	A	6	6	2917691	2917696	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10096	NC_011205	ACG	2	6	2917709	2917714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10097	NC_011205	CAA	2	6	2917722	2917727	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10098	NC_011205	CGC	2	6	2919168	2919173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10099	NC_011205	AGA	2	6	2919183	2919188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10100	NC_011205	GC	4	8	2919201	2919208	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10101	NC_011205	CG	3	6	2919336	2919341	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10102	NC_011205	GTTG	2	8	2919408	2919415	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10103	NC_011205	GAA	2	6	2919490	2919495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10104	NC_011205	CGC	2	6	2919673	2919678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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10106	NC_011205	GAT	2	6	2919982	2919987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10107	NC_011205	CTTT	2	8	2920023	2920030	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
10108	NC_011205	ATT	2	6	2920055	2920060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10109	NC_011205	GGC	2	6	2920090	2920095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10110	NC_011205	CTG	2	6	2920097	2920102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10111	NC_011205	A	8	8	2920128	2920135	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10112	NC_011205	GCC	2	6	2920157	2920162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10113	NC_011205	GGA	2	6	2920213	2920218	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10114	NC_011205	CAG	2	6	2920253	2920258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10115	NC_011205	GC	3	6	2920380	2920385	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10116	NC_011205	CGC	2	6	2920426	2920431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10117	NC_011205	GAT	2	6	2920450	2920455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10118	NC_011205	GCG	2	6	2920476	2920481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10119	NC_011205	GC	3	6	2920487	2920492	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10120	NC_011205	GCA	2	6	2920495	2920500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10121	NC_011205	GCG	2	6	2920508	2920513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10122	NC_011205	ACA	2	6	2920527	2920532	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10123	NC_011205	TCC	2	6	2920587	2920592	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10124	NC_011205	ACG	2	6	2920635	2920640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10125	NC_011205	GGCG	2	8	2920747	2920754	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
10126	NC_011205	GAT	2	6	2920762	2920767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10127	NC_011205	CGC	2	6	2920826	2920831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10128	NC_011205	CG	3	6	2920855	2920860	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10129	NC_011205	TTC	2	6	2920865	2920870	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10130	NC_011205	GA	3	6	2920881	2920886	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10131	NC_011205	GC	3	6	2920899	2920904	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10132	NC_011205	GCG	3	9	2920947	2920955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10133	NC_011205	GGC	2	6	2920968	2920973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10134	NC_011205	ATC	2	6	2920989	2920994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10135	NC_011205	TGC	3	9	2921058	2921066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10136	NC_011205	TGA	2	6	2921089	2921094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10137	NC_011205	GTC	2	6	2921174	2921179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10138	NC_011205	AAG	2	6	2921232	2921237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10139	NC_011205	GATG	2	8	2921248	2921255	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
10140	NC_011205	CGGAT	2	10	2921280	2921289	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
10141	NC_011205	AAG	2	6	2922519	2922524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10142	NC_011205	CTTAC	2	10	2922563	2922572	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
10143	NC_011205	A	7	7	2922656	2922662	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10144	NC_011205	ACG	2	6	2922672	2922677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10145	NC_011205	AGC	2	6	2922691	2922696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10146	NC_011205	TAA	2	6	2922698	2922703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10147	NC_011205	CT	3	6	2922717	2922722	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10148	NC_011205	AG	3	6	2922753	2922758	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10149	NC_011205	CCTG	2	8	2922788	2922795	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10150	NC_011205	GTCC	2	8	2922840	2922847	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10151	NC_011205	GACT	2	8	2922870	2922877	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10152	NC_011205	GTA	2	6	2922884	2922889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10153	NC_011205	CCA	2	6	2922935	2922940	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10154	NC_011205	AACG	2	8	2923157	2923164	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10155	NC_011205	GCT	2	6	2923229	2923234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10161	NC_011205	CGCCA	2	10	2927764	2927773	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
10162	NC_011205	TCAG	2	8	2927779	2927786	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10163	NC_011205	GATG	2	8	2927802	2927809	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
10164	NC_011205	TGG	2	6	2927825	2927830	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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10166	NC_011205	TC	3	6	2929920	2929925	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10167	NC_011205	ACGC	2	8	2929959	2929966	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10168	NC_011205	GTAT	2	8	2934728	2934735	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10169	NC_011205	CA	3	6	2934743	2934748	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10170	NC_011205	AAT	2	6	2936561	2936566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10174	NC_011205	CA	3	6	2941569	2941574	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10175	NC_011205	TTCA	2	8	2941595	2941602	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10176	NC_011205	TAA	2	6	2946417	2946422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10181	NC_011205	GCACA	2	10	2946756	2946765	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
10182	NC_011205	AT	3	6	2947696	2947701	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10185	NC_011205	TTAA	2	8	2947734	2947741	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10186	NC_011205	ATA	2	6	2947742	2947747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10187	NC_011205	TGA	2	6	2947963	2947968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10229	NC_011205	CT	3	6	2956362	2956367	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10230	NC_011205	TAG	2	6	2956519	2956524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10238	NC_011205	TTCC	2	8	2957008	2957015	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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10241	NC_011205	AAATC	2	10	2957195	2957204	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
10242	NC_011205	CGA	2	6	2958126	2958131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10243	NC_011205	G	6	6	2958160	2958165	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
10244	NC_011205	CAA	2	6	2958231	2958236	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10245	NC_011205	TATC	2	8	2958273	2958280	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10246	NC_011205	TATC	2	8	2958282	2958289	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10247	NC_011205	CT	3	6	2958359	2958364	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10248	NC_011205	ACA	2	6	2958398	2958403	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10249	NC_011205	AAT	2	6	2958454	2958459	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10251	NC_011205	A	6	6	2958533	2958538	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10252	NC_011205	CAA	2	6	2958549	2958554	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10253	NC_011205	ACC	2	6	2958560	2958565	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10254	NC_011205	CCA	2	6	2958570	2958575	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10255	NC_011205	TGT	2	6	2958632	2958637	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10256	NC_011205	TTA	2	6	2958695	2958700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10257	NC_011205	CAA	2	6	2958753	2958758	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10259	NC_011205	GCC	2	6	2959566	2959571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10260	NC_011205	TAA	2	6	2959582	2959587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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